Практикум 11. Гомология и выравнивание. Домены. JalView

Белки, подобные ERG2 и Сигма-1 рецепторам (ERG2 and Sigma1 receptor like protein)

Я выбрала следующий домен: PF04622, ERG2 and Sigma1 receptor like protein (ERG2_Sigma1R), более подробную информацию можно найти в таблице 1.

Это семейство содержит две большие группы: С-8-стерол изомеразы грибов и Сигма-1 рецептора млекопитающих.

С-8-стерол изомераза катализирует реакцию биосинтеза эргостерола, крайне важного вещества, которое содержится в клеточных мембранах грибов и простейших и выполняет многие функции холестерина в клетках животных. Так как он всегда содержится в клетках грибов, ферменты синтеза эргостерола используют в качестве мишений для различных лекарств

Рецептор Сигма-1 млекопитающих распологается в ЭПР и взаимодействует с эндогенными стероидными гормонами, например с прогестероном и тестостероном. Это белок-шаперон, он особенно сконцентрирован в определенных областях ЦНС.

Довольно интересно, что это семейство белков не встречается у архей. Большинство из последовательностей являются белками эукариот, незначительная часть из них - это белки бактерий, также найдена одна последовательность с неопределенной классификацией.

Таблица 1. Основная информация о домене ERG2_Sigma1R
Характеристика Информация
AC PFAM PF04622
ID PFAM 76
#seed 102
#all 3388
#SW 21
#architectures 35
#3D 19
Taxonomy 3388
#eukaryota 3310
#bacteria 77
#archaea 0
#other 1