Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information Results in TSV Format Results in GFF3 Format



FIMO - Motif search tool

FIMO version 5.1.1, (Release date: Wed Jan 29 15:00:42 2020 -0800)

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Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE 26.fasta
Database contains 1 sequences, 21000 residues

MOTIFS prodoric.meme (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
MX000001 15 GTTGATCTTATCAAC
MX000002 14 TTGACCTGCATCAA
MX000003 7 TACCCAT
MX000004 14 TTGATTTATATCAA
MX000005 16 TGTGAAATACTTCACA
MX000006 10 TGAACAAGCG
MX000007 17 TGTCGCGTCGCTGCAAG
MX000008 20 TATGTTCGATAACGCACATT
MX000009 21 ATTTTGTTAAATTTTTTTTAA
MX000010 8 CAATGGAT
MX000011 16 CTGCAAGATCTGGTAG
MX000012 16 CTATCAGATCTGGTAG
MX000013 19 GATAATGATTATCATTATC
MX000014 27 AAACGAATCATTTAATATTGATTAAAT
MX000015 8 CAAAAAAT
MX000016 23 TATTATTTTATTTTAATAAAAAT
MX000017 17 AGTCAATTATAGTCAAA
MX000018 18 AGTCAAAATTAGTCAAAG
MX000019 12 TTTGTCGAAAAA
MX000020 16 ATTTGTACGTACTTAT
MX000021 7 TGTCGAA
MX000022 8 TGAAAGCG
MX000023 13 AAAATAAGATTTT
MX000024 15 ATAAGAATAACTTAT
MX000025 14 CGAACATATGTTCG
MX000026 17 TGTTAGAAAATATAACA
MX000027 17 TGTTATATATTTTTACA
MX000028 14 AAATCAATAAATTA
MX000029 15 GATTAAAAATTAAAC
MX000030 19 AGATTTTCTAGTTCTTCAG
MX000031 17 TGTTTATGGTTTGTTTA
MX000032 9 GGTAAATTT
MX000033 31 TGGAACTTTTCCACGCGCCGCGGTTCCAATT
MX000034 32 TGGAACTTTGCGGGCAAAAAGAGGTTCCAATC
MX000035 10 TGGAACTTTT
MX000036 9 GTTCCAATC
MX000037 31 CGGAACTTTACGATATAAAAACAATCTAACG
MX000038 11 TTATATTAAAA
MX000039 17 TTTTTTCCAAAAATCAT
MX000041 16 TTATTTTTAAAAAAAC
MX000042 15 GCGGCGTTGTGTCGC
MX000043 16 ATGAATTTTTATTCAT
MX000044 25 GAAAAAAAACAAAACGGTTTTTAAA
MX000045 65 TTTTTTTTTTTTAAAATGAAAGGTTTTTTTATAATTTATATTAAAATCATTTTTTAATTATATTT
MX000046 20 TTTCGGCATCACGCAAGAAA
MX000047 12 ATATAGGCCATT
MX000048 15 ATCTCAATTTGATAT
MX000049 15 ATTTAAAATTAAGAT
MX000050 19 TTTTATATTATAATATTTT
MX000052 13 AAGTGTTTTAAAA
MX000053 29 GGTTTTGCCTGCTTTATCAGTAACAATCC
MX000054 20 TATTTTGCATTAAGGAAACT
MX000055 22 GACTCTACCGTAGCATGATTTC
MX000056 56 CTAAGTTTTTTTTTTTTATTTCTATGCTATCCTATTCTATAATTTTTGTCATTCTA
MX000057 31 TGTATTATATTTTAAATTTCTTTTTTAATCA
MX000058 11 ATACTTTGTTT
MX000059 20 ATTAAATACGAACATTAATT
MX000060 14 TTAACATTTGTTAA
MX000061 19 CTTTTAAGCATTCCAGAGA
MX000062 21 TACGCAAATTTATTTTGCATT
MX000063 21 ATTTTTTTTATTATTTAGTTA
MX000064 12 AATGTTTTATTA
MX000065 43 TTCCTCGAAATGAACGAAGTATTCTACCGATAAAAACATTTAT
MX000066 11 AGTCATATTTG
MX000067 12 TGCATACAATTA
MX000068 37 AAAGTCATATTTGCCCTAATCTACGCATACAATGATA
MX000069 36 TTTGTCATAACTGTTGATTATGTGCATATACTTGTA
MX000070 37 TTATAATATTTGTACGATATATATGCATATTTTAATA
MX000071 12 AGGGGAAAAAAA
MX000072 33 ATAGTTTTACAAATATACGCTAAAGGGAAAAAG
MX000073 32 AAGGTTTTATTATTATTAAAAAGGGGTAAAAA
MX000074 31 CAGGTTTTTTTTTTTCCAAATCGGGAATAAT
MX000075 30 TATGTTTAGCTTTTTTCAGTAGGGAAAATT
MX000076 12 AAAGGATTTAAA
MX000077 10 ATCGAATTAT
MX000078 53 TTTAAACAACAAAAATTATTGATTTGGCACGATTCTTGCATTTTTATTAATTG
MX000079 32 TATGAAACCTTTTTCCATTTTAATCGTATAAA
MX000080 12 ATATGAAACCTT
MX000081 10 ATTCGTATAA
MX000082 33 TTTGAAACTTTTTCCAATTCATATTCGTCTAAT
MX000083 12 AATGAAACTTTT
MX000084 12 ATACGTCTAACA
MX000085 33 AATGAAACTTTTTTTTATTCTTATCCGTCTAAC
MX000086 20 GTTTTGTCGAATGTAAACAT
MX000087 14 GTTGTATATACAAG
MX000088 23 TTTTTGATACATTATGTATCAAA
MX000089 23 GTTTGTTTATCAAACAAACTAAC
MX000090 19 AAATCGTTATCATTTTATT
MX000091 10 TGTTAATTAA
MX000092 46 TATTTTCAATATTGGTGATGAATTTAACAATATTGAAAATTTGTTT
MX000093 20 ATTGTGATCTAGATCACATT
MX000094 31 TTATGGATATGGAAAATCTTTATTCATTAAT
MX000095 17 GGTGCACCTGGTGCACA
MX000096 14 CAGTATTTTATTCT
MX000097 6 CGAAAT
MX000098 9 TTATCCACA
MX000099 16 TGTCATAAATCTGTCA
MX000100 49 TTTTAATTAAAGCAAATTAAAAATTGGCACAAAATTTGCATTAAGTTGT
MX000101 20 CTCTACCGTTCGTCTGTAAG
MX000102 14 TTGACTTTCATCAA
MX000103 39 CGGTTTTTTCTAAAAAAAAAGGACCCTTTTTGAAAATCC
MX000104 11 CGTCGGTTTAT
MX000105 20 ACCCTTCGAAATTGAAAAAG
MX000106 7 TACCTCT
MX000107 37 ATTGATTTTGATAATTTGAGTGATGAGGTTTTTCAAT
MX000108 18 CGTAAAGAATATTTTACA
MX000109 23 TTTCGTAATTTTTTCTGTTTGTT
MX000110 19 TGTGATTTAGTTCACATTT
MX000111 46 GCATTTCGCCGTTCTTCGCCCTGGCACGACACTTGCTATTATCTGG
MX000114 18 ATAAGAATTTTATAGCAA
MX000115 29 TATCCATAATAATAGCGGAAAAGTCCATA
MX000116 14 TGAATAAAAATTCA
MX000117 5 CCAAT
MX000118 54 CCTATAAGTAAATCCAATGGAACTCATCATAAATGAGACTTTTACCTTATGACA
MX000119 16 AGTAAAACAATGTAAA
MX000121 12 TGCAAATTTGGT
MX000123 16 TGTTAGAATTCTAACA
MX000124 17 AGCTGGTCCGACCTGTT
MX000125 14 GCTGAATCGTTTAA
MX000126 17 TTAATCTCAAAATTAGT
MX000127 7 TTTTCGT
MX000128 19 GATAATGATAATGATTATC
MX000129 13 TGTAAACGGTTAC
MX000130 14 TGTAACCGTTTTCA
MX000132 27 TAAAGTTTCGCCTTTTCTTGCCGATAA
MX000133 16 ATGTTACCCATAACAA
MX000134 12 AGATAATTTAAT
MX000135 18 TTAGGATATTTTTTTTAT
MX000136 27 ATATTTCAATTTTTGCAATATATTTTT
MX000137 21 AATTGTGAGCGAATAACAATT
MX000138 14 GATAAAACGTTTTA
MX000139 6 GGAGGA
MX000140 16 CTGTATATATATACAG
MX000141 10 TGTAACATCT
MX000142 10 TTTACTTTTT
MX000143 5 CTAAT
MX000144 23 TTTTATTGCCCTGGCAAGTATTT
MX000145 16 AGACGTCTAAACGTCT
MX000146 16 AGACGTCTAGACGTCC
MX000147 16 AGACGTCTAGATGGCT
MX000148 23 CGCTATATACATGCCTATATAAC
MX000149 11 ATCATAAATTC
MX000150 23 GTTTTTTTATTTATCGAAAAATA
MX000151 11 TCGTAAAAAAC
MX000152 6 TGGCGC
MX000153 7 TAAAAAT
MX000154 34 TTTTTTAATCTATTTTTTCAATAGGTATTATCAA
MX000155 46 ACGATAGGTAATAGCTATAGATATAATAGGTTTCCCCGATTATCCG
MX000156 14 TAATACAAATTTAA
MX000157 6 TCAATT
MX000158 7 TGAAAAA
MX000159 10 GCAAACGTTT
MX000160 14 TAAGAATATTCCTA
MX000161 23 GTTAGTTCGCGGCGCGAAATAAG
MX000162 21 TTATTTCGAGCCGCGAAATAA
MX000163 25 ACGCGCAGAATTTTCTGCTGTACAC
MX000164 25 CTCTAACAGTATATTCTGCTGTGGC
MX000165 20 ATGGCACTATTTGTTAAATT
MX000166 15 TTGAAGATTCATCTG
MX000167 20 AGAAATAAACTATATTTCAG
MX000168 21 AGAAACAGATAGATTTTTTAG
MX000169 7 TACGTTT
MX000170 20 ATGGCACATTTTGTTAAAAA
MX000171 49 TTATTTCCGTGATTGCCAATAAATCATTTTCGTGTGAATAAGGAGAAAG
MX000172 51 ATCTTGAAAAATCGACGTTTTTTACGTGGTTTTCCGTCGAAAATTTAAGGT
MX000173 19 TCCTCAAGTTAACTTGAGG
MX000174 20 ATGGCACTATATGTTAAATA
MX000175 30 TTTTTTAATTATAATAGGAAATATTTCTCT
MX000176 22 TTTGTGAATTATTGAGCAAATT
MX000177 14 TGGTTTCGTTAACG
MX000178 8 CTGTTCAT
MX000179 13 CCAATACAGTTTT
MX000180 56 ATAAACGAGTAAAAATGACTCGCCTGCTGCGGGTAGCGAGTCATTTTTACTCATTG
MX000181 22 TTTGTGATATTTATTTCACAAA
MX000182 18 TGTAAATTTATATTTACA
MX000183 20 TGTACTAGTTAACTAGTACA
MX000184 35 GTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTT
MX000185 33 AAAAATCTAAAATTGTATTTGAAATATAATAAT
MX000186 14 GGCCATTACCCAAC
MX000188 16 AATTATAATTTTAATT
MX000190 14 TTGATGCATGTCAA
MX000191 19 TGTCAAGGAAATTTGACAT
MX000192 12 TTGCGGCAGCAC
MX000193 18 TTTGAAACCGTTTTCAAA
MX000194 15 TTGAAGCGTTTTCAT
MX000195 20 ATGAATGACTATTCATTCAT
MX000196 6 ATTGAC
MX000197 7 TTAGGAA
MX000198 24 TAATACATATTAAAATTATAGGAA
MX000199 9 TATTTTAAT
MX000200 18 TTTCCAGGAATATGAGAA
MX000201 9 TGTATTATT
MX000202 5 TTATA
MX000203 14 GGACTAAGGCCCCT
MX000204 6 TGATTC
MX000205 12 CCTTAATTATAA
MX000207 16 TAGACAGCGTGGTCTA
MX000208 16 TGCGGCAATCGGTCAC
MX000209 14 GTAATTATATATAC
MX000210 14 GTAACAACTGCTAC
MX000211 7 TGAAATT

Random model letter frequencies (--nrdb--):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
MX000045 CodY strain + 877 941 1.62e-09 3.8e-05 TGATTATCTTGAAAAATGTCAGCAAGATTTAAATGACAGAATAAAAAATATTTCTAATGATAAAA
MX000041 CovR strain - 20881 20896 3.6e-08 0.00108 CTATTTTTTAAAAAAA
MX000027 GlnR strain + 802 818 1.07e-07 0.00325 TGATAAAAATGTTTACA
MX000083 SigX strain - 17431 17442 1.24e-07 0.00432 AATGAAACTTTT
MX000012 LasR strain - 6366 6381 1.75e-07 0.00695 CTGCCTTTTCTGCCAG
MX000041 CovR strain - 20880 20895 1.89e-07 0.00284 TATTTTTTAAAAAAAA
MX000188 SarA strain - 2494 2509 1.99e-07 0.0049 AATTATATTTTTAACT
MX000118 CynR strain + 12381 12434 2e-07 0.00665 CAGATGAGTTTATACAATGGAAAGCAGAGAAAATAGCACTTGTAGCTGATAGGG
MX000045 CodY strain + 2392 2456 2.44e-07 0.00286 ATTTGATTATGAAAAAGCAAAGCCATTATTAATTTATAAGATGCGATTTTCATATCCAGTTAATG
MX000154 OxyR strain - 20178 20211 3.67e-07 0.00611 AAATTTATTCTATCTTTTAAATCGGAATTTTCCT
MX000065 SigD strain + 9777 9819 3.95e-07 0.0136 TTCCTGAAGGAGAGCGCCGTGTAGAATTTATAAATTCTATCAT
MX000045 CodY strain - 1850 1914 4.02e-07 0.00314 TTTTTATTTTTTAAACCAGCCAATAGATGCATCATGAATACTGTCTATATCTGTTGAATAAGGCT
MX000154 OxyR strain + 18276 18309 4.38e-07 0.00611 ATATTGCTATTATTAATATGATAGATATGTATAA
MX000016 Fur strain - 19610 19632 4.42e-07 0.0122 AATTATCCGGTACTACTAAAAAT
MX000076 SigH strain + 3380 3391 4.51e-07 0.0163 GAAGGATTTAAA
MX000009 ResD strain - 19104 19124 4.56e-07 0.0129 TAATTCTTTCATTTTTTTAAA
MX000073 SigB strain + 17432 17463 4.89e-07 0.0173 AAAGTTTCATTTAATGCAATAACAGGAAAAGA
MX000069 SigE strain + 2129 2164 6.09e-07 0.0197 TTTGTCATAAATATACCAACAGCTGATATGATAGAA
MX000123 DeoR strain + 19835 19850 6.8e-07 0.0238 TGTTATAATAGTAACA
MX000074 SigB strain + 17244 17274 7.25e-07 0.0143 GCCTTTATTTTTTTTAAAATTGTGGTAGAAT
MX000188 SarA strain + 18340 18355 7.83e-07 0.00547 AAATTTAATTTTAAAT
MX000071 SigB strain + 16602 16613 7.93e-07 0.0175 AAGGGAAAAAAA
MX000080 SigW strain + 3857 3868 8.02e-07 0.0263 ATATGAAACATT
MX000044 CitT strain + 8449 8473 8.25e-07 0.031 CGATAAAAAAGAAACGGCTTGTAAA
MX000020 AraR strain - 9634 9649 8.46e-07 0.0264 ATTTGTACGTTTTATT
MX000074 SigB strain + 9978 10008 8.51e-07 0.0143 CCTTTTTAGCTCATCTTATTGAGGGTATAGA
MX000094 CysB strain - 16868 16898 8.51e-07 0.0244 CTTGCGTTTTTAATAACCTCTAACCCTTTAT
MX000071 SigB strain + 19276 19287 8.76e-07 0.0175 AGGGGAATTAAA
MX000045 CodY strain + 2707 2771 9.5e-07 0.00486 TTATGCTATTATATTTTAAAAGATAGTATCAATATATTATCTGAAAATAAATTTTACGGAGGGAT
MX000072 SigB strain + 19028 19060 9.7e-07 0.0272 AAGGTTTAAAAATATAAGAATAAAAGGATTAAT
MX000128 Fur strain - 2360 2378 9.9e-07 0.0287 TAAAATAAGAATCATTTTC
MX000188 SarA strain - 6993 7008 1e-06 0.00547 ATTTATATTTTTTAGT
MX000188 SarA strain + 12770 12785 1.03e-06 0.00547 ATTTATATTATTAATA
MX000057 PhoP strain + 6224 6254 1.05e-06 0.0116 TTTTTTAAACCATTTAGTACTTAAAGAAGGA
MX000134 IciA strain + 12268 12279 1.1e-06 0.0396 AGATAATTTAAA
MX000188 SarA strain - 17177 17192 1.11e-06 0.00547 ATATATAATATTAATT
MX000045 CodY strain - 18122 18186 1.14e-06 0.00486 TCTTTTATTAATTTATAATCATCTTTATTTATCGGAATAGCTAAATACCATTTTGAATTATCTAT
MX000013 Fur strain - 2360 2378 1.17e-06 0.0266 TAAAATAAGAATCATTTTC
MX000184 YiaJ strain + 5784 5818 1.17e-06 0.0375 ATTAAAAAGAGATTTAAATTTAAAAAATAAAAATT
MX000126 FlhD2C2 strain - 20958 20974 1.18e-06 0.0496 CTAACCGGAAGATTCGC
MX000016 Fur strain - 20792 20814 1.22e-06 0.0152 AATTATACAATAATTAACAAAAT
MX000186 AlgZ strain - 72 85 1.25e-06 0.0524 TGCCATAACCCCCG
MX000165 MarA strain - 12704 12723 1.25e-06 0.0411 ATAGCACTATCTCTTAATTT
MX000057 PhoP strain - 18153 18183 1.35e-06 0.0116 TTTATTAATTTATAATCATCTTTATTTATCG
MX000050 Hpr strain + 1224 1242 1.38e-06 0.0374 TTAATTATTATACTACAAA
MX000045 CodY strain - 17369 17433 1.39e-06 0.00486 TTTCCTATATACAATATAACAGCTATTATTAATAAAATTTTGAATATATTTTTTCCCATATAATA
MX000080 SigW strain - 17432 17443 1.4e-06 0.0263 AAATGAAACTTT
MX000176 YdiH strain + 18039 18060 1.43e-06 0.0477 CTTCTGAAATGTTGAGTAAAAT
MX000103 ExsA strain + 17807 17845 1.44e-06 0.0579 GCAGATGAACTTAAAAAGCAAATCGAAGATTTGAAGAAC
MX000209 NtcA strain + 8228 8241 1.45e-06 0.0511 GTAAATAACAATAC
MX000045 CodY strain - 5778 5842 1.45e-06 0.00486 TTTGGCATTTTTATAACCTCCTATAATTTTTATTTTTTAAATTTAAATCTCTTTTTAATATTTTA
MX000023 ComK strain - 20936 20948 1.47e-06 0.0455 AAAATCAGTTTTT
MX000039 RofA strain - 20502 20518 1.5e-06 0.0329 TTCTTCAAAAAATTCAT
MX000013 Fur strain + 2360 2378 1.62e-06 0.0266 GAAAATGATTCTTATTTTA
MX000048 GltC strain + 2507 2521 1.66e-06 0.0486 ATTTAATAAATATAT
MX000057 PhoP strain + 1981 2011 1.67e-06 0.0116 TGTATTAATTTCTACAATAGATAAAAAAGGA
MX000025 DinR/LexA strain - 7459 7472 1.72e-06 0.0668 CGAACCTTTGTTTC
MX000056 MtrB strain - 16401 16456 1.77e-06 0.0611 CTGACCTATTATTAATCCTTGTAAGGCTCCTTCTTCCAGATCCTTTTCTCCTTAAA
MX000053 LicT strain - 11229 11257 1.81e-06 0.0757 GCGGTTTTCTTCATTGAGAATAAAAGTCC
MX000041 CovR strain - 19100 19115 1.82e-06 0.0182 CATTTTTTTAAAATAA
MX000045 CodY strain + 2367 2431 1.82e-06 0.00534 ATTCTTATTTTAATAATAAAGGAGAATTTGATTATGAAAAAGCAAAGCCATTATTAATTTATAAG
MX000064 SigB strain - 14233 14244 1.9e-06 0.0225 AATGTTTTACTT
MX000057 PhoP strain + 2711 2741 1.91e-06 0.0116 GCTATTATATTTTAAAAGATAGTATCAATAT
MX000039 RofA strain - 20876 20892 1.92e-06 0.0329 TTTTTAAAAAAAATAAA
MX000064 SigB strain + 1280 1291 2.02e-06 0.0225 AAGGTTTTATAT
MX000064 SigB strain + 3771 3782 2.02e-06 0.0225 AAGGTTTTATAT
MX000188 SarA strain + 2500 2515 2.07e-06 0.00851 AAATATAATTTAATAA
MX000073 SigB strain + 20872 20903 2.11e-06 0.0373 AAGTTTTATTTTTTTTAAAAAATAGGAGGTAA
MX000011 RhlR strain - 2925 2940 2.16e-06 0.0905 CTGCAAGGTCTGTAAC
MX000090 Zur strain + 4010 4028 2.25e-06 0.0748 AAATTTTTATAATTTTATT
MX000155 OxyR strain - 7120 7165 2.3e-06 0.0734 ACGATATTAAGCAGCAATATTTCCTTGAGGCTTCATTCATTTTCAT
MX000185 XylR strain + 17994 18026 2.31e-06 0.0393 ATAAATATGAAAATCAATTAGACACAAAAAAAA
MX000016 Fur strain - 17250 17272 2.36e-06 0.0152 TCTACCACAATTTTAAAAAAAAT
MX000181 Crp strain - 7959 7980 2.43e-06 0.0544 TGTGTTATATAGCTATAACATT
MX000045 CodY strain + 6694 6758 2.46e-06 0.00557 AATTCTTCATTTAATATGAGGAAAAAAATTCGCACTGAAAAAGAAGATATTGAATTTTGGAATAA
MX000045 CodY strain - 18324 18388 2.46e-06 0.00557 AGATGATTTTGGAACTTCATAACCTGTATAATCATTTAAAATTAAATTTACTTTTACCTTCCGTA
MX000188 SarA strain - 13007 13022 2.51e-06 0.00883 AAATATTAATTTTATA
MX000114 Ada strain + 8142 8159 2.51e-06 0.0542 ATAAAAATTATAGAGAAA
MX000031 PhoP strain + 3695 3711 2.6e-06 0.092 TGTTTATGGATTGTTGC
MX000205 CmeR strain + 2328 2339 2.69e-06 0.0857 CTTTAATTATAA
MX000141 OmpR strain - 11683 11692 2.69e-06 0.0938 TGAAACATCT
MX000080 SigW strain + 13517 13528 2.7e-06 0.0337 GAATGAAACATT
MX000045 CodY strain - 5777 5841 2.72e-06 0.00557 TTGGCATTTTTATAACCTCCTATAATTTTTATTTTTTAAATTTAAATCTCTTTTTAATATTTTAT
MX000135 YhiX strain + 18833 18850 2.79e-06 0.036 TAAGGTTAAATATATTAT
MX000135 YhiX strain - 19481 19498 2.79e-06 0.036 ACCGGCTTTTTATTTTTT
MX000188 SarA strain - 5802 5817 2.88e-06 0.00888 ATTTTTATTTTTTAAA
MX000185 XylR strain - 2678 2710 2.88e-06 0.0393 ATAAATTAAAAATTAAATCAATAGTATACAAAT
MX000038 CovR strain - 10156 10166 2.88e-06 0.0402 TTCCATTAAAA
MX000082 SigW strain + 19973 20005 2.9e-06 0.095 TGTAAAACTTGTGTTAATGTTTATGGGTTAACT
MX000045 CodY strain - 2500 2564 2.98e-06 0.00557 TTTTAGTTAGCAATAATTAAAGTTGATTCAATAATTATAAGCGATATATTTATTAAATTATATTT
MX000057 PhoP strain - 18373 18403 3e-06 0.0146 TTTATTATTTATAACAGATGATTTTGGAACT
MX000030 DegU strain - 11349 11367 3.04e-06 0.112 AGACCTTCAAGCACTTCAG
MX000045 CodY strain - 14161 14225 3.09e-06 0.00557 TTCATTTCACCTCAAATAACCTTTTTTATTCTGATAGAACATACCAATCATAATCATTGATAGAG
MX000016 Fur strain + 1340 1362 3.13e-06 0.0152 TATAAGATGCTTTTAAAGAAACC
MX000066 SigE strain + 4788 4798 3.21e-06 0.105 AGGCATAATTG
MX000016 Fur strain + 789 811 3.31e-06 0.0152 AGTTATCCACATTTGATAAAAAT
MX000016 Fur strain + 18999 19021 3.31e-06 0.0152 GATACGATTGATTTTATTAAAAT
MX000045 CodY strain - 2501 2565 3.36e-06 0.00563 ATTTTAGTTAGCAATAATTAAAGTTGATTCAATAATTATAAGCGATATATTTATTAAATTATATT
MX000188 SarA strain + 17746 17761 3.4e-06 0.0093 AAATTTAATTAAAAAA
MX000089 XylR strain + 12153 12175 3.51e-06 0.0702 GTTTGAATAATAAACAAAATATC
MX000076 SigH strain - 9680 9691 3.54e-06 0.0642 AAAGGAATTATG
MX000070 SigE strain - 9248 9284 3.55e-06 0.125 TAGCTATATATTGATGAGGAGGTGGAATATCAGGGTC
MX000149 Nac strain + 12994 13004 3.59e-06 0.111 ATCAAAAAATC
MX000078 SigL strain + 12158 12210 3.65e-06 0.104 AATAATAAACAAAATATCGGAAAATGGCAAACACCTACTATTGAAAAAATCAT
MX000181 Crp strain - 14464 14485 3.67e-06 0.0544 GTTCTGATAAAGTTTTATCAAT
MX000200 MelR strain - 10150 10167 3.8e-06 0.0786 TTTCCATTAAAACCGGAT
MX000041 CovR strain + 20880 20895 3.83e-06 0.0287 TTTTTTTTAAAAAATA
MX000049 GltR strain + 5990 6004 3.83e-06 0.119 ATCTCAAAGTCTGAT
MX000109 TrpI strain - 11500 11522 3.93e-06 0.152 TTCCCCAAGCTTTGCTTTTACTT
MX000088 Xre strain + 2652 2674 3.98e-06 0.0796 TATTAAAAATAATTTGTATCATA
MX000091 ArcA strain + 20796 20805 4e-06 0.123 TGTTAATTAT
MX000154 OxyR strain + 14158 14191 4.07e-06 0.0366 TTGCTCTATCAATGATTATGATTGGTATGTTCTA
MX000016 Fur strain + 19920 19942 4.25e-06 0.0168 TTTTCGCCGATTTTAGCAATAAT
MX000089 XylR strain - 12149 12171 4.28e-06 0.0702 TTTTGTTTATTATTCAAACCAAT
MX000135 YhiX strain + 3590 3607 4.31e-06 0.037 TCCTGATATTATTTTTAT
MX000092 CaiF strain + 15487 15532 4.33e-06 0.0992 TACCATTGATATAGAAAAGGCAATAAAAAAAGGAGAAAAATCCTTT
MX000188 SarA strain + 17395 17410 4.5e-06 0.0111 AATTTTATTAATAATA
MX000150 NagC strain - 20562 20584 4.7e-06 0.0869 GTTTTTCTATTTTTCACAAGAAT
MX000038 CovR strain + 17749 17759 4.77e-06 0.0402 TTTAATTAAAA
MX000038 CovR strain + 19010 19020 4.77e-06 0.0402 TTTTATTAAAA
MX000038 CovR strain - 19373 19383 4.77e-06 0.0402 TTTTATTAAAA
MX000041 CovR strain + 20877 20892 4.84e-06 0.029 TTATTTTTTTTAAAAA
MX000011 RhlR strain - 6366 6381 4.91e-06 0.103 CTGCCTTTTCTGCCAG
MX000098 DnaA strain + 791 799 4.91e-06 0.202 TTATCCACA
MX000185 XylR strain + 17653 17685 4.91e-06 0.0393 ATTAAAAGAATTAGATGATATAAATAAAAAAAT
MX000019 Spo0A strain - 3201 3212 4.95e-06 0.191 TTTGTCGGAAAA
MX000044 CitT strain + 17563 17587 5.07e-06 0.0951 TGAAATAAAGAAAATGGTTTTAAGC
MX000045 CodY strain + 2481 2545 5.07e-06 0.00745 TATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTATAATTATTGAATCAACTT
MX000045 CodY strain + 17337 17401 5.09e-06 0.00745 ATCTTTTATATAGAATATAAACTTAGGTGGATTATTATATGGGAAAAAATATATTCAAAATTTTA
MX000067 SigE strain - 4054 4065 5.1e-06 0.154 TGCATATACTGA
MX000029 Fis strain + 20276 20290 5.17e-06 0.201 GCTCAAAATACAGCC
MX000198 YrzC strain - 13003 13026 5.21e-06 0.0696 AAACAAATATTAATTTTATACTGA
MX000154 OxyR strain + 2531 2564 5.24e-06 0.0366 TTATTGAATCAACTTTAATTATTGCTAACTAAAA
MX000083 SigX strain + 17531 17542 5.24e-06 0.0842 AATGAAACGATT
MX000099 PhoB strain + 2131 2146 5.27e-06 0.11 TGTCATAAATATACCA
MX000119 CpxR strain + 15885 15900 5.37e-06 0.213 GGCAAAAGATTGTAAA
MX000043 AhrC strain - 19374 19389 5.39e-06 0.0543 TAGTTTTTTTATTAAA
MX000062 RocR strain - 10040 10060 5.39e-06 0.188 TTCACAAATAAATTTTTCTTT
MX000028 IHF strain + 2732 2745 5.44e-06 0.104 GTATCAATATATTA
MX000088 Xre strain + 15148 15170 5.51e-06 0.0796 GAATTTATATAATATGTATTATC
MX000039 RofA strain - 12610 12626 5.54e-06 0.0523 TTTTATCTAAAATCCAT
MX000188 SarA strain + 14142 14157 5.56e-06 0.0125 AATTATATATATTTAT
MX000180 HydG strain - 20490 20545 5.71e-06 0.217 CTATTCTCTTTCATGTGATTCCCCTTCTTCTTCAAAAAATTCATTTTCATCTATTG
MX000057 PhoP strain + 1441 1471 5.75e-06 0.0198 TGTTATTATTTTACTATATTATATTACATGT
MX000151 NhaR strain - 11732 11742 5.78e-06 0.208 TCGGAAAAAAG
MX000184 YiaJ strain + 20417 20451 5.81e-06 0.0928 TTAAAAAAGAAATTGAATATTTTCAAAGCAAAATT
MX000009 ResD strain + 20792 20812 5.81e-06 0.0543 ATTTTGTTAATTATTGTATAA
MX000134 IciA strain + 18124 18135 5.81e-06 0.105 AGATAATTCAAA
MX000031 PhoP strain + 4641 4657 5.87e-06 0.104 TGTTTATTTCATGTTTA
MX000198 YrzC strain - 2684 2707 5.88e-06 0.0696 AATTAAAAATTAAATCAATAGTAT
MX000099 PhoB strain + 5600 5615 5.9e-06 0.11 TGACCTTAATCTGTCA
MX000046 ComA strain - 9177 9196 5.92e-06 0.249 TTTTGGCTGCACGCAAACAT
MX000032 PvdS strain - 118 126 5.98e-06 0.119 GGTAAATTT
MX000032 PvdS strain - 619 627 5.98e-06 0.119 GGTAAATTT
MX000061 PyrR strain + 10602 10620 6.02e-06 0.232 CTTTAAATGAGCCTGAAGA
MX000050 Hpr strain + 1442 1460 6.04e-06 0.068 GTTATTATTTTACTATATT
MX000016 Fur strain + 2642 2664 6.06e-06 0.0186 TGTTTTCAGGTATTAAAAATAAT
MX000016 Fur strain + 2497 2519 6.06e-06 0.0186 TAAAAATATAATTTAATAAATAT
MX000039 RofA strain - 6743 6759 6.09e-06 0.0523 TTTATTCCAAAATTCAA
MX000185 XylR strain + 18074 18106 6.1e-06 0.0393 ATTGAAAAAAATGGCAATTTAAAGCAAAATAAC
MX000043 AhrC strain - 18517 18532 6.13e-06 0.0543 ATACATTTTTATCCCT
MX000060 PrfA strain + 3621 3634 6.15e-06 0.199 TTACCATTAGTTAA
MX000200 MelR strain + 15963 15980 6.17e-06 0.0786 TTTCCCTTGATATGGGAG
MX000190 FNRL strain + 16712 16725 6.24e-06 0.147 TAGATGCATATCAA
MX000116 ArgR strain - 7527 7540 6.27e-06 0.117 TGAATTTTATTTCA
MX000114 Ada strain + 17912 17929 6.31e-06 0.0542 AAAACACTTTTAGAGCAA
MX000144 MarR strain + 13022 13044 6.37e-06 0.204 TGTTTTTGTTCTTGCAAGTATAA
MX000200 MelR strain - 2866 2883 6.41e-06 0.0786 TTTCCTGTTTTTGCTGAA
MX000188 SarA strain - 5800 5815 6.65e-06 0.0125 TTTTATTTTTTAAATT
MX000012 LasR strain - 3538 3553 6.76e-06 0.134 CTACCATTTTTACCAG
MX000057 PhoP strain + 19726 19756 6.79e-06 0.0198 TATTAACTACACTAAATTACTTTTTTGAAGT
MX000198 YrzC strain - 2673 2696 6.8e-06 0.0696 AAATCAATAGTATACAAATAATTA
MX000107 OxyR strain + 1256 1292 6.94e-06 0.125 ATTGCTGATGCTTATTGGACAGGTAAGGTTTTATATC
MX000107 OxyR strain + 5409 5445 6.94e-06 0.125 CGATATTTAGATGAATTAAGCGGTGGGGAACTGCAAA
MX000028 IHF strain + 6586 6599 6.96e-06 0.104 TAATCAATGGATTA
MX000205 CmeR strain - 2377 2388 6.97e-06 0.105 CCTTTATTATTA
MX000071 SigB strain + 11516 11527 7e-06 0.0933 TGGGGAATAAAA
MX000174 SoxS strain - 12704 12723 7.16e-06 0.265 ATAGCACTATCTCTTAATTT
MX000188 SarA strain + 15119 15134 7.17e-06 0.0125 AAAAATATTTATAATA
MX000041 CovR strain - 12892 12907 7.17e-06 0.033 CCATTTTTCAAAATAC
MX000020 AraR strain + 6518 6533 7.18e-06 0.112 AATAGCCCGTACAAAT
MX000123 DeoR strain + 12985 13000 7.19e-06 0.0433 TGTTAAAATATCAAAA
MX000004 Fnr strain + 17991 18004 7.22e-06 0.143 TTGATAAATATGAA
MX000083 SigX strain + 13518 13529 7.23e-06 0.0842 AATGAAACATTA
MX000185 XylR strain - 5353 5385 7.27e-06 0.0393 ATTTTTCTAAAACCCTGTTTACTATATCCATAT
MX000114 Ada strain + 5443 5460 7.39e-06 0.0542 AAAAGGTTGTTATAGCAA
MX000116 ArgR strain + 19396 19409 7.4e-06 0.117 TGAATATACATACA
MX000114 Ada strain + 16580 16597 7.46e-06 0.0542 ACAAGGATATAAGAGAAA
MX000123 DeoR strain - 2810 2825 7.54e-06 0.0433 TGTAAGCAATGCAACA
MX000154 OxyR strain - 18591 18624 7.54e-06 0.0367 TATTTTTTTTTATATCTTCTATATTTTCTAATAT
MX000140 LexA strain + 17784 17799 7.56e-06 0.26 CTGTTAAAAATAACAG
MX000190 FNRL strain - 5151 5164 7.56e-06 0.147 TTGATGCATTTTAA
MX000081 SigW strain - 19228 19237 7.62e-06 0.29 ATACGTATAA
MX000175 SdiA strain - 18269 18298 7.65e-06 0.204 TATCATATTAATAATAGCAATATATGCTTT
MX000188 SarA strain - 17395 17410 7.67e-06 0.0125 TATTATTAATAAAATT
MX000123 DeoR strain + 14466 14481 7.82e-06 0.0433 TGATAAAACTTTATCA
MX000125 FruR strain + 17137 17150 7.85e-06 0.324 GCTGAAACCATAAT
MX000057 PhoP strain - 2717 2747 7.99e-06 0.0198 GATAATATATTGATACTATCTTTTAAAATAT
MX000043 AhrC strain + 7246 7261 8.01e-06 0.0543 ATGATTATTTATCCAT
MX000123 DeoR strain + 2167 2182 8.02e-06 0.0433 TGTTAAAATATCATCT
MX000123 DeoR strain - 20053 20068 8.02e-06 0.0433 TGTTAACATTTTATCC
MX000016 Fur strain + 17661 17683 8.06e-06 0.0223 AATTAGATGATATAAATAAAAAA
MX000188 SarA strain - 4008 4023 8.14e-06 0.0125 AATTATAAAAATTTTT
MX000188 SarA strain - 15119 15134 8.14e-06 0.0125 TATTATAAATATTTTT
MX000050 Hpr strain - 6998 7016 8.17e-06 0.068 TTCAATATATTTATATTTT
MX000041 CovR strain + 2324 2339 8.18e-06 0.033 TATTCTTTAATTATAA
MX000057 PhoP strain - 17325 17355 8.34e-06 0.0198 TATATTCTATATAAAAGATGATTTTCCTTCT
MX000148 ModE strain - 2465 2487 8.34e-06 0.272 AATTATATACTTAAATTCATTAC
MX000150 NagC strain - 17985 18007 8.37e-06 0.0869 ATTTTCATATTTATCAAAGTAAA
MX000004 Fnr strain + 3556 3569 8.4e-06 0.143 TTGATATAGATAAA
MX000154 OxyR strain - 1257 1290 8.61e-06 0.0367 TATAAAACCTTACCTGTCCAATAAGCATCAGCAA
MX000045 CodY strain - 6679 6743 8.63e-06 0.0117 ATATCTTCTTTTTCAGTGCGAATTTTTTTCCTCATATTAAATGAAGAATTCTTGGCATCTTCCCA
MX000123 DeoR strain - 14466 14481 8.66e-06 0.0433 TGATAAAGTTTTATCA
MX000005 Fnr strain - 8122 8137 8.75e-06 0.166 TGAGAAGTACTCCACA
MX000069 SigE strain + 7574 7609 8.82e-06 0.143 ATTATCAATGATATAGCACAAGCTGATATTCTTAAG
MX000199 CovR strain + 2372 2380 8.86e-06 0.0724 TATTTTAAT
MX000199 CovR strain - 6596 6604 8.86e-06 0.0724 TATTTTAAT
MX000199 CovR strain - 20007 20015 8.86e-06 0.0724 TATTTTAAT
MX000074 SigB strain + 6690 6720 8.9e-06 0.1 CAAGAATTCTTCATTTAATATGAGGAAAAAA
MX000082 SigW strain + 4005 4037 8.94e-06 0.14 AAGAAAAATTTTTATAATTTTATTGTGTGCACT
MX000039 RofA strain - 19244 19260 8.98e-06 0.0616 TTTTCCCAAAAATACCT
MX000096 Lrp strain + 11228 11241 9.03e-06 0.179 AGGACTTTTATTCT
MX000045 CodY strain - 666 730 9.05e-06 0.0117 ATTTTTATCTGTTAAATATGCAACAAAAATTACATCAGGTTTAACATCAATAATTTGTTCGGCAT
MX000114 Ada strain - 7809 7826 9.06e-06 0.0542 AAAAGAATATAAGATCAG
MX000154 OxyR strain + 1977 2010 9.19e-06 0.0367 CAGTTGTATTAATTTCTACAATAGATAAAAAAGG
MX000041 CovR strain - 17396 17411 9.24e-06 0.033 CTATTATTAATAAAAT
MX000057 PhoP strain - 5763 5793 9.28e-06 0.0198 TCTTTTTAATATTTTATATCGCTTATAACGG
MX000023 ComK strain + 20936 20948 9.34e-06 0.103 AAAAACTGATTTT
MX000005 Fnr strain + 8122 8137 9.35e-06 0.166 TGTGGAGTACTTCTCA
MX000090 Zur strain - 2358 2376 9.44e-06 0.157 AAATAAGAATCATTTTCTT
MX000073 SigB strain + 19028 19059 9.44e-06 0.0728 AAGGTTTAAAAATATAAGAATAAAAGGATTAA
MX000016 Fur strain - 17637 17659 9.44e-06 0.0235 TTTTAATTTATTTTTATCCAAGT
MX000045 CodY strain - 7595 7659 9.46e-06 0.0117 ACTTTTTTCATTAATTTCCCCCCTATTTTAAGATTATTAGTAAAAACAAACTTAAGAATATCAGC
MX000073 SigB strain + 20875 20906 9.5e-06 0.0728 TTTTATTTTTTTTAAAAAATAGGAGGTAAAAG
MX000043 AhrC strain - 18165 18180 9.73e-06 0.0543 ATTAATTTATAATCAT
MX000205 CmeR strain + 13342 13353 9.83e-06 0.105 CTTTTATTATAA
MX000167 DegU strain - 19357 19376 9.91e-06 0.317 AAAAGGAATGACTCTTTCAG
MX000188 SarA strain - 2506 2521 9.92e-06 0.0144 ATATATTTATTAAATT
MX000181 Crp strain - 19833 19854 9.97e-06 0.0985 GTTCTGTTACTATTATAACAAA
MX000185 XylR strain - 14142 14174 1e-05 0.0393 AATCATTGATAGAGCAAATAAATATATATAATT
MX000008 GlpR strain + 10628 10647 1e-05 0.384 TTTGTTCGAAAACATACCCT
MX000168 DegU strain + 5995 6015 1e-05 0.216 AAAGTCTGATGGATTATTTAG
MX000136 IlvY strain - 18270 18296 1e-05 0.168 TCATATTAATAATAGCAATATATGCTT
MX000023 ComK strain - 17331 17343 1e-05 0.103 AAAAGATGATTTT
MX000048 GltC strain + 19826 19840 1.01e-05 0.106 TTCTAAATTTGTTAT
MX000049 GltR strain + 2588 2602 1.01e-05 0.119 ATTCTAAAATAAGAA
MX000014 OmpR strain + 2673 2699 1.01e-05 0.154 TAATTATTTGTATACTATTGATTTAAT
MX000041 CovR strain - 5638 5653 1.01e-05 0.033 TTATCTTTTAAAAGCA
MX000030 DegU strain - 10128 10146 1.02e-05 0.186 AGAGCATCTATCTCTTTTG
MX000016 Fur strain + 18101 18123 1.02e-05 0.0235 AATAACATGCTTGTTAAAATAAT
MX000044 CitT strain + 16312 16336 1.02e-05 0.12 GAAAGAGAAAATAGCGGTTCTCAGG
MX000073 SigB strain + 6591 6622 1.03e-05 0.0728 AATGGATTAAAATAATAAAAAGGTGGTATATA
MX000043 AhrC strain - 8138 8153 1.04e-05 0.0543 TATAATTTTTATACCA
MX000176 YdiH strain + 2679 2700 1.04e-05 0.173 TTTGTATACTATTGATTTAATT
MX000057 PhoP strain - 5780 5810 1.04e-05 0.0198 TTTTTTAAATTTAAATCTCTTTTTAATATTT
MX000056 MtrB strain - 20511 20566 1.04e-05 0.0889 AGAATACCAACAACAGCAAGTCTATTCTCTTTCATGTGATTCCCCTTCTTCTTCAA
MX000116 ArgR strain + 7527 7540 1.05e-05 0.117 TGAAATAAAATTCA
MX000013 Fur strain + 17699 17717 1.07e-05 0.117 AATAATGCTTCTAATAATC
MX000049 GltR strain - 5705 5719 1.08e-05 0.119 ATCCCATAAACAGAT
MX000185 XylR strain + 5785 5817 1.08e-05 0.0393 TTAAAAAGAGATTTAAATTTAAAAAATAAAAAT
MX000067 SigE strain + 5192 5203 1.09e-05 0.154 AGCATACATTGA
MX000009 ResD strain - 3365 3385 1.09e-05 0.0543 TCCTTCTGACAATTTTTTATA
MX000041 CovR strain - 18420 18435 1.1e-05 0.033 ATATTATTTAAAATAA
MX000001 MexR strain - 18849 18863 1.1e-05 0.45 TTTGACCTTATCAAT
MX000185 XylR strain + 3946 3978 1.11e-05 0.0393 AAAAAAGTGAAACAGCAAGCGATGGAAAACATT
MX000045 CodY strain - 2665 2729 1.11e-05 0.0129 TCTTTTAAAATATAATAGCATAAATTAAAAATTAAATCAATAGTATACAAATAATTATGATACAA
MX000118 CynR strain - 8373 8426 1.11e-05 0.132 AAAAGAAGGACATAAGCTTTATCATGGCATTAATTAGAGGTTTACCATCTTTCA
MX000009 ResD strain + 14462 14482 1.12e-05 0.0543 ATATTGATAAAACTTTATCAG
MX000035 AlgU strain + 12817 12826 1.14e-05 0.264 GGGAACTTTC
MX000057 PhoP strain - 20017 20047 1.15e-05 0.0198 TATCTTCATTTGTAAATTATTTAAGTATAAT
MX000107 OxyR strain - 14121 14157 1.15e-05 0.137 ATAAATATATATAATTGGCATTTTGTACGTCTTCCTT
MX000128 Fur strain + 1328 1346 1.16e-05 0.106 GCTAATGAAATTTATAAGA
MX000188 SarA strain - 17249 17264 1.17e-05 0.0151 AATTTTAAAAAAAATA
MX000014 OmpR strain + 9047 9073 1.17e-05 0.154 GAACCAATGGTTAAAAAGCGCATAACG
MX000017 CTSR strain + 4352 4368 1.17e-05 0.173 AGTCAATAATCATCAAT
MX000135 YhiX strain + 17241 17258 1.18e-05 0.064 AAAGCCTTTATTTTTTTT
MX000198 YrzC strain + 12748 12771 1.18e-05 0.0712 TAATGCCGGTAAAAATAAGAAGAT
MX000057 PhoP strain + 20794 20824 1.18e-05 0.0198 TTTGTTAATTATTGTATAATTATAAGAAAAC
MX000057 PhoP strain - 19373 19403 1.18e-05 0.0198 TATATTCACTATTTTAGTTTTTTTATTAAAA
MX000149 Nac strain + 9731 9741 1.19e-05 0.183 ATCAGAAATAC
MX000118 CynR strain + 17994 18047 1.2e-05 0.132 ATAAATATGAAAATCAATTAGACACAAAAAAAATGTATAATTTGACTTCTGAAA
MX000089 XylR strain + 12149 12171 1.21e-05 0.1 ATTGGTTTGAATAATAAACAAAA
MX000166 RcsB strain + 13099 13113 1.21e-05 0.211 ATGAATATACATCTG
MX000166 RcsB strain - 16289 16303 1.21e-05 0.211 CTAAAGATTCATCAG
MX000175 SdiA strain + 20831 20860 1.21e-05 0.204 AATTGCAATGATAGGGACAAAGACTTCTCG
MX000114 Ada strain + 3946 3963 1.22e-05 0.0542 AAAAAAGTGAAACAGCAA
MX000056 MtrB strain - 14523 14578 1.22e-05 0.0889 ATCGGTTTTTTCTAATACCTTTGTTGCCCTTATTTCCTCAGCTTCAATTAATTTTT
MX000185 XylR strain + 18171 18203 1.23e-05 0.0393 ATAAATTAATAAAAGAAGGAGAAAAAATAAAAG
MX000057 PhoP strain + 2503 2533 1.23e-05 0.0198 TATAATTTAATAAATATATCGCTTATAATTA
MX000123 DeoR strain + 18478 18493 1.23e-05 0.054 TGATAAAATAGCAATA
MX000083 SigX strain + 8918 8929 1.24e-05 0.108 ATTGAAACGATT
MX000188 SarA strain - 5803 5818 1.24e-05 0.0151 AATTTTTATTTTTTAA
MX000011 RhlR strain - 12020 12035 1.25e-05 0.162 CTGCAGGTACTGTTAC
MX000105 GlpR strain + 19346 19365 1.25e-05 0.317 AATTGACGAAACTGAAAGAG
MX000128 Fur strain - 2822 2840 1.26e-05 0.106 AGTAATGATAACAATTGTA
MX000074 SigB strain + 8413 8443 1.27e-05 0.107 TATGTCCTTCTTTTTAGAAAGTGGGAAAAAT
MX000060 PrfA strain - 2820 2833 1.27e-05 0.205 ATAACAATTGTAAG
MX000071 SigB strain + 7638 7649 1.27e-05 0.103 GGGGGAAATTAA
MX000188 SarA strain - 5795 5810 1.27e-05 0.0151 TTTTTTAAATTTAAAT
MX000056 MtrB strain - 1892 1947 1.27e-05 0.0889 GGCTCTATTACCATTTACAAAACCTCCTATAATTTTTTATTTTTTAAACCAGCCAA
MX000111 RpoN strain - 388 433 1.28e-05 0.276 AATCGTAACCGTCTTATTCTTTGGCGTTGAACTTGCTGATCTTTTT
MX000160 RcsA-RcsB strain + 1153 1166 1.28e-05 0.246 TAAGAAAAACCCTC
MX000071 SigB strain + 13513 13524 1.28e-05 0.103 AGGGGAATGAAA
MX000017 CTSR strain - 13343 13359 1.29e-05 0.173 CGTCAATTATAATAAAA
MX000026 TnrA strain + 19705 19721 1.29e-05 0.243 TGTCAACAAATCTTACT
MX000048 GltC strain - 18842 18856 1.3e-05 0.106 TTATCAATAATATAT
MX000041 CovR strain + 20878 20893 1.3e-05 0.034 TATTTTTTTTAAAAAA
MX000092 CaiF strain + 20794 20839 1.31e-05 0.0992 TTTGTTAATTATTGTATAATTATAAGAAAACATCATAAATTGCAAT
MX000043 AhrC strain - 7116 7131 1.31e-05 0.0543 ATTCATTTTCATTAAG
MX000188 SarA strain + 20875 20890 1.31e-05 0.0151 TTTTATTTTTTTTAAA
MX000020 AraR strain - 6518 6533 1.31e-05 0.136 ATTTGTACGGGCTATT
MX000088 Xre strain - 20794 20816 1.32e-05 0.094 ATAATTATACAATAATTAACAAA
MX000111 RpoN strain + 4518 4563 1.32e-05 0.276 GCTTCTGCAGTATTTTGCAGATGATGTGAACGTTGCTTCTGTGGTA
MX000109 TrpI strain - 16802 16824 1.32e-05 0.232 TTCCGTTAATTTATATGCCAGTT
MX000094 CysB strain - 3084 3114 1.33e-05 0.108 ATTTTGATAATTCATCTCTATATGCCGTATT
MX000094 CysB strain + 5821 5851 1.33e-05 0.108 AGGAGGTTATAAAAATGCCAAAATTAATTAT
MX000087 TreR strain - 11618 11631 1.34e-05 0.266 GCTGTATCTGCAAG
MX000154 OxyR strain - 18275 18308 1.35e-05 0.047 TATACATATCTATCATATTAATAATAGCAATATA
MX000067 SigE strain + 16098 16109 1.35e-05 0.154 CGCATAGAATGA
MX000009 ResD strain - 6751 6771 1.35e-05 0.0543 TGATGGTGCAAATTTATTCCA
MX000043 AhrC strain - 17639 17654 1.36e-05 0.0543 ATTTATTTTTATCCAA
MX000004 Fnr strain - 16712 16725 1.36e-05 0.143 TTGATATGCATCTA
MX000041 CovR strain - 2717 2732 1.36e-05 0.034 CTATCTTTTAAAATAT
MX000044 CitT strain + 6437 6461 1.37e-05 0.12 CGAAAAAACGGAATCGGACTTAAAA
MX000057 PhoP strain - 20793 20823 1.38e-05 0.0198 TTTTCTTATAATTATACAATAATTAACAAAA
MX000035 AlgU strain + 10232 10241 1.39e-05 0.264 AGGAACTTTT
MX000130 GalS strain - 15016 15029 1.39e-05 0.492 TGTTACCTCTTTCA
MX000150 NagC strain + 20874 20896 1.39e-05 0.0869 GTTTTATTTTTTTTAAAAAATAG
MX000009 ResD strain - 550 570 1.4e-05 0.0543 TTTTTCTCAAAATTTTCTATA
MX000092 CaiF strain + 6711 6756 1.42e-05 0.0992 GAGGAAAAAAATTCGCACTGAAAAAGAAGATATTGAATTTTGGAAT
MX000048 GltC strain + 20415 20429 1.45e-05 0.106 ATTTAAAAAAGAAAT
MX000057 PhoP strain - 2459 2489 1.45e-05 0.0198 TGAATTATATACTTAAATTCATTACATTACT
MX000050 Hpr strain + 2713 2731 1.45e-05 0.068 TATTATATTTTAAAAGATA
MX000016 Fur strain + 1365 1387 1.46e-05 0.0275 TATATAAAGATATTTCAGAAAAA
MX000016 Fur strain - 12991 13013 1.46e-05 0.0275 TTTTATACTGATTTTTTGATATT
MX000135 YhiX strain - 14666 14683 1.46e-05 0.064 TTCGGCTAATAATTTCAT
MX000045 CodY strain - 14146 14210 1.46e-05 0.0151 ATAACCTTTTTTATTCTGATAGAACATACCAATCATAATCATTGATAGAGCAAATAAATATATAT
MX000114 Ada strain - 316 333 1.47e-05 0.0542 AAAATCATTAAAAAGCAA
MX000114 Ada strain - 11566 11583 1.47e-05 0.0542 AAAATCATTAAAAAGCAA
MX000114 Ada strain + 18474 18491 1.47e-05 0.0542 AAAATGATAAAATAGCAA
MX000185 XylR strain + 5779 5811 1.47e-05 0.0412 AAAATATTAAAAAGAGATTTAAATTTAAAAAAT
MX000198 YrzC strain - 13030 13053 1.48e-05 0.0712 TAGCACAAATTATACTTGCAAGAA
MX000072 SigB strain + 14325 14357 1.48e-05 0.191 GAAGTTTTATAGTAGAAAGCATACGCAGAAAGA
MX000041 CovR strain + 19372 19387 1.49e-05 0.0343 CTTTTAATAAAAAAAC
MX000023 ComK strain + 17331 17343 1.49e-05 0.115 AAAATCATCTTTT
MX000098 DnaA strain - 10300 10308 1.49e-05 0.307 TTATCCGCA
MX000089 XylR strain + 14510 14532 1.5e-05 0.1 ATTGCTTTAAAGAAAAAATTAAT
MX000004 Fnr strain - 17991 18004 1.51e-05 0.143 TTCATATTTATCAA
MX000065 SigD strain + 16653 16695 1.51e-05 0.206 TTCAATGAATGCCAATCAGCGTATAAAAGAAACAAAAGGTGCT
MX000188 SarA strain + 17394 17409 1.51e-05 0.0151 AAATTTTATTAATAAT
MX000028 IHF strain - 1414 1427 1.51e-05 0.15 GAATCAATTATTTA
MX000079 SigW strain - 17555 17586 1.51e-05 0.232 CTTAAAACCATTTTCTTTATTTCACCTGTAAT
MX000198 YrzC strain - 20865 20888 1.52e-05 0.0712 TAAAAAAAATAAAACTTCCCGTAA
MX000136 IlvY strain - 17161 17187 1.52e-05 0.168 TAATATTAATTTTTACAATGATTCTTT
MX000016 Fur strain + 2654 2676 1.52e-05 0.0275 TTAAAAATAATTTGTATCATAAT
MX000205 CmeR strain - 18394 18405 1.53e-05 0.12 CCTTTATTATTT
MX000057 PhoP strain - 20394 20424 1.53e-05 0.0198 TTTTTTAAATTTTCTAATTCCGTCCTTATCT
MX000089 XylR strain + 1895 1917 1.53e-05 0.1 GCTGGTTTAAAAAATAAAAAATT
MX000045 CodY strain + 16928 16992 1.54e-05 0.0151 TTGTGCTGATTTCAGATGGAAGAGCGAATGTAAGTATAGGTTCAAAAAAACCGATAGAAGAGGTT
MX000151 NhaR strain - 18446 18456 1.54e-05 0.219 TCCTTAAAAAC
MX000053 LicT strain - 20641 20669 1.54e-05 0.243 GCCTTTTTCTCGATAAGGTATGCCCATCC
MX000045 CodY strain - 2453 2517 1.54e-05 0.0151 ATTTATTAAATTATATTTTTAACTTAATTGAATTATATACTTAAATTCATTACATTACTAACATT
MX000045 CodY strain + 5757 5821 1.54e-05 0.0151 GTTGTTCCGTTATAAGCGATATAAAATATTAAAAAGAGATTTAAATTTAAAAAATAAAAATTATA
MX000057 PhoP strain - 20792 20822 1.54e-05 0.0198 TTTCTTATAATTATACAATAATTAACAAAAT
MX000160 RcsA-RcsB strain - 20177 20190 1.55e-05 0.246 TCGGAATTTTCCTT
MX000059 PurR strain + 9633 9652 1.55e-05 0.202 AAATAAAACGTACAAATCTT
MX000188 SarA strain - 18422 18437 1.55e-05 0.0151 TTATATTATTTAAAAT
MX000180 HydG strain + 13889 13944 1.57e-05 0.297 AAAAAGCAGTGGAAATAACGCATCTTCTGAAGGTACCAAATCAGCGAACCCTGAAA
MX000026 TnrA strain + 802 818 1.57e-05 0.243 TGATAAAAATGTTTACA
MX000188 SarA strain - 1900 1915 1.57e-05 0.0151 TTTTTTATTTTTTAAA
MX000047 GerE strain + 18739 18750 1.57e-05 0.317 ATATAGGTGAAA
MX000073 SigB strain + 16288 16319 1.58e-05 0.0833 ACTGATGAATCTTTAGAAGAAAAAGAAAGAGA
MX000016 Fur strain + 2708 2730 1.59e-05 0.0275 TATGCTATTATATTTTAAAAGAT
MX000014 OmpR strain + 18683 18709 1.59e-05 0.154 GACAAAAACAGTAAATATTGATAGAAT
MX000056 MtrB strain - 17639 17694 1.6e-05 0.0889 ATTTCCTGTATTTTTTTATTTATATCATCTAATTCTTTTAATTTATTTTTATCCAA
MX000044 CitT strain + 17768 17792 1.6e-05 0.12 GAAAAATATCAGAATGCTGTTAAAA
MX000188 SarA strain - 18340 18355 1.6e-05 0.0151 ATTTAAAATTAAATTT
MX000121 CytR strain + 20727 20738 1.61e-05 0.436 GGAAAATTGGGT
MX000071 SigB strain + 13194 13205 1.61e-05 0.107 TGGGGAAAAGAT
MX000011 RhlR strain - 7953 7968 1.61e-05 0.162 CTATAACATTTGGCAG
MX000070 SigE strain - 6970 7006 1.61e-05 0.171 TTATATTTTTTAGTCCTGACTTTTCCATATTTTCCTT
MX000116 ArgR strain + 7247 7260 1.61e-05 0.119 TGATTATTTATCCA
MX000136 IlvY strain + 6738 6764 1.62e-05 0.168 AGATATTGAATTTTGGAATAAATTTGC
MX000039 RofA strain - 17367 17383 1.62e-05 0.084 TTTTCCCATATAATAAT
MX000069 SigE strain - 20226 20261 1.62e-05 0.175 TGTTTAATGTCTTTTCCATATCATTGTAACTTTGCA
MX000198 YrzC strain + 19219 19242 1.62e-05 0.0712 GAGCAAATATTATACGTATAGGAA
MX000038 CovR strain + 11523 11533 1.63e-05 0.0786 TAAAATTAAAA
MX000038 CovR strain + 17649 17659 1.63e-05 0.0786 ATAAATTAAAA
MX000038 CovR strain - 2700 2710 1.63e-05 0.0786 ATAAATTAAAA
MX000168 DegU strain - 10067 10087 1.64e-05 0.216 AAGAGCATTTAGATCTTTTAG
MX000188 SarA strain + 5795 5810 1.65e-05 0.0151 ATTTAAATTTAAAAAA
MX000166 RcsB strain - 3097 3111 1.65e-05 0.211 TTGATAATTCATCTC
MX000074 SigB strain + 17433 17463 1.65e-05 0.111 AAGTTTCATTTAATGCAATAACAGGAAAAGA
MX000017 CTSR strain - 12305 12321 1.66e-05 0.173 GGTTTATAAAGGTCAAG
MX000027 GlnR strain - 20796 20812 1.66e-05 0.18 TTATACAATAATTAACA
MX000210 NtcA strain - 1982 1995 1.67e-05 0.423 GTAGAAATTAATAC
MX000128 Fur strain - 17699 17717 1.69e-05 0.106 GATTATTAGAAGCATTATT
MX000188 SarA strain + 18421 18436 1.69e-05 0.0151 TATTTTAAATAATATA
MX000194 SigI strain - 19014 19028 1.71e-05 0.658 TTCAAGCATTTTAAT
MX000188 SarA strain - 19665 19680 1.71e-05 0.0151 AATTGTATATTGAATT
MX000030 DegU strain + 3864 3882 1.71e-05 0.21 ACATTAGCTAAGTCTTCGG
MX000185 XylR strain - 2397 2429 1.72e-05 0.0412 TATAAATTAATAATGGCTTTGCTTTTTCATAAT
MX000041 CovR strain - 1925 1940 1.72e-05 0.0355 TTACCATTTACAAAAC
MX000056 MtrB strain - 18513 18568 1.73e-05 0.0889 TGAAACATAATCCTTGCCATTCACAGCTACCTTGTCATACATTTTTATCCCTGAAA
MX000045 CodY strain + 20023 20087 1.73e-05 0.0158 CTTAAATAATTTACAAATGAAGATAGGAGTGGATAAAATGTTAACACCTATGGATATACATAATA
MX000012 LasR strain - 7953 7968 1.73e-05 0.175 CTATAACATTTGGCAG
MX000016 Fur strain - 2322 2344 1.73e-05 0.0276 TTTACTTATAATTAAAGAATAAT
MX000047 GerE strain - 14377 14388 1.75e-05 0.317 AAATAGGTTATA
MX000115 AraC strain + 15504 15532 1.75e-05 0.325 AGGCAATAAAAAAAGGAGAAAAATCCTTT
MX000092 CaiF strain + 7239 7284 1.76e-05 0.0992 GGCTAATATGATTATTTATCCATTTAACCTTCTTTATAGTTTAGGA
MX000155 OxyR strain - 1068 1113 1.76e-05 0.281 AAAATAAAGTCAGGATCCCACTTCAACAGTTTTTCTTTATCAACTG
MX000090 Zur strain - 416 434 1.77e-05 0.182 TAATCGTAACCGTCTTATT
MX000012 LasR strain - 15941 15956 1.77e-05 0.175 CTATCAGTTCTAGCAT
MX000116 ArgR strain - 7734 7747 1.77e-05 0.119 TGAATAAACCTTCA
MX000199 CovR strain - 7039 7047 1.77e-05 0.0724 TTTTTTAAT
MX000199 CovR strain - 14996 15004 1.77e-05 0.0724 TTTTTTAAT
MX000199 CovR strain - 17753 17761 1.77e-05 0.0724 TTTTTTAAT
MX000199 CovR strain - 19478 19486 1.77e-05 0.0724 TTTTTTAAT
MX000041 CovR strain + 19098 19113 1.78e-05 0.0355 CCTTATTTTAAAAAAA
MX000078 SigL strain - 2420 2472 1.78e-05 0.114 TTCATTACATTACTAACATTAACTGGATATGAAAATCGCATCTTATAAATTAA
MX000076 SigH strain - 4991 5002 1.79e-05 0.128 AAAGGAGATATA
MX000016 Fur strain + 17985 18007 1.8e-05 0.0276 TTTACTTTGATAAATATGAAAAT
MX000056 MtrB strain - 18183 18238 1.8e-05 0.0889 TCCTCTTAATTGATTATCATATCCATCTATGTTAACTTTTATTTTTTCTCCTTCTT
MX000078 SigL strain + 3556 3608 1.81e-05 0.114 TTGATATAGATAAAGAAAAGCTTTTGTCATGGAATCCTGATATTATTTTTATT
MX000014 OmpR strain - 19895 19921 1.81e-05 0.154 AAATCCAGCATTAAATTTCTACCATAT
MX000185 XylR strain + 12739 12771 1.81e-05 0.0412 AAGCAAAACTAATGCCGGTAAAAATAAGAAGAT
MX000024 CcpC strain + 2773 2787 1.81e-05 0.302 ATATGAAAAACATAT
MX000094 CysB strain - 12893 12923 1.82e-05 0.108 TAAATGGTATCCCAAGCCATTTTTCAAAATA
MX000176 YdiH strain + 20794 20815 1.82e-05 0.202 TTTGTTAATTATTGTATAATTA
MX000128 Fur strain + 2360 2378 1.83e-05 0.106 GAAAATGATTCTTATTTTA
MX000188 SarA strain - 18424 18439 1.83e-05 0.0156 TTTTATATTATTTAAA
MX000165 MarA strain + 18269 18288 1.83e-05 0.23 AAAGCATATATTGCTATTAT
MX000099 PhoB strain - 19135 19150 1.83e-05 0.204 TGACATACATTTTTGA
MX000045 CodY strain + 2456 2520 1.83e-05 0.0158 GTTAGTAATGTAATGAATTTAAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATA
MX000070 SigE strain - 17702 17738 1.84e-05 0.171 TTTCTATATCTGCTTCATATGGATTATTAGAAGCATT
MX000037 RpoE-SigE strain + 6743 6773 1.84e-05 0.371 TTGAATTTTGGAATAAATTTGCACCATCATA
MX000154 OxyR strain - 14157 14190 1.84e-05 0.0503 AGAACATACCAATCATAATCATTGATAGAGCAAA
MX000059 PurR strain + 662 681 1.85e-05 0.202 CCAAATGCCGAACAAATTAT
MX000142 OmpR strain - 262 271 1.86e-05 0.156 TTTTCTTTTT
MX000039 RofA strain - 8442 8458 1.86e-05 0.084 TTTTTTATCGAATTCAT
MX000185 XylR strain - 9384 9416 1.86e-05 0.0412 GAATAGTTCCAATGGCAATATCAGGATAGCAAT
MX000168 DegU strain - 19134 19154 1.89e-05 0.216 AGACTGACATACATTTTTGAG
MX000107 OxyR strain - 7648 7684 1.89e-05 0.169 ATGACTATGCCATACTACAGCGGTAACTTTTTTCATT
MX000076 SigH strain + 17686 17697 1.9e-05 0.128 ACAGGAAATCAA
MX000205 CmeR strain + 16705 16716 1.9e-05 0.12 CTTTTATTAGAT
MX000064 SigB strain - 15215 15226 1.9e-05 0.156 AACGTTTAATAT
MX000073 SigB strain - 13466 13497 1.9e-05 0.0833 TAGGTTTTAGGGTTCTGTCTAAGGAATATTTA
MX000150 NagC strain - 7212 7234 1.92e-05 0.0869 CTTTGTCTTCCTCATGAAATATA
MX000135 YhiX strain + 2707 2724 1.93e-05 0.064 TTATGCTATTATATTTTA
MX000135 YhiX strain - 16275 16292 1.93e-05 0.064 TCAGTTTTTTTTTATCAT
MX000011 RhlR strain + 4522 4537 1.93e-05 0.162 CTGCAGTATTTTGCAG
MX000016 Fur strain + 18601 18623 1.94e-05 0.0282 ATATAGAAGATATAAAAAAAAAT
MX000070 SigE strain - 19208 19244 1.95e-05 0.171 TGTTCCTATACGTATAATATTTGCTCCTTCCTCAATA
MX000080 SigW strain - 20147 20158 1.95e-05 0.142 TTCTGAAACCTT
MX000073 SigB strain + 20712 20743 1.97e-05 0.0833 ATTGGTGCTTTAACAGGAAAATTGGGTAATAT
MX000074 SigB strain + 19002 19032 1.97e-05 0.111 ACGATTGATTTTATTAAAATGCTTGAAAGGT
MX000082 SigW strain - 11197 11229 1.97e-05 0.14 CTTGTAATATCGTCAAAAATCCAGTCATCTACC
MX000188 SarA strain + 4008 4023 1.97e-05 0.0162 AAAAATTTTTATAATT
MX000053 LicT strain + 15412 15440 1.98e-05 0.243 AAAATTGCCTGCAATAACAAGAAAAATGC
MX000150 NagC strain - 18419 18441 1.99e-05 0.0869 TATTTTATATTATTTAAAATAAA
MX000078 SigL strain + 12998 13050 1.99e-05 0.114 AAAAATCAGTATAAAATTAATATTTGTTTTTGTTCTTGCAAGTATAATTTGTG
MX000041 CovR strain - 7035 7050 2e-05 0.0374 TTCTTTTTTAATATCC
MX000035 AlgU strain + 18760 18769 2e-05 0.264 AGGAACTTTG
MX000037 RpoE-SigE strain + 12610 12640 2e-05 0.371 ATGGATTTTAGATAAAAATCCTGATATAATA
MX000050 Hpr strain + 9270 9288 2e-05 0.068 ATCAATATATAGCTACTTA
MX000154 OxyR strain + 2652 2685 2e-05 0.0503 TATTAAAAATAATTTGTATCATAATTATTTGTAT
MX000137 LacI strain - 8202 8222 2.01e-05 0.74 AACTGCGGGCAAATAGCAAAC
MX000068 SigE strain + 2476 2512 2.01e-05 0.173 AAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAA
MX000135 YhiX strain - 916 933 2.01e-05 0.064 TTAGAAATATTTTTTATT
MX000061 PyrR strain - 3876 3894 2.02e-05 0.276 GTTTAAAGCCACCCGAAGA
MX000023 ComK strain - 20499 20511 2.02e-05 0.125 AAAAATTCATTTT
MX000140 LexA strain - 12030 12045 2.02e-05 0.33 CTGTTTAAACCTGCAG
MX000094 CysB strain - 20307 20337 2.03e-05 0.108 TGTATGATAAGTTCAGCCTCTTTTGCGGCAT
MX000072 SigB strain + 17432 17464 2.04e-05 0.191 AAAGTTTCATTTAATGCAATAACAGGAAAAGAT
MX000134 IciA strain - 3910 3921 2.05e-05 0.246 AGATATTTTATT
MX000065 SigD strain + 16938 16980 2.05e-05 0.206 TTCAGATGGAAGAGCGAATGTAAGTATAGGTTCAAAAAAACCG
MX000154 OxyR strain + 2694 2727 2.06e-05 0.0503 TTTAATTTTTAATTTATGCTATTATATTTTAAAA
MX000045 CodY strain - 19923 19987 2.06e-05 0.0158 AACACAAGTTTTACAATAATTGGTTTTATCAGATACTGAATTACAATTATTGCTAAAATCGGCGA
MX000087 TreR strain + 15224 15237 2.06e-05 0.266 GTTGTTAATACAAG
MX000087 TreR strain + 16747 16760 2.06e-05 0.266 GTTGTATTTAAAGG
MX000016 Fur strain - 2490 2512 2.07e-05 0.0286 TTAAATTATATTTTTAACTTAAT
MX000036 AlgU strain - 9403 9411 2.07e-05 0.831 GTTCCAATG
MX000079 SigW strain - 3501 3532 2.08e-05 0.232 TCTGCAACATTTTTAGCATTTACAATTACAAA
MX000096 Lrp strain - 19483 19496 2.08e-05 0.179 CGGCTTTTTATTTT
MX000174 SoxS strain + 9906 9925 2.08e-05 0.291 AAAGCAGGATTTGCCAACAA
MX000057 PhoP strain + 17731 17761 2.09e-05 0.0227 TATAGAAAATCTTGAAAATTTAATTAAAAAA
MX000092 CaiF strain + 19565 19610 2.1e-05 0.0992 TATTTTTGCACTTAATGGTGAGATAAAAAAAATCTCAAATTTTATA
MX000057 PhoP strain - 17670 17700 2.11e-05 0.0227 TTTTTGATTTCCTGTATTTTTTTATTTATAT
MX000078 SigL strain + 11494 11546 2.11e-05 0.114 TGAAAGAAGTAAAAGCAAAGCTTGGGGAATAAAATTAAAACTTTAAGGAGGAT
MX000123 DeoR strain + 18905 18920 2.11e-05 0.0748 TGATAAAAGAGCAAAA
MX000006 SpoIIID strain - 13424 13433 2.11e-05 0.887 GGAACAAGCA
MX000059 PurR strain - 8350 8369 2.11e-05 0.202 AATATTCCCGTACGATTTCT
MX000073 SigB strain + 2363 2394 2.12e-05 0.0833 AATGATTCTTATTTTAATAATAAAGGAGAATT
MX000151 NhaR strain - 4394 4404 2.12e-05 0.219 TCCTAAAAATG
MX000136 IlvY strain - 5569 5595 2.12e-05 0.168 TTATAACAATTGCAGCAATATTTTCCT
MX000092 CaiF strain + 18755 18800 2.13e-05 0.0992 GGTTCAGGAACTTTGTGATAAATATCCATATTTAAAAGATTTGACT
MX000057 PhoP strain + 20000 20030 2.13e-05 0.0227 TTAACTTATTAAAATAGATTATACTTAAATA
MX000039 RofA strain + 20881 20897 2.13e-05 0.084 TTTTTTTAAAAAATAGG
MX000079 SigW strain + 8828 8859 2.13e-05 0.232 TTAGATACATTGGAAAGTGTTGCCCGTATAAT
MX000188 SarA strain + 17249 17264 2.14e-05 0.017 TATTTTTTTTAAAATT
MX000123 DeoR strain - 9712 9727 2.14e-05 0.0748 TGAAAGCAGACCATGA
MX000173 SoxR strain + 7745 7763 2.15e-05 0.288 TCAGCACGCTTTCTTGAGG
MX000173 SoxR strain + 14596 14614 2.15e-05 0.288 TCCCCTCGTTGGCTTGATG
MX000173 SoxR strain - 7746 7764 2.15e-05 0.288 TCCTCAAGAAAGCGTGCTG
MX000009 ResD strain - 1367 1387 2.16e-05 0.0543 TTTTTCTGAAATATCTTTATA
MX000091 ArcA strain - 712 721 2.16e-05 0.332 TGTTAAATAT
MX000185 XylR strain + 17672 17704 2.16e-05 0.0423 ATAAATAAAAAAATACAGGAAATCAAAAATAAT
MX000076 SigH strain - 4239 4250 2.17e-05 0.128 AGAGGATTTCTA
MX000013 Fur strain - 11572 11590 2.17e-05 0.143 CAGAACAAAAATCATTAAA
MX000163 Lrp strain + 6487 6511 2.17e-05 0.576 AAATCAAGGGTATTATGCCGTTCTC
MX000099 PhoB strain + 893 908 2.18e-05 0.204 TGTCAGCAAGATTTAA
MX000045 CodY strain + 7491 7555 2.19e-05 0.0158 GCGTGTTGATGAAGGAGGAAAGATTTAACAATGGAATGAAATAAAATTCAGTCTACTTGACATTA
MX000045 CodY strain - 17027 17091 2.19e-05 0.0158 AATTTCTTTTGCAAGTCCAAAAGTTATAAAATTATCCTTTTCAACATCGATAACAATAGATTTTA
MX000090 Zur strain + 2362 2380 2.19e-05 0.182 AAATGATTCTTATTTTAAT
MX000009 ResD strain - 18016 18036 2.2e-05 0.0543 AAATTATACATTTTTTTTGTG
MX000185 XylR strain - 13024 13056 2.2e-05 0.0423 GTTTAGCACAAATTATACTTGCAAGAACAAAAA
MX000039 RofA strain - 20788 20804 2.2e-05 0.084 TAATTAACAAAATTCGT
MX000016 Fur strain - 20801 20823 2.23e-05 0.0294 TTTTCTTATAATTATACAATAAT
MX000198 YrzC strain + 1324 1347 2.23e-05 0.0852 AAAAGCTAATGAAATTTATAAGAT
MX000184 YiaJ strain + 20118 20152 2.23e-05 0.139 ATGAAAATGAGGTTGATGAATTTTTAGATAAGGTT
MX000154 OxyR strain - 18837 18870 2.24e-05 0.0503 AAATCATTTTGACCTTATCAATAATATATTTAAC
MX000009 ResD strain - 19030 19050 2.24e-05 0.0543 TTATTCTTATATTTTTAAACC
MX000052 LevR strain + 14990 15002 2.25e-05 0.515 AAGTGAATTAAAA
MX000205 CmeR strain + 20807 20818 2.25e-05 0.12 GTATAATTATAA
MX000046 ComA strain + 10531 10550 2.25e-05 0.472 TTCAGGCATCACCCGTGACA
MX000057 PhoP strain - 544 574 2.26e-05 0.0227 ACTCTTTTTCTCAAAATTTTCTATACCAACA
MX000043 AhrC strain - 2286 2301 2.26e-05 0.0739 ATTAATTTACATTCAG
MX000200 MelR strain - 17548 17565 2.26e-05 0.208 TCACCTGTAATAGGTGAA
MX000057 PhoP strain - 18589 18619 2.28e-05 0.0227 TTTTTTATATCTTCTATATTTTCTAATATGT
MX000080 SigW strain - 1280 1291 2.28e-05 0.142 ATATAAAACCTT
MX000080 SigW strain - 3771 3782 2.28e-05 0.142 ATATAAAACCTT
MX000085 SigX strain - 18730 18762 2.29e-05 0.302 CCTGAACCTTATTTTCACCTATATCTTTCAAAC
MX000048 GltC strain + 5199 5213 2.29e-05 0.134 ATTGAAAAAAGAGAT
MX000066 SigE strain - 13466 13476 2.3e-05 0.348 AGGAATATTTA
MX000188 SarA strain - 1901 1916 2.31e-05 0.0174 ATTTTTTATTTTTTAA
MX000034 AlgU strain - 5712 5743 2.32e-05 0.838 TGAAATTTTTCTACAGCAATGGGAATCCCATA
MX000067 SigE strain + 4820 4831 2.32e-05 0.199 CTCATATAATGA
MX000017 CTSR strain + 18826 18842 2.33e-05 0.173 AGACGAATAAGGTTAAA
MX000082 SigW strain + 17171 17203 2.33e-05 0.14 TGTAAAAATTAATATTATATATAAACGTATAGA
MX000129 GalR strain + 13859 13871 2.34e-05 0.952 TGGAAGCAATTCC
MX000075 SigB strain + 7406 7435 2.34e-05 0.462 ACATTATCTATAATTATGTTAAGGAAAAGG
MX000092 CaiF strain - 18996 19041 2.34e-05 0.0992 TATTTTTAAACCTTTCAAGCATTTTAATAAAATCAATCGTATCATC
MX000188 SarA strain - 17171 17186 2.35e-05 0.0174 AATATTAATTTTTACA
MX000107 OxyR strain - 810 846 2.35e-05 0.169 ATTACTTTACCTATTATCTGCAATGATGTGTAAACAT
MX000009 ResD strain + 702 722 2.36e-05 0.0543 TTTTTGTTGCATATTTAACAG
MX000076 SigH strain + 12436 12447 2.36e-05 0.128 AAAGGATTTGAA
MX000100 RpoN strain - 1214 1262 2.36e-05 0.213 CAGCAATGGCATTATCAATATTTGTAGTATAATAATTAAATGGAATTTG
MX000020 AraR strain + 17504 17519 2.36e-05 0.153 ATTAGTACGGATGCAT
MX000041 CovR strain - 17748 17763 2.37e-05 0.0417 TCTTTTTTAATTAAAT
MX000115 AraC strain - 9973 10001 2.37e-05 0.325 CCTCAATAAGATGAGCTAAAAAGGCTTTA
MX000089 XylR strain - 3353 3375 2.37e-05 0.13 AATTTTTTATATAATCTACTACT
MX000193 KdgR strain - 20140 20157 2.37e-05 0.42 TCTGAAACCTTATCTAAA
MX000049 GltR strain - 18928 18942 2.38e-05 0.164 AATCCATAATAAGAT
MX000007 ArgR strain - 10680 10696 2.38e-05 0.999 TGTGGCGTTTCTCCAAG
MX000105 GlpR strain - 10755 10774 2.4e-05 0.317 TTCTTTCCAAGCTGAAGCAT
MX000151 NhaR strain - 7612 7622 2.42e-05 0.219 TAGTAAAAACA
MX000061 PyrR strain - 12845 12863 2.42e-05 0.276 CCTTAAAGCGATCAGGATA
MX000210 NtcA strain + 1034 1047 2.42e-05 0.423 GTAGTAGATGAAAC
MX000016 Fur strain + 12981 13003 2.43e-05 0.0297 TTTGTGTTAAAATATCAAAAAAT
MX000031 PhoP strain + 16873 16889 2.43e-05 0.286 GGGTTAGAGGTTATTAA
MX000045 CodY strain + 2366 2430 2.45e-05 0.0158 GATTCTTATTTTAATAATAAAGGAGAATTTGATTATGAAAAAGCAAAGCCATTATTAATTTATAA
MX000045 CodY strain + 2641 2705 2.45e-05 0.0158 CTGTTTTCAGGTATTAAAAATAATTTGTATCATAATTATTTGTATACTATTGATTTAATTTTTAA
MX000045 CodY strain - 14142 14206 2.45e-05 0.0158 CCTTTTTTATTCTGATAGAACATACCAATCATAATCATTGATAGAGCAAATAAATATATATAATT
MX000045 CodY strain + 17289 17353 2.45e-05 0.0158 TTTCTATGTAAAATATTAATTTATGCTTAAAAACTTAGAAGGAAAATCATCTTTTATATAGAATA
MX000045 CodY strain + 17644 17708 2.45e-05 0.0158 TAAAAATAAATTAAAAGAATTAGATGATATAAATAAAAAAATACAGGAAATCAAAAATAATGCTT
MX000020 AraR strain - 10429 10444 2.45e-05 0.153 TTTTGGACGTACTCCT
MX000114 Ada strain + 15039 15056 2.45e-05 0.0815 GAAAAAATAAAAGGGCAA
MX000064 SigB strain + 5618 5629 2.46e-05 0.156 AAGGTTTTCTAA
MX000016 Fur strain + 7105 7127 2.47e-05 0.0297 GATTATAAAGCCTTAATGAAAAT
MX000063 SenS strain + 16701 16721 2.48e-05 0.407 ATCTCTTTTATTAGATGCATA
MX000188 SarA strain - 6595 6610 2.48e-05 0.0174 TTTTATTATTTTAATC
MX000024 CcpC strain + 13305 13319 2.5e-05 0.302 ATAAGTACAAGTGAT
MX000203 DevR strain + 2851 2864 2.51e-05 0.898 GCTCTAAAGCCCCT
MX000154 OxyR strain + 1224 1257 2.51e-05 0.0503 TTAATTATTATACTACAAATATTGATAATGCCAT
MX000009 ResD strain - 5641 5661 2.52e-05 0.0543 AAATTGTCTTATCTTTTAAAA
MX000100 RpoN strain - 4010 4058 2.52e-05 0.213 ACTGACAAAACTAAAACAAAAAGTGCACACAATAAAATTATAAAAATTT
MX000076 SigH strain + 113 124 2.53e-05 0.128 AAAGGAAATTTA
MX000027 GlnR strain + 18241 18257 2.54e-05 0.18 TGTTTTAAAAGTTTATA
MX000209 NtcA strain - 6261 6274 2.54e-05 0.32 GTATCTACCAATAC
MX000167 DegU strain + 18499 18518 2.54e-05 0.317 AAATAAAGACATGGTTTCAG
MX000188 SarA strain - 17746 17761 2.54e-05 0.0174 TTTTTTAATTAAATTT
MX000188 SarA strain + 18418 18433 2.54e-05 0.0174 ATTTATTTTAAATAAT
MX000050 Hpr strain + 17175 17193 2.56e-05 0.068 AAAATTAATATTATATATA
MX000045 CodY strain + 17307 17371 2.57e-05 0.0158 ATTTATGCTTAAAAACTTAGAAGGAAAATCATCTTTTATATAGAATATAAACTTAGGTGGATTAT
MX000104 FleQ strain + 6932 6942 2.57e-05 1 CGGCGGTTGAC
MX000069 SigE strain + 18836 18871 2.57e-05 0.208 GGTTAAATATATTATTGATAAGGTCAAAATGATTTA
MX000045 CodY strain - 2349 2413 2.58e-05 0.0158 CTTTGCTTTTTCATAATCAAATTCTCCTTTATTATTAAAATAAGAATCATTTTCTTCAAGATGCA
MX000082 SigW strain + 1196 1228 2.58e-05 0.14 AACGAAAAAGTTTATAGTCAAATTCCATTTAAT
MX000088 Xre strain - 4348 4370 2.59e-05 0.094 TTATTGATGATTATTGACTCAGA
MX000150 NagC strain - 16361 16383 2.6e-05 0.0869 CACAATTCTTCTTACGGAAAATT
MX000184 YiaJ strain + 3025 3059 2.6e-05 0.139 CTAAAAAAGTCGTTGGTATTGAGGATATTAATTTA
MX000184 YiaJ strain - 2637 2671 2.6e-05 0.139 GATACAAATTATTTTTAATACCTGAAAACAGTTTT
MX000184 YiaJ strain - 19977 20011 2.6e-05 0.139 TTAATAAGTTAACCCATAAACATTAACACAAGTTT
MX000074 SigB strain + 4641 4671 2.6e-05 0.125 TGTTTATTTCATGTTTAACAGATGGAATTAT
MX000092 CaiF strain - 18748 18793 2.6e-05 0.0992 TCTTTTAAATATGGATATTTATCACAAAGTTCCTGAACCTTATTTT
MX000085 SigX strain + 19973 20005 2.61e-05 0.302 TGTAAAACTTGTGTTAATGTTTATGGGTTAACT
MX000016 Fur strain + 10146 10168 2.62e-05 0.0301 TCTTATCCGGTTTTAATGGAAAA
MX000065 SigD strain + 12172 12214 2.62e-05 0.206 TATCGGAAAATGGCAAACACCTACTATTGAAAAAATCATGTCA
MX000179 XapR strain + 12726 12738 2.63e-05 0.528 CTAATGCAGTTTT
MX000057 PhoP strain - 3034 3064 2.64e-05 0.0227 GCTTTTAAATTAATATCCTCAATACCAACGA
MX000050 Hpr strain + 18425 18443 2.64e-05 0.068 TTAAATAATATAAAATATC
MX000015 MtrB strain + 5692 5699 2.65e-05 0.277 CAAAAAAT
MX000015 MtrB strain + 12996 13003 2.65e-05 0.277 CAAAAAAT
MX000015 MtrB strain - 20506 20513 2.65e-05 0.277 CAAAAAAT
MX000195 YsiA strain + 7526 7545 2.65e-05 0.739 ATGAAATAAAATTCAGTCTA
MX000057 PhoP strain - 1394 1424 2.66e-05 0.0227 TCAATTATTTAAAATTCAATTGTTCAAATCC
MX000105 GlpR strain + 14404 14423 2.66e-05 0.317 TTTTGACGCACTTGAAAAAT
MX000109 TrpI strain - 1041 1063 2.67e-05 0.232 ATGACCGATTTTACCTGTTTCAT
MX000185 XylR strain + 18079 18111 2.68e-05 0.0474 AAAAAATGGCAATTTAAAGCAAAATAACATGCT
MX000170 Rob strain + 18084 18103 2.68e-05 0.471 ATGGCAATTTAAAGCAAAAT
MX000154 OxyR strain - 20792 20825 2.68e-05 0.0503 TGTTTTCTTATAATTATACAATAATTAACAAAAT
MX000159 Crp strain - 6923 6932 2.69e-05 1 GTAACCGATT
MX000156 MngR strain + 13694 13707 2.7e-05 0.247 TAGTACAAATACTA
MX000054 MntR strain + 3834 3853 2.7e-05 0.359 AAATTTTTCTATGGGAAACC
MX000154 OxyR strain - 18687 18720 2.7e-05 0.0503 CTGCTTCTTTTATTCTATCAATATTTACTGTTTT
MX000009 ResD strain - 20021 20041 2.71e-05 0.0543 CATTTGTAAATTATTTAAGTA
MX000041 CovR strain + 17876 17891 2.73e-05 0.0455 TCATCATTAAAAGACC
MX000062 RocR strain - 15230 15250 2.74e-05 0.252 AACACCACATAATCTTGTATT
MX000050 Hpr strain - 2706 2724 2.74e-05 0.068 TAAAATATAATAGCATAAA
MX000057 PhoP strain + 17381 17411 2.74e-05 0.0227 AAAAATATATTCAAAATTTTATTAATAATAG
MX000044 CitT strain - 6225 6249 2.74e-05 0.16 CTTTAAGTACTAAATGGTTTAAAAA
MX000094 CysB strain + 2391 2421 2.76e-05 0.108 AATTTGATTATGAAAAAGCAAAGCCATTATT
MX000102 Dnr strain + 13636 13649 2.77e-05 0.394 TTGATTCCAATAAA
MX000094 CysB strain - 1337 1367 2.77e-05 0.108 ATAGCGGTTTCTTTAAAAGCATCTTATAAAT
MX000115 AraC strain - 3195 3223 2.77e-05 0.325 TCTGCCTGTGATTTGTCGGAAAATCCTGT
MX000009 ResD strain - 1897 1917 2.78e-05 0.0543 AATTTTTTATTTTTTAAACCA
MX000013 Fur strain + 4614 4632 2.78e-05 0.143 CATGACTATAATCATTTTA
MX000013 Fur strain - 1582 1600 2.78e-05 0.143 GAAATTGAGGATAAATCTC
MX000198 YrzC strain + 4826 4849 2.78e-05 0.0852 TAATGAGAAGGCTGATTGGAGGAG
MX000060 PrfA strain - 102 115 2.78e-05 0.3 TTTACTTGAGTTAA
MX000043 AhrC strain - 13095 13110 2.79e-05 0.0739 ATGTATATTCATTAAG
MX000045 CodY strain + 4996 5060 2.79e-05 0.0158 CTCCTTTCAAGGAGGCTTAACAGATGATATTAGAAGTAGATGGAATAGAATTCAGATATATAAGC
MX000185 XylR strain - 3733 3765 2.81e-05 0.0474 CATAATAACAATCAGCAATTGCTGTATCAATAT
MX000059 PurR strain - 2104 2123 2.81e-05 0.202 CTGTTTCACGAATATTATTC
MX000076 SigH strain - 16914 16925 2.82e-05 0.128 ACAGGATATATA
MX000045 CodY strain + 17389 17453 2.82e-05 0.0158 ATTCAAAATTTTATTAATAATAGCTGTTATATTGTATATAGGAAAAGTTTCATTTAATGCAATAA
MX000045 CodY strain - 2475 2539 2.82e-05 0.0158 ATTCAATAATTATAAGCGATATATTTATTAAATTATATTTTTAACTTAATTGAATTATATACTTA
MX000057 PhoP strain + 12985 13015 2.82e-05 0.0227 TGTTAAAATATCAAAAAATCAGTATAAAATT
MX000028 IHF strain - 7005 7018 2.83e-05 0.177 TATTCAATATATTT
MX000062 RocR strain + 7202 7222 2.83e-05 0.252 TATGGAAAATTATATTTCATG
MX000107 OxyR strain - 15014 15050 2.83e-05 0.17 TTTTATTTTTTCACTTTGATTTGTTACCTCTTTCATT
MX000056 MtrB strain - 5004 5059 2.84e-05 0.0923 CTTATATATCTGAATTCTATTCCATCTACTTCTAATATCATCTGTTAAGCCTCCTT
MX000164 Lrp strain - 19412 19436 2.84e-05 0.658 TGCAATGAGTACCTTCACCTGTGGT
MX000082 SigW strain - 16063 16095 2.84e-05 0.14 AATACAAGTTCTGCCGCTTCTTTTACATCTTCT
MX000063 SenS strain - 17513 17533 2.84e-05 0.407 ATTTCTGATGATGTATGCATC
MX000050 Hpr strain - 12981 12999 2.85e-05 0.068 TTTGATATTTTAACACAAA
MX000116 ArgR strain - 19396 19409 2.86e-05 0.16 TGTATGTATATTCA
MX000150 NagC strain - 18694 18716 2.86e-05 0.0869 TTCTTTTATTCTATCAATATTTA
MX000188 SarA strain + 1404 1419 2.86e-05 0.0186 AATTGAATTTTAAATA
MX000188 SarA strain + 17177 17192 2.86e-05 0.0186 AATTAATATTATATAT
MX000172 RhaR strain - 15176 15226 2.87e-05 0.305 AACGTTTAATATTAAGGCTTTTTTCATCTTCTCCTGTCCAACTATTGCGCA
MX000175 SdiA strain + 2300 2329 2.87e-05 0.204 ATTGAAGAAATCAGTAGAAAAAATTATTCT
MX000057 PhoP strain + 17293 17323 2.88e-05 0.0227 TATGTAAAATATTAATTTATGCTTAAAAACT
MX000128 Fur strain - 4008 4026 2.88e-05 0.139 TAAAATTATAAAAATTTTT
MX000072 SigB strain + 20794 20826 2.88e-05 0.202 TTTGTTAATTATTGTATAATTATAAGAAAACAT
MX000121 CytR strain - 17938 17949 2.88e-05 0.436 GCCAAATTTGGA
MX000154 OxyR strain + 2496 2529 2.88e-05 0.0503 TTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTATA
MX000043 AhrC strain + 10232 10247 2.88e-05 0.0739 AGGAACTTTTATTCAT
MX000150 NagC strain + 19365 19387 2.9e-05 0.0869 GTCATTCCTTTTAATAAAAAAAC
MX000043 AhrC strain + 3596 3611 2.9e-05 0.0739 TATTATTTTTATTGAT
MX000138 MalI strain + 2086 2099 2.91e-05 0.354 GATTAAACGTGATA
MX000138 MalI strain + 17462 17475 2.91e-05 0.354 GATAAAACGGCTTT
MX000193 KdgR strain + 2634 2651 2.91e-05 0.42 TTTAAAACTGTTTTCAGG
MX000035 AlgU strain - 14111 14120 2.92e-05 0.29 GGGAACTTGC
MX000073 SigB strain - 16091 16122 2.93e-05 0.103 AAGGGTTTCTTTCTCATTCTATGCGGTAATAC
MX000045 CodY strain + 2472 2536 2.95e-05 0.0158 ATTTAAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTATAATTATTG
MX000167 DegU strain - 8285 8304 2.95e-05 0.317 AAAACAGGTATAACATTCAG
MX000057 PhoP strain - 5782 5812 2.96e-05 0.0227 TATTTTTTAAATTTAAATCTCTTTTTAATAT
MX000185 XylR strain + 18073 18105 2.97e-05 0.0474 AATTGAAAAAAATGGCAATTTAAAGCAAAATAA
MX000044 CitT strain + 11111 11135 2.98e-05 0.16 GGGCAGAAACGGCACGGTTATAAGG
MX000030 DegU strain + 5378 5396 2.98e-05 0.274 AGAAAAATTAAACCTACAG
MX000045 CodY strain + 18424 18488 2.99e-05 0.0158 TTTAAATAATATAAAATATCCTGTTTTTAAGGAGGTAATTGTAAAAGCAGAAAATGATAAAATAG
MX000109 TrpI strain - 14568 14590 2.99e-05 0.232 CTTTGCAATTATATCGGTTTTTT
MX000109 TrpI strain - 20916 20938 2.99e-05 0.232 TTTGGTAAGTTTAGCGTCTTGTT
MX000050 Hpr strain - 18607 18625 3e-05 0.068 ATATTTTTTTTTATATCTT
MX000064 SigB strain + 19028 19039 3e-05 0.156 AAGGTTTAAAAA
MX000118 CynR strain + 12085 12138 3.01e-05 0.169 CATATTACAGATTCCAGACGATTTCATAGTAGGTGTAAGTGATACCGTCCAAAC
MX000057 PhoP strain - 10034 10064 3.02e-05 0.0227 GTTCTTCACAAATAAATTTTTCTTTCAATAT
MX000188 SarA strain - 14142 14157 3.02e-05 0.0191 ATAAATATATATAATT
MX000056 MtrB strain - 3879 3934 3.02e-05 0.0923 CTAAATTCATATTAGATATTTTATTGACCTAAGGTTATCTGTTTAAAGCCACCCGA
MX000056 MtrB strain - 11494 11549 3.02e-05 0.0923 AAAATCCTCCTTAAAGTTTTAATTTTATTCCCCAAGCTTTGCTTTTACTTCTTTCA
MX000198 YrzC strain - 1422 1445 3.02e-05 0.0852 TAACACATAATATTCTTGGAATCA
MX000094 CysB strain - 16546 16576 3.02e-05 0.108 TAATCGATATTGCAAGCCCTTCTTTATCACG
MX000155 OxyR strain + 15134 15179 3.03e-05 0.322 AGAAAAATGAGGAGGAATTTATATAATATGTATTATCCATTTTGCG
MX000009 ResD strain + 4024 4044 3.03e-05 0.0543 TTATTGTGTGCACTTTTTGTT
MX000013 Fur strain - 14171 14189 3.04e-05 0.143 GAACATACCAATCATAATC
MX000009 ResD strain - 12985 13005 3.05e-05 0.0543 TGATTTTTTGATATTTTAACA
MX000045 CodY strain - 18020 18084 3.05e-05 0.0158 TTTTTTTCAATTGGTTCTGTAGTGATTTTACTCAACATTTCAGAAGTCAAATTATACATTTTTTT
MX000045 CodY strain - 18910 18974 3.05e-05 0.0158 CTTTTCTCCCGCAACATTAACTTCAACAAGACAATCCATAATAAGATTCTTTTGTTTTGCTCTTT
MX000198 YrzC strain + 19665 19688 3.05e-05 0.0852 AATTCAATATACAATTTGTCTAAA
MX000150 NagC strain - 923 945 3.05e-05 0.0869 GGTTTTTTATCATTAGAAATATT
MX000017 CTSR strain + 2485 2501 3.06e-05 0.173 ATTCAATTAAGTTAAAA
MX000017 CTSR strain + 3941 3957 3.06e-05 0.173 AGATAAAAAAAGTGAAA
MX000009 ResD strain - 3335 3355 3.06e-05 0.0543 ACTTTCTGTGCTCTTGTTTCA
MX000045 CodY strain + 2463 2527 3.07e-05 0.0158 ATGTAATGAATTTAAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTA
MX000039 RofA strain - 17247 17263 3.09e-05 0.0879 ATTTTAAAAAAAATAAA
MX000088 Xre strain - 2817 2839 3.09e-05 0.094 GTAATGATAACAATTGTAAGCAA
MX000140 LexA strain - 17784 17799 3.09e-05 0.33 CTGTTATTTTTAACAG
MX000154 OxyR strain - 19812 19845 3.09e-05 0.0508 CTATTATAACAAATTTAGAAATCGGATTTGCCAT
MX000049 GltR strain - 19819 19833 3.1e-05 0.164 ATTTAGAAATCGGAT
MX000012 LasR strain - 17008 17023 3.1e-05 0.246 CTTCCTTTTTTACCAG
MX000068 SigE strain - 1847 1883 3.12e-05 0.173 TCATGAATACTGTCTATATCTGTTGAATAAGGCTTTA
MX000050 Hpr strain + 1362 1380 3.12e-05 0.068 CGCTATATAAAGATATTTC
MX000050 Hpr strain - 17983 18001 3.12e-05 0.068 ATATTTATCAAAGTAAAAA
MX000088 Xre strain + 16004 16026 3.13e-05 0.094 ATAATGATGAAGACAGCATCAAC
MX000209 NtcA strain + 1982 1995 3.13e-05 0.32 GTATTAATTTCTAC
MX000056 MtrB strain - 15046 15101 3.16e-05 0.0923 ATAAGCTTCTCCTACTTTTTGTAATTCGCCTTTCCCCTGAACGGCTTGCCCTTTTA
MX000166 RcsB strain + 11312 11326 3.16e-05 0.242 TTGGAGGCTCATCAG
MX000166 RcsB strain + 11868 11882 3.16e-05 0.242 TTGATGTTGCACCTG
MX000057 PhoP strain - 17168 17198 3.16e-05 0.0227 ACGTTTATATATAATATTAATTTTTACAATG
MX000039 RofA strain - 19005 19021 3.17e-05 0.0879 ATTTTAATAAAATCAAT
MX000098 DnaA strain + 1587 1595 3.18e-05 0.34 TTATCCTCA
MX000150 NagC strain - 19576 19598 3.18e-05 0.0869 GATTTTTTTTATCTCACCATTAA
MX000038 CovR strain - 2374 2384 3.19e-05 0.123 TATTATTAAAA
MX000066 SigE strain - 8027 8037 3.19e-05 0.348 TGTAATATTTC
MX000099 PhoB strain - 18521 18536 3.19e-05 0.239 TGTCATACATTTTTAT
MX000045 CodY strain + 2645 2709 3.2e-05 0.0158 TTTCAGGTATTAAAAATAATTTGTATCATAATTATTTGTATACTATTGATTTAATTTTTAATTTA
MX000172 RhaR strain + 2786 2836 3.21e-05 0.305 ATCATCACAATTTAAGTTTTTTGTTGTTGCATTGCTTACAATTGTTATCAT
MX000056 MtrB strain - 17733 17788 3.21e-05 0.0923 AACAGCATTCTGATATTTTTCCTCTTCTTTTTTAATTAAATTTTCAAGATTTTCTA
MX000083 SigX strain + 16483 16494 3.22e-05 0.225 AGGGAAACTAAT
MX000160 RcsA-RcsB strain + 9769 9782 3.22e-05 0.282 TGGGGATATTCCTG
MX000041 CovR strain - 1408 1423 3.22e-05 0.0508 CAATTATTTAAAATTC
MX000070 SigE strain - 2725 2761 3.22e-05 0.226 AAAATTTATTTTCAGATAATATATTGATACTATCTTT
MX000057 PhoP strain - 5759 5789 3.22e-05 0.0227 TTTAATATTTTATATCGCTTATAACGGAACA
MX000065 SigD strain + 19104 19146 3.23e-05 0.206 TTTAAAAAAATGAAAGAATTATTTGACAACCTCAAAAATGTAT
MX000135 YhiX strain - 2498 2515 3.23e-05 0.064 TTATTAAATTATATTTTT
MX000052 LevR strain + 18238 18250 3.24e-05 0.515 AGATGTTTTAAAA
MX000026 TnrA strain + 19048 19064 3.24e-05 0.334 TAAAAGGATTAATGACA
MX000045 CodY strain - 17849 17913 3.25e-05 0.0158 TTCTGATTTTTTAAATCCTCAAGGTCTTTTAATGATGAAGGTCCCTTATTTATAATCTGTTCTTT
MX000188 SarA strain + 14144 14159 3.25e-05 0.0199 TTATATATATTTATTT
MX000075 SigB strain - 5398 5427 3.25e-05 0.462 TTAATTCATCTAAATATCGCAGTGCAAATT
MX000050 Hpr strain - 20017 20035 3.26e-05 0.068 TAAATTATTTAAGTATAAT
MX000038 CovR strain + 7035 7045 3.28e-05 0.123 GGATATTAAAA
MX000134 IciA strain - 9368 9379 3.28e-05 0.295 AGATAATGCAAC
MX000057 PhoP strain - 17403 17433 3.29e-05 0.0227 TTTCCTATATACAATATAACAGCTATTATTA
MX000024 CcpC strain + 17643 17657 3.29e-05 0.302 ATAAAAATAAATTAA
MX000016 Fur strain + 2774 2796 3.29e-05 0.0364 TATGAAAAACATATCATCACAAT
MX000045 CodY strain + 222 286 3.3e-05 0.0158 GATTGGAAATCTAAAATACAAGAAATCAAGGGAAAACTAGAAAAAGAAAATTAAAGATTATAGAG
MX000045 CodY strain + 2672 2736 3.3e-05 0.0158 ATAATTATTTGTATACTATTGATTTAATTTTTAATTTATGCTATTATATTTTAAAAGATAGTATC
MX000045 CodY strain + 2689 2753 3.3e-05 0.0158 ATTGATTTAATTTTTAATTTATGCTATTATATTTTAAAAGATAGTATCAATATATTATCTGAAAA
MX000027 GlnR strain + 7813 7829 3.31e-05 0.18 TCTTATATTCTTTTACA
MX000057 PhoP strain + 18426 18456 3.32e-05 0.0227 TAAATAATATAAAATATCCTGTTTTTAAGGA
MX000154 OxyR strain - 19253 19286 3.32e-05 0.0508 TTAATTCCCCTCCATCTTATATAATCTTTTCCCA
MX000039 RofA strain - 6742 6758 3.32e-05 0.0879 TTATTCCAAAATTCAAT
MX000082 SigW strain - 18538 18570 3.32e-05 0.14 TTTGAAACATAATCCTTGCCATTCACAGCTACC
MX000039 RofA strain + 5622 5638 3.33e-05 0.0879 TTTTCTAACAAATTTCT
MX000174 SoxS strain - 4048 4067 3.33e-05 0.291 ATTGCATATACTGACAAAAC
MX000057 PhoP strain - 18591 18621 3.35e-05 0.0227 TTTTTTTTATATCTTCTATATTTTCTAATAT
MX000008 GlpR strain - 6161 6180 3.35e-05 0.644 TATGTTCAATTTTCCCAATT
MX000053 LicT strain + 13029 13057 3.36e-05 0.243 GTTCTTGCAAGTATAATTTGTGCTAAACC
MX000086 SinR strain + 138 157 3.37e-05 1 GGTTGGATGGAAGAAAACAT
MX000004 Fnr strain + 18050 18063 3.37e-05 0.221 TTGAGTAAAATCAC
MX000078 SigL strain + 263 315 3.38e-05 0.114 AAAAGAAAATTAAAGATTATAGAGGGAGAGAGATCTTGAATGAAAAAGAAGAT
MX000132 FliA strain - 1774 1800 3.38e-05 0.735 TAATCTATCACCTTTCACTTCCAATAA
MX000198 YrzC strain - 15228 15251 3.38e-05 0.0867 AAACACCACATAATCTTGTATTAA
MX000088 Xre strain - 2363 2385 3.38e-05 0.094 TTATTATTAAAATAAGAATCATT
MX000162 Mlc strain + 14980 15000 3.39e-05 0.601 AGATTTTGCCAAGTGAATTAA
MX000037 RpoE-SigE strain + 6703 6733 3.4e-05 0.42 TTTAATATGAGGAAAAAAATTCGCACTGAAA
MX000135 YhiX strain - 15197 15214 3.4e-05 0.064 TAAGGCTTTTTTCATCTT
MX000088 Xre strain + 2330 2352 3.41e-05 0.094 TTAATTATAAGTAAAGTATTGCA
MX000091 ArcA strain + 17785 17794 3.42e-05 0.35 TGTTAAAAAT
MX000058 PucR strain - 12454 12464 3.42e-05 0.585 TAACCTTGTTT
MX000049 GltR strain - 1404 1418 3.42e-05 0.164 ATTTAAAATTCAATT
MX000045 CodY strain + 2474 2538 3.43e-05 0.0161 TTAAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTATAATTATTGAA
MX000053 LicT strain + 11229 11257 3.43e-05 0.243 GGACTTTTATTCTCAATGAAGAAAACCGC
MX000063 SenS strain + 8298 8318 3.43e-05 0.407 CTGTTTTTTGTTATTCTGTTA
MX000043 AhrC strain - 800 815 3.43e-05 0.0762 AAACATTTTTATCAAA
MX000142 OmpR strain - 8454 8463 3.44e-05 0.156 GTTTCTTTTT
MX000054 MntR strain - 8761 8780 3.45e-05 0.359 TATTTAGCATAAAAGCTACT
MX000108 PhhR strain + 16451 16468 3.46e-05 0.979 GGTCAGGAAGATATGTCA
MX000161 NagC strain - 5484 5506 3.46e-05 1 GTCGGTTCGTCCAACAAAAGTAC
MX000185 XylR strain + 12990 13022 3.47e-05 0.0525 AAATATCAAAAAATCAGTATAAAATTAATATTT
MX000049 GltR strain - 18341 18355 3.47e-05 0.164 ATTTAAAATTAAATT
MX000019 Spo0A strain - 14696 14707 3.48e-05 0.374 ATTGTCAAAAGC
MX000057 PhoP strain - 2706 2736 3.48e-05 0.0229 GATACTATCTTTTAAAATATAATAGCATAAA
MX000148 ModE strain - 3283 3305 3.48e-05 0.403 AGATTTATAAAAGTCTTCATCAA
MX000053 LicT strain - 17578 17606 3.48e-05 0.243 CTTTTGGCACCCTTTCTCCGCTTAAAACC
MX000200 MelR strain - 20185 20202 3.49e-05 0.256 CTATCTTTTAAATCGGAA
MX000004 Fnr strain - 18769 18782 3.49e-05 0.221 TGGATATTTATCAC
MX000009 ResD strain - 8141 8161 3.49e-05 0.0552 ATTTTCTCTATAATTTTTATA
MX000018 CtsR strain + 3941 3958 3.49e-05 0.848 AGATAAAAAAAGTGAAAC
MX000088 Xre strain - 610 632 3.5e-05 0.094 TTATAGGTAAATTTTTTAGCTGA
MX000029 Fis strain + 19458 19472 3.5e-05 0.405 GCACAAAATATATGC
MX000188 SarA strain - 1902 1917 3.51e-05 0.0199 AATTTTTTATTTTTTA
MX000092 CaiF strain + 2963 3008 3.51e-05 0.105 TCCTGTAAATAGGGTTGTAGGTTTGACCAGTGCTTTAAGATTCATT
MX000096 Lrp strain - 914 927 3.51e-05 0.179 ATATTTTTTATTCT
MX000045 CodY strain - 2520 2584 3.52e-05 0.0161 CATTTTTTAAGTAATTCCAATTTTAGTTAGCAATAATTAAAGTTGATTCAATAATTATAAGCGAT
MX000163 Lrp strain - 29 53 3.52e-05 0.576 CCGCCGAGTAATTTCTTCCAGCGCC
MX000062 RocR strain - 4696 4716 3.54e-05 0.252 TACACCAAGTCCTTTTGCGGT
MX000028 IHF strain + 17388 17401 3.55e-05 0.177 TATTCAAAATTTTA
MX000175 SdiA strain + 2719 2748 3.55e-05 0.204 ATTTTAAAAGATAGTATCAATATATTATCT
MX000009 ResD strain + 1433 1453 3.57e-05 0.0552 ATATTATGTGTTATTATTTTA
MX000010 IHF strain + 6590 6597 3.58e-05 0.701 CAATGGAT
MX000010 IHF strain + 19516 19523 3.58e-05 0.701 CAATGGAT
MX000121 CytR strain + 20179 20190 3.58e-05 0.436 GGAAAATTCCGA
MX000078 SigL strain - 9457 9509 3.59e-05 0.114 TGGTTTGCATATGATCAACGAGTGTGGCATAACTCCTCCTTTTGGCTATGGTT
MX000170 Rob strain - 4048 4067 3.59e-05 0.471 ATTGCATATACTGACAAAAC
MX000020 AraR strain - 14122 14137 3.59e-05 0.186 TTTTGTACGTCTTCCT
MX000135 YhiX strain - 18616 18633 3.59e-05 0.064 TTAACTTTATATTTTTTT
MX000193 KdgR strain + 18254 18271 3.6e-05 0.42 TATAAAACGGATGGCAAA
MX000116 ArgR strain + 2287 2300 3.61e-05 0.173 TGAATGTAAATTAA
MX000109 TrpI strain - 15866 15888 3.62e-05 0.234 TGCCTTAATTCTTCCTGCTTCTC
MX000043 AhrC strain - 19010 19025 3.63e-05 0.0762 AAGCATTTTAATAAAA
MX000050 Hpr strain + 18284 18302 3.63e-05 0.0702 ATTATTAATATGATAGATA
MX000044 CitT strain + 6015 6039 3.63e-05 0.17 GGAGGGAAACCAGCCGTATCTAAAA
MX000154 OxyR strain - 2361 2394 3.63e-05 0.0508 AATTCTCCTTTATTATTAAAATAAGAATCATTTT
MX000185 XylR strain - 20771 20803 3.65e-05 0.0525 AATTAACAAAATTCGTCAACAATTTATGTTGTT
MX000045 CodY strain - 17170 17234 3.66e-05 0.0162 GCTTTATATTGCAAAACACTTGCCTTTTATATCTATACGTTTATATATAATATTAATTTTTACAA
MX000045 CodY strain - 20000 20064 3.66e-05 0.0162 AACATTTTATCCACTCCTATCTTCATTTGTAAATTATTTAAGTATAATCTATTTTAATAAGTTAA
MX000085 SigX strain - 5564 5596 3.67e-05 0.302 ATTATAACAATTGCAGCAATATTTTCCTCTTCT
MX000137 LacI strain + 19578 19598 3.67e-05 0.74 AATGGTGAGATAAAAAAAATC
MX000154 OxyR strain - 19197 19230 3.68e-05 0.0508 TAATATTTGCTCCTTCCTCAATAGCAACTTTATA
MX000082 SigW strain - 9625 9657 3.69e-05 0.14 TTGTCAAGATTTGTACGTTTTATTTCATCTATT
MX000019 Spo0A strain + 19679 19690 3.69e-05 0.374 TTTGTCTAAATA
MX000188 SarA strain + 19477 19492 3.7e-05 0.0199 AATTAAAAAATAAAAA
MX000100 RpoN strain + 17186 17234 3.7e-05 0.213 TATATATAAACGTATAGATATAAAAGGCAAGTGTTTTGCAATATAAAGC
MX000150 NagC strain + 13953 13975 3.71e-05 0.091 GTTAATTCTTCAAAGGAAGATAA
MX000016 Fur strain + 5363 5385 3.71e-05 0.0395 AGTAAACAGGGTTTTAGAAAAAT
MX000013 Fur strain - 322 340 3.74e-05 0.154 AAGAACAAAAATCATTAAA
MX000183 TrpR strain + 18868 18887 3.74e-05 1 TTTATTCCTTAGATAGTATG
MX000156 MngR strain + 3921 3934 3.75e-05 0.247 TAATATGAATTTAG
MX000156 MngR strain - 4385 4398 3.75e-05 0.247 AAATGCAAATATAA
MX000081 SigW strain + 3076 3085 3.75e-05 0.609 TAACGTATAA
MX000080 SigW strain + 3844 3855 3.76e-05 0.195 ATGGGAAACCTT
MX000124 FadR strain + 218 234 3.76e-05 0.799 AGCTGATTGGAAATCTA
MX000088 Xre strain + 19581 19603 3.77e-05 0.094 GGTGAGATAAAAAAAATCTCAAA
MX000111 RpoN strain - 14728 14773 3.77e-05 0.527 ATACCATCTCCTTCTAACCTTTGATATGACACTTGATATTCCTGCC
MX000182 TyrR strain + 4153 4170 3.77e-05 0.727 TGGAATATAAGATTGCCG
MX000088 Xre strain + 12156 12178 3.78e-05 0.094 TGAATAATAAACAAAATATCGGA
MX000209 NtcA strain - 8228 8241 3.78e-05 0.32 GTATTGTTATTTAC
MX000174 SoxS strain + 18467 18486 3.79e-05 0.291 AAAGCAGAAAATGATAAAAT
MX000188 SarA strain + 5775 5790 3.79e-05 0.0199 ATATAAAATATTAAAA
MX000048 GltC strain + 1222 1236 3.81e-05 0.148 ATTTAATTATTATAC
MX000048 GltC strain + 18423 18437 3.81e-05 0.148 TTTTAAATAATATAA
MX000039 RofA strain + 11262 11278 3.82e-05 0.0906 TTTTCAAAGAAAACAAC
MX000140 LexA strain + 12030 12045 3.83e-05 0.33 CTGCAGGTTTAAACAG
MX000094 CysB strain - 17692 17722 3.83e-05 0.122 ATATGGATTATTAGAAGCATTATTTTTGATT
MX000142 OmpR strain - 9567 9576 3.84e-05 0.156 TTTTCATATT
MX000142 OmpR strain - 17997 18006 3.84e-05 0.156 TTTTCATATT
MX000188 SarA strain - 20025 20040 3.84e-05 0.0199 ATTTGTAAATTATTTA
MX000065 SigD strain + 18564 18606 3.84e-05 0.206 TTTCAAAATAGGGGTGAGGATATGGACATATTAGAAAATATAG
MX000082 SigW strain - 5564 5596 3.86e-05 0.14 ATTATAACAATTGCAGCAATATTTTCCTCTTCT
MX000165 MarA strain - 19929 19948 3.87e-05 0.23 ATTACAATTATTGCTAAAAT
MX000073 SigB strain + 17575 17606 3.87e-05 0.103 AATGGTTTTAAGCGGAGAAAGGGTGCCAAAAG
MX000019 Spo0A strain + 8482 8493 3.87e-05 0.374 TTTGTTGAAAGA
MX000135 YhiX strain - 20419 20436 3.87e-05 0.064 ATATTCAATTTCTTTTTT
MX000027 GlnR strain - 7204 7220 3.87e-05 0.18 TGAAATATAATTTTCCA
MX000045 CodY strain - 17371 17435 3.88e-05 0.0165 CTTTTCCTATATACAATATAACAGCTATTATTAATAAAATTTTGAATATATTTTTTCCCATATAA
MX000074 SigB strain - 6898 6928 3.89e-05 0.143 CCGATTTTACTCTTTTTGCAAACGGTATTGC
MX000118 CynR strain - 3599 3652 3.89e-05 0.169 TCTTTTTGATAATCCTGTTTAACTAATGGTAAACCACCCTCATCAATAAAAATA
MX000057 PhoP strain - 14983 15013 3.89e-05 0.0236 TGTATAACCTTTTTTAATTCACTTGGCAAAA
MX000154 OxyR strain - 17023 17056 3.89e-05 0.0508 CCTTTTCAACATCGATAACAATAGATTTTATCTC
MX000185 XylR strain - 2679 2711 3.9e-05 0.0535 CATAAATTAAAAATTAAATCAATAGTATACAAA
MX000073 SigB strain + 18164 18195 3.91e-05 0.103 GATGATTATAAATTAATAAAAGAAGGAGAAAA
MX000009 ResD strain + 17291 17311 3.92e-05 0.0552 TCTATGTAAAATATTAATTTA
MX000028 IHF strain - 6736 6749 3.93e-05 0.177 AATTCAATATCTTC
MX000073 SigB strain + 3657 3688 3.93e-05 0.103 AAGTTTTATCAATCCTTAAAGGCGGTAAAAGA
MX000107 OxyR strain + 810 846 3.93e-05 0.193 ATGTTTACACATCATTGCAGATAATAGGTAAAGTAAT
MX000050 Hpr strain + 15123 15141 3.93e-05 0.0709 ATATTTATAATAGAAAAAT
MX000056 MtrB strain - 17263 17318 3.93e-05 0.0976 TTAAGCATAAATTAATATTTTACATAGAAAACTCTACTATACCAATTCTACCACAA
MX000188 SarA strain - 2502 2517 3.93e-05 0.0199 ATTTATTAAATTATAT
MX000088 Xre strain + 13690 13712 3.94e-05 0.094 TTAATAGTACAAATACTATGGAA
MX000160 RcsA-RcsB strain + 16617 16630 3.95e-05 0.282 TGGGAATTTTATTG
MX000208 PrrA strain + 9080 9095 3.95e-05 1 TGGGGCAATCCGCCGG
MX000156 MngR strain - 19606 19619 3.96e-05 0.247 TACTAAAAATATAA
MX000056 MtrB strain - 18449 18504 3.96e-05 0.0976 TTATTTTCAATTATTGCTATTTTATCATTTTCTGCTTTTACAATTACCTCCTTAAA
MX000059 PurR strain - 3078 3097 3.96e-05 0.227 CTATATGCCGTATTATACGT
MX000057 PhoP strain - 5793 5823 3.96e-05 0.0236 CCTATAATTTTTATTTTTTAAATTTAAATCT
MX000198 YrzC strain - 4724 4747 3.96e-05 0.0919 ACATACCTATTAATCTTATTCTTT
MX000072 SigB strain + 3381 3413 3.98e-05 0.224 AAGGATTTAAATGACAGGACAAAAGGGATTCCA
MX000098 DnaA strain - 9013 9021 3.98e-05 0.34 TCATCCACA
MX000188 SarA strain - 914 929 3.99e-05 0.0199 AAATATTTTTTATTCT
MX000188 SarA strain + 17178 17193 3.99e-05 0.0199 ATTAATATTATATATA
MX000076 SigH strain + 5164 5175 3.99e-05 0.161 ACAGGATTTTAA
MX000034 AlgU strain - 12543 12574 3.99e-05 0.838 GGCAACATTTATCCCACCGGCTGCTTCTAATC
MX000057 PhoP strain - 17163 17193 4e-05 0.0236 TATATATAATATTAATTTTTACAATGATTCT
MX000057 PhoP strain + 18414 18444 4e-05 0.0236 GGGTATTTATTTTAAATAATATAAAATATCC
MX000154 OxyR strain + 17388 17421 4e-05 0.0508 TATTCAAAATTTTATTAATAATAGCTGTTATATT
MX000045 CodY strain - 20247 20311 4e-05 0.0165 GGCATTTTGCTTCAATCCTTCGGCTGTATTTTGAGCAACAATTAGAGTATTGTTTAATGTCTTTT
MX000068 SigE strain - 19986 20022 4.01e-05 0.173 TATAATCTATTTTAATAAGTTAACCCATAAACATTAA
MX000045 CodY strain - 18778 18842 4.01e-05 0.0165 TTTAACCTTATTCGTCTGTAAATGTCCAATAAAATGGAAATTAGTCAAATCTTTTAAATATGGAT
MX000095 MhpR strain + 4321 4337 4.02e-05 1 GGAGCAGGCAGTGCACA
MX000041 CovR strain + 2370 2385 4.02e-05 0.0581 CTTATTTTAATAATAA
MX000118 CynR strain - 2528 2581 4.03e-05 0.169 TTTTTAAGTAATTCCAATTTTAGTTAGCAATAATTAAAGTTGATTCAATAATTA
MX000118 CynR strain - 17404 17457 4.03e-05 0.169 CCTGTTATTGCATTAAATGAAACTTTTCCTATATACAATATAACAGCTATTATT
MX000119 CpxR strain + 2869 2884 4.04e-05 0.61 AGCAAAAACAGGAAAC
MX000023 ComK strain - 17298 17310 4.04e-05 0.135 AAATTAATATTTT
MX000099 PhoB strain - 7963 7978 4.05e-05 0.253 TGTTATATAGCTATAA
MX000029 Fis strain + 14874 14888 4.05e-05 0.405 GATGAAGAATTCAAC
MX000150 NagC strain + 12153 12175 4.05e-05 0.091 GTTTGAATAATAAACAAAATATC
MX000048 GltC strain + 1411 1425 4.06e-05 0.148 TTTTAAATAATTGAT
MX000057 PhoP strain + 4640 4670 4.07e-05 0.0236 TTGTTTATTTCATGTTTAACAGATGGAATTA
MX000079 SigW strain + 13518 13549 4.08e-05 0.287 AATGAAACATTAGAAGAAAATCCTCTTGCAGC
MX000118 CynR strain + 2479 2532 4.08e-05 0.169 TATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATTTAATAAATATATCGCTTATAATT
MX000151 NhaR strain + 20986 20996 4.08e-05 0.295 TACTAAAAAAA
MX000149 Nac strain - 1556 1566 4.08e-05 0.184 ATCTGAAAAAC
MX000164 Lrp strain - 30 54 4.09e-05 0.658 GCCGCCGAGTAATTTCTTCCAGCGC
MX000176 YdiH strain + 20565 20586 4.1e-05 0.341 CTTGTGAAAAATAGAAAAACAT
MX000039 RofA strain - 13571 13587 4.11e-05 0.0906 CTTTTGCCAAAAATGAT
MX000163 Lrp strain - 16350 16374 4.12e-05 0.576 TCTTACGGAAAATTCTTCTCCTATC
MX000070 SigE strain + 7057 7093 4.12e-05 0.241 GAAAATGGTTTTGACCTTGTATTTGCCTCTATGACAC
MX000188 SarA strain - 2692 2707 4.13e-05 0.0199 AATTAAAAATTAAATC
MX000023 ComK strain + 7207 7219 4.15e-05 0.135 AAAATTATATTTC
MX000080 SigW strain + 17530 17541 4.17e-05 0.195 AAATGAAACGAT
MX000029 Fis strain + 12153 12167 4.18e-05 0.405 GTTTGAATAATAAAC
MX000065 SigD strain - 18415 18457 4.18e-05 0.206 CTCCTTAAAAACAGGATATTTTATATTATTTAAAATAAATACC
MX000179 XapR strain - 12900 12912 4.19e-05 0.528 CCAAGCCATTTTT
MX000045 CodY strain - 18982 19046 4.2e-05 0.0165 TCTTATATTTTTAAACCTTTCAAGCATTTTAATAAAATCAATCGTATCATCCGGTAATACCCCAT
MX000045 CodY strain - 20027 20091 4.2e-05 0.0165 TCCTTATTATGTATATCCATAGGTGTTAACATTTTATCCACTCCTATCTTCATTTGTAAATTATT
MX000092 CaiF strain - 16143 16188 4.2e-05 0.105 TGCTTTTGCTGTTGCTGTTCTTTTAATGTCTGTTCCAATTTTTCTT
MX000045 CodY strain + 2445 2509 4.2e-05 0.0165 ATCCAGTTAATGTTAGTAATGTAATGAATTTAAGTATATAATTCAATTAAGTTAAAAATATAATT
MX000210 NtcA strain - 2811 2824 4.21e-05 0.423 GTAAGCAATGCAAC
MX000045 CodY strain + 1372 1436 4.22e-05 0.0165 AGATATTTCAGAAAAATTAGGTGGATTTGAACAATTGAATTTTAAATAATTGATTCCAAGAATAT
MX000009 ResD strain - 883 903 4.22e-05 0.0552 TCTTGCTGACATTTTTCAAGA
MX000154 OxyR strain + 2678 2711 4.23e-05 0.0513 ATTTGTATACTATTGATTTAATTTTTAATTTATG
MX000088 Xre strain + 6579 6601 4.23e-05 0.094 GATAAGATAATCAATGGATTAAA
MX000038 CovR strain + 20469 20479 4.23e-05 0.143 GTCAATTAGAA
MX000075 SigB strain - 1846 1875 4.23e-05 0.462 ACTGTCTATATCTGTTGAATAAGGCTTTAT
MX000061 PyrR strain + 15638 15656 4.24e-05 0.276 GGTGTAAACATTGTAGAGA
MX000185 XylR strain - 2643 2675 4.24e-05 0.0555 TTATGATACAAATTATTTTTAATACCTGAAAAC
MX000103 ExsA strain + 14505 14543 4.25e-05 0.308 CACTTATTGCTTTAAAGAAAAAATTAATTGAAGCTGAGG
MX000064 SigB strain - 684 695 4.25e-05 0.156 CAGGTTTAACAT
MX000182 TyrR strain - 11419 11436 4.25e-05 0.727 TGAAACTCTCCCTTTACA
MX000028 IHF strain - 2461 2474 4.25e-05 0.177 AATTCATTACATTA
MX000133 GntR strain - 8047 8062 4.25e-05 1 AGGGTCCGCATAATCA
MX000057 PhoP strain - 20790 20820 4.27e-05 0.0239 TCTTATAATTATACAATAATTAACAAAATTC
MX000041 CovR strain - 3598 3613 4.27e-05 0.0581 TCATCAATAAAAATAA
MX000203 DevR strain - 9080 9093 4.28e-05 0.898 GGCGGATTGCCCCA
MX000107 OxyR strain + 3801 3837 4.29e-05 0.193 ATAGACCCTGCTAAAAAGGCGGATGAAATATACAAAT
MX000188 SarA strain + 20878 20893 4.29e-05 0.0199 TATTTTTTTTAAAAAA
MX000073 SigB strain + 16582 16613 4.3e-05 0.103 AAGGATATAAGAGAAAAAGTAAGGGAAAAAAA
MX000069 SigE strain - 17644 17679 4.3e-05 0.214 TTATTTATATCATCTAATTCTTTTAATTTATTTTTA
MX000135 YhiX strain - 18861 18878 4.3e-05 0.064 TAAGGAATAAATCATTTT
MX000094 CysB strain + 1390 1420 4.3e-05 0.123 AGGTGGATTTGAACAATTGAATTTTAAATAA
MX000009 ResD strain - 8425 8445 4.31e-05 0.0552 TCATTTTTCCCACTTTCTAAA
MX000057 PhoP strain - 17251 17281 4.31e-05 0.0239 TATACCAATTCTACCACAATTTTAAAAAAAA
MX000082 SigW strain - 8821 8853 4.31e-05 0.141 CGGGCAACACTTTCCAATGTATCTAAGTTTGCT
MX000043 AhrC strain + 4008 4023 4.32e-05 0.0762 AAAAATTTTTATAATT
MX000150 NagC strain - 13926 13948 4.33e-05 0.091 GCTTTTTCAGGGTTCGCTGATTT
MX000135 YhiX strain - 6998 7015 4.34e-05 0.064 TCAATATATTTATATTTT
MX000190 FNRL strain + 2202 2215 4.34e-05 0.391 TTGATGAGTTTGAA
MX000035 AlgU strain - 14043 14052 4.35e-05 0.345 CGGAACTTCC
MX000055 Mta strain - 1567 1588 4.35e-05 1 AAATCTCAAGTTGCATTATTTC
MX000146 MetJ strain + 11200 11215 4.36e-05 1 AGATGACTGGATTTTT
MX000073 SigB strain + 4039 4070 4.36e-05 0.103 TTTGTTTTAGTTTTGTCAGTATATGCAATAAA
MX000083 SigX strain + 3858 3869 4.36e-05 0.254 TATGAAACATTA
MX000128 Fur strain + 17566 17584 4.36e-05 0.181 AATAAAGAAAATGGTTTTA
MX000130 GalS strain - 6296 6309 4.37e-05 0.492 TGACACCTCTTCCA
MX000103 ExsA strain + 17068 17106 4.37e-05 0.308 ACTTTTGGACTTGCAAAAGAAATTGCAGACCTAATGGAT
MX000142 OmpR strain + 18720 18729 4.38e-05 0.156 GTTTCATTTG
MX000210 NtcA strain + 1982 1995 4.38e-05 0.423 GTATTAATTTCTAC
MX000123 DeoR strain - 191 206 4.38e-05 0.139 TGTTATAATATCAATA
MX000181 Crp strain - 20811 20832 4.38e-05 0.19 TTTATGATGTTTTCTTATAATT
MX000045 CodY strain + 8416 8480 4.4e-05 0.0165 GTCCTTCTTTTTAGAAAGTGGGAAAAATGAATTCGATAAAAAAGAAACGGCTTGTAAAGGTGTAT
MX000045 CodY strain - 14460 14524 4.4e-05 0.0165 TTTCTTTAAAGCAATAAGTGAGGTTTCAGGAATGTCCTTGTTCTGATAAAGTTTTATCAATATTT
MX000068 SigE strain - 3896 3932 4.41e-05 0.173 AAATTCATATTAGATATTTTATTGACCTAAGGTTATC
MX000085 SigX strain + 993 1025 4.42e-05 0.302 AATGTAAATATCCTCCTTTTATAGCTGTCAATG
MX000199 CovR strain + 2505 2513 4.43e-05 0.0819 TAATTTAAT
MX000199 CovR strain + 3599 3607 4.43e-05 0.0819 TATTTTTAT
MX000199 CovR strain - 13972 13980 4.43e-05 0.0819 TATTTTTAT
MX000199 CovR strain - 17643 17651 4.43e-05 0.0819 TATTTTTAT
MX000045 CodY strain - 2694 2758 4.43e-05 0.0165 ATTTATTTTCAGATAATATATTGATACTATCTTTTAAAATATAATAGCATAAATTAAAAATTAAA
MX000105 GlpR strain + 17067 17086 4.44e-05 0.396 AACTTTTGGACTTGCAAAAG
MX000064 SigB strain - 1308 1319 4.44e-05 0.156 CAGGTTTAATAT
MX000064 SigB strain - 19972 19983 4.44e-05 0.156 CAAGTTTTACAA
MX000175 SdiA strain + 7038 7067 4.44e-05 0.204 TATTAAAAAAGAAGGGCTTGAAAATGGTTT
MX000160 RcsA-RcsB strain + 14353 14366 4.44e-05 0.282 AAAGAAAATTCCCG
MX000175 SdiA strain - 17732 17761 4.45e-05 0.204 TTTTTTAATTAAATTTTCAAGATTTTCTAT
MX000103 ExsA strain + 19096 19134 4.46e-05 0.308 GACCTTATTTTAAAAAAATGAAAGAATTATTTGACAACC
MX000154 OxyR strain - 12185 12218 4.49e-05 0.0522 TTACTGACATGATTTTTTCAATAGTAGGTGTTTG
MX000185 XylR strain + 15879 15911 4.5e-05 0.056 AATTAAGGCAAAAGATTGTAAATGCCAAAAAAC
MX000050 Hpr strain - 8394 8412 4.5e-05 0.0746 AGCTTTATCATGGCATTAA
MX000181 Crp strain - 98 119 4.51e-05 0.19 TTCCTTTACTTGAGTTAACATT
MX000018 CtsR strain + 4352 4369 4.51e-05 0.848 AGTCAATAATCATCAATA
MX000156 MngR strain - 1974 1987 4.51e-05 0.247 TAATACAACTGGAA
MX000156 MngR strain + 15007 15020 4.51e-05 0.247 TTATACAAATGAAA
MX000188 SarA strain + 4011 4026 4.51e-05 0.0199 AATTTTTATAATTTTA
MX000016 Fur strain - 15211 15233 4.52e-05 0.0463 TATTAACAACGTTTAATATTAAG
MX000079 SigW strain + 17531 17562 4.53e-05 0.287 AATGAAACGATTATAGATTCACCTATTACAGG
MX000060 PrfA strain - 5012 5025 4.54e-05 0.324 ATATCATCTGTTAA
MX000148 ModE strain - 1925 1947 4.54e-05 0.403 GGCTCTATTACCATTTACAAAAC
MX000027 GlnR strain - 17171 17187 4.55e-05 0.18 TAATATTAATTTTTACA
MX000057 PhoP strain - 19021 19051 4.55e-05 0.0244 TTTATTCTTATATTTTTAAACCTTTCAAGCA
MX000056 MtrB strain - 12375 12430 4.56e-05 0.098 ATCAGCTACAAGTGCTATTTTCTCTGCTTTCCATTGTATAAACTCATCTGCTGTCT
MX000062 RocR strain + 20933 20953 4.57e-05 0.252 ACCAAAAACTGATTTTCCAAT
MX000135 YhiX strain - 16278 16295 4.59e-05 0.064 TCATCAGTTTTTTTTTAT
MX000198 YrzC strain + 9843 9866 4.6e-05 0.0919 TATCACTAAGAAAAGTAGTAGCAA
MX000198 YrzC strain + 13000 13023 4.6e-05 0.0919 AAATCAGTATAAAATTAATATTTG
MX000039 RofA strain + 7614 7630 4.61e-05 0.0906 TTTTTACTAATAATCTT
MX000039 RofA strain - 14225 14241 4.61e-05 0.0906 GTTTTACTTAAAATCAT
MX000119 CpxR strain + 20750 20765 4.62e-05 0.61 AGTAAAAGTACGTTCG
MX000180 HydG strain + 8875 8930 4.62e-05 0.464 GATCGGTTATAATGTAGACCCTCCTGCTGATGGTAAAGAATTAATTGAAACGATTA
MX000009 ResD strain + 4011 4031 4.65e-05 0.0552 AATTTTTATAATTTTATTGTG
MX000096 Lrp strain + 1580 1593 4.65e-05 0.179 TTGAGATTTATCCT
MX000175 SdiA strain + 15128 15157 4.66e-05 0.204 TATAATAGAAAAATGAGGAGGAATTTATAT
MX000175 SdiA strain + 19226 19255 4.66e-05 0.204 TATTATACGTATAGGAACAGGTATTTTTGG
MX000135 YhiX strain - 18430 18447 4.66e-05 0.064 ACAGGATATTTTATATTA
MX000041 CovR strain - 1899 1914 4.66e-05 0.0581 TTTTTATTTTTTAAAC
MX000188 SarA strain + 17174 17189 4.68e-05 0.0199 AAAAATTAATATTATA
MX000188 SarA strain + 18334 18349 4.68e-05 0.0199 AAAAGTAAATTTAATT

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

fimo --oc . --verbosity 1 --thresh 1.0E-4 prodoric.meme 26.fasta

Settings:

output_directory = . MEME file name = prodoric.meme sequence file name = 26.fasta
background file name = --nrdb-- alphabet = DNA max stored scores = 100000
allow clobber = true compute q-values = true parse genomic coord. = false
text only = false scan both strands = true max strand = false
threshold type = p-value output theshold = 0.0001 pseudocount = 0.1
alpha = 1 verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.


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