JAB1/MPN домен-содержащий белок Archaeoglobus fulgidus (1OI0)

Общая структура

Данная макромолекула представлена белком, который состоит из 4 полимерных цепей (A, B, C, D), которые полностью идентичны (раздел SEQRES в PDB-файле). В биологическую единицу входит 1 цепь (белок мономерный, это отображается в PDB-файле, раздел REMARK 350).

Рисунок 1. Пространственная структура JAB1/MPN домен-содержащего белка Archaeoglobus fulgidus (1OI0)
Рисунок 2. Общий вид структуры биологической единицы

Структура отдельных цепей

Полимерные цепи идентичны, поэтому охарактеризуем их все сразу.

Данная макромолекула относится к Archaeoglobus fulgidus.

Её Uniprot ID: O28085; название - MPN domain-containing protein, функция не прописана (предположительно она не известна точно);

Мутации отсутствуют по сравнению с базой в Uniprot.

Модифицированных аминокислотных остатков нет, но есть 1 дисульфидный мостик в каждой цепи.

Вторичная структура

Рисунок 3. Вторичная структура белка с преобладанием тяжей

Малые молекулы

1. Молекулы воды: H2O, HOH;

2. Ионы цинка: Zinc ion, Zn2+ (ZN, 4 на биологическую единицу);

3. Лиганд: Trys-hydroxymethyl-methyl-ammonium, 144 (2 на биологическую единицу);

Прилагаю ссылку на отчет о малых молекулах.

Рисунок 4. Белковое окружение лиганда на расстоянии до 5 ангстрем