- Я получил данные о метаболическом пути 00281. Картинка референсного пути изображена ниже:
- Из реакций я выбрал одну и выделил её цветом
- Реакция представляет собой присоединение воды к 5-метилгекса-2,4-диеноил-CoA с образованием 3-гидрокси-5-метилгекса-4-еноил-CoA
- Реакция катализируется ферментом 3-гидроксиацил-CoA гидролиазой (3-hydroxyacyl-CoA hydro-lyase)
- Номер фермента EC 4.2.1.17. Эти числа обозначают разделения групп ферментов на ещё более мелкие группы, от больших к более узким. Первое число (4) говорит о том, что фермент относится к лиазам, второе число (2) определяет реакции с разрывом/образованием связи между какими атомами будет катализировать фермент (С-О). Третье число(1) - является гидролиазой, то есть катализирует реакции присоединения/отщепления воды, и четвертое число (17) уже определяет какая это конкретно гидролиза (еноил-CoA гидратаза)
- Я выбрал организмы Escherichia coli K-12 W3110: и Brucella suis 1330
- Я выбрал организм Brucella Suis 1330, в KEGG есть информация о 3266 генах, кодирующих белки, 64 генах, кодирующих РНК и о 282 метаболических путях этой бактерии.