Изображение области связывания cl444 с CLCA_ECOLI.

На этом рисунке показаны аминокислотные остатки, взаимодействующие с лигандом (cl444).

Возможно названия остатков плохо видны, поэтому привожу их список: tyr445,ser107,gly355,phe357,ile356,ile109.

На этом рисунке изображены аминокислотные остатки в проволочной модели (синие), их атомы, взаимодействующие на лиганд, и ион хлора в реальных пропорциях (команда RASMOL:"spacefill").

Атомы только этих аминокислот расположены на расстоянии 4Å от иона хлора (расстояния мериются от центра иона до центров атомов) и только они соприкасаются с ионом хлора, образуя "комнату" для иона.

Как видно, взаимодействия Ван-дер-Ваальсовы.

На главную...