Поиск мотивов в последовательности белка Урацил-ДНК гликозилаза с помощью средств PROSITE

С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 4 известных мотива в последовательности белка Урацил-ДНК гликозилаза

Идентификатор паттерна	Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом	Паттерн	Число мотивов, обнаруженных в моем белке
PS00005*	PDOC00005:сайт фосфорилирования протеинкиназой С	[ST]-x-[RK]	4
PS00005*	PDOC00006: Сайт фосфорилирования казеинкиназой II	[ST]-x(2)-[DE]	3
PS00008*	PDOC00008: Сайт N-миристоилирования	G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}	3
PS00130	PDOC00121: Подпись Урацил-ДНК гликозилазы	[KR]-[LIV]-[LIVC]-[LIVM]-x-G-[QI]-D-P-Y	1

^* - отмечены часто встречающиеся в белках мотивы

Самый длинный паттерн- длинною в десять аминокислот:
[KR]-[LIV]-[LIVC]-[LIVM]-x-G-[QI]-D-P-Y
Этот паттерн в моём белке:

MANELTWHDVLAEEKQQPYFLNTLQTVASERQSGVTIYPPQKDV
FNAFRFTELGDVKVVILGQDPYHGPGQAHGLAFSVRPGIAIPPSLLNMYKELENTIPG
FTRPNHGYLESWARQGVLLLNTVLTVRAGQAHSHASLGWETFTDKVISLINQHREGVV
FLLWGSHAQKKGAIIDKQRHHVLKAPHPSPLSAHRGFFGCNHFVLANQWLEQRGETPI
DWMPVLPAESE

Но для этой формуле соответствует например следующий патерн, у которого лишь 4 аминокислоты совпадают с патарном моего белка:

K I L M P G I D P Y
Главная страница