Канал хлорида clc
(hypothetical protein in hemL-pfs intergenic region)

• Краткое название белка — CLCA_ECOLI
• Полное название организма — Escherichia coli , K-12
• Название гена — clcA
• Номер локуса в бактериальной хромосоме — b0155
• Последовательность в формате FASTA:

  >CLCA_ECOLI
  MKTDTPSLETPQAARLRRRQLIRQLLERDKTPLAILFMAAVVGTLVGLAAVAFDKGVAWLQNQRMGALVHTADNYPLLL
  TVAFLCSAVLAMFGYFLVRKYAPEAGGSGIPEIEGALEDQRPVRWWRVLPVKFFGGLGTLGGGMVLGREGPTVQIGGNI
  GRMLDIFRLKGDEARHTLLATGAAAGLAAAFNAPLAGILFIIEEMRPQFRYTLISIKAVFIGVIMSTIMYRIFNHEVAL
  IDVGKLSDAPLNTLWLYLILGIIFGIFGPIFNKWVLGMQDLLHRVHGGNITKVLMGGAIGGLCGLLGFVAPATSGGGFN
  LIPIATAGNFSMGMLVFIFVARVITTLLCFSSGAPGGIFAPMLALGTVLGTAFGMVAVELFPQYHLEAGTFAIAGMGAL
  LAASIRAPLTGIILVLEMTDNYQLILPMIITGLGATLLAQFTGGKPLYSAILARTLAKQEAEQLARSKAASASENT
  

  Мои вычисления с помощью Excel

  ---

  Аминонокислотный состав белка
  A(Аланин) 12,3% C(Цистеин) 0,6% D(Аспарагиновая кислота) 2,3% E(Глутаминовая кислота) 3,6% F(Фенилаланин) 5,7% G(Глицин) 12,1% H(Гистидин) 1,2% I(Изолейцин) 7,9% K(Лизин) 2,8% L(Лейцин) 14,2% M(Метионин) 3,8% N(Аспарагин) 2,5% P(Пролин) 4,5% Q(Глутамин) 3,0% R(Аргинин) 4,9% S(Серин) 3,2% T(Треонин) 6,2% V(Валин) 6,1% W(Триптофан) 1,0% Y(Тирозин) 1,9%	Длина последовательности — 471 Молярная масса — 50052,17 г/моль Средний заряд молекулы при pH=7 — 8,68 Отношение содержания гидрофобных остатков (A,C,F,G,H,I,K,L,M,T,V,W,Y) к содержанию гидрофильных (D,E,N,P,Q,R,S) — 3,17, по чему можно предположить, что CLCA_ECOLI — мембранный белок.

  На главную...

  ---

  © Трушкин Никита,2004