Практикум 11. Гомология и выравнивание. Домены. JalView
Белки, подобные ERG2 и Сигма-1 рецепторам (ERG2 and Sigma1 receptor like protein)
Я выбрала следующий домен: PF04622, ERG2 and Sigma1 receptor like protein (ERG2_Sigma1R), более подробную информацию можно найти в таблице 1.
Это семейство содержит две большие группы: С-8-стерол изомеразы грибов и Сигма-1 рецептора млекопитающих.
С-8-стерол изомераза катализирует реакцию биосинтеза эргостерола, крайне важного вещества, которое содержится в клеточных мембранах грибов и простейших и выполняет многие функции холестерина в клетках животных. Так как он всегда содержится в клетках грибов, ферменты синтеза эргостерола используют в качестве мишений для различных лекарств
Рецептор Сигма-1 млекопитающих распологается в ЭПР и взаимодействует с эндогенными стероидными гормонами, например с прогестероном и тестостероном. Это белок-шаперон, он особенно сконцентрирован в определенных областях ЦНС.
Довольно интересно, что это семейство белков не встречается у архей. Большинство из последовательностей являются белками эукариот, незначительная часть из них - это белки бактерий, также найдена одна последовательность с неопределенной классификацией.
| Характеристика | Информация |
|---|---|
| AC PFAM | PF04622 |
| ID PFAM | 76 |
| #seed | 102 |
| #all | 3388 |
| #SW | 21 |
| #architectures | 35 |
| #3D | 19 |
| Taxonomy | 3388 |
| #eukaryota | 3310 |
| #bacteria | 77 |
| #archaea | 0 |
| #other | 1 |