Структура в целом
В данном практикуме будет рассматриваться структура пептидазного домена коллагеназы G -- белка Clostridium histolyticum в комплексе с ингибиторами (рис.1)
В структуре присутствует 1 полимерная цепь и так же биологическая единица состоит из одной цепи
Отдельные цепи
Данный белок был получен из бактерии Clostridium histolyticum
id данного белка в базе данных 7ZBV
Относительно референса из UniProt (id 7ZBV_1) в белке присутствуют 3 мутации на позициях 200, 290, 415. Модифицировнных аминокислот в аннотации нет.
Во вторичной структуре присутствуют альфа-цепи и бетта-листы (рис.2)
Малые молекулы
ITO | [6,7-bis(chloranyl)-3-phosphono-quinoxalin-2-yl]phosphonic acid
144 | TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM
CA | CALCIUM ION
ZN | ZINC ION
В отдельный файл сохранены данные по всем малым молкулам сслыка
Для иона калиция было определено молекулярное окружение (рис.3) на расстоянии до 5 ангстрем от молекулы лиганда
