Практикум 1

Для данного практикума мне достался белок ГАМКb-рецептор человека, взаимодействующий с лигандом CGP-35348 (PDB-id 4MR8). Это трансмембранный рецептор, связанный с G-белком, через который он воздействует на калиевые каналы. Белок состоит из двух субъединиц. Изучалось взаимодействие белка с его антагонистом CGP-35348, которое происхдит за счет водородных связей: Группа фосфора свзяна с серинами 130 и 153, тогда как группа азота связывается водородной связью с гистедином 170 и образует солевой мостик с глутаматом 349. Возможные водородные связи показаны на картинке желтым, солевой мостик фиолетовым.