Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке CLCA_ECOLI

Метка поля(line code) Запись
Внутренний уникальный постоянный
идентификатор документа 		AC P37019; P77394.
Стандартное имя последовательности
(идентификатор последовательности) 		ID CLCA_ECOLI
Название белка,
отражающее его функции 		DE H(+)/Cl(-) exchange transporter
clcA (ClC-ec1).
Дата создания документа DT 01-JUN-1994
Дата последнего исправления
аннотации 		DT 01-FEB-2005
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria;
Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 473 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 50349 а.е.м.
Число публикаций, использованных
при создании документа 		RN 9
Название журнала с самой
свежей публикацией 		RL Nature(2004)
Описание вторичной структуры FT Наличествует описание, состоящее в
перечислении всех элементов вторичной
структуры с указанием всех аминокислотных
остатков в них входящих.
Что содержит поле комментариев? CC Комментарии, конечно.
А именно: функции, субъединицы,
индукции, субцеллюлярные позиции и пр.
Какие особенности последовательности
указаны? 		FT Указано описание вторичной структуры;
все изгибы цепи; домены, в ней имеющиеся
и ещё чего-то(например, некие TRANSMEMы)...
Идентификатор файла PDB DR 1KPK, 1OTS, 1OTT, 1OTU

Документ банка данных SwissProt с описанием белка CLCA_ECOLI.

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка CLCA_ECOLI

Далее, с помощью поисковой системы SRS были обнаружены все белки организмов из таксонов Archaea, Bacteria и Eukaryota с той же функцией, что и белок CLCA_ECOLI.

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи "((([swissprot-Description:exchange*] & [swissprot-Description:transporter*]) | [swissprot-Description:exchange transporter*]) & [swissprot-Taxonomy:Archaea*]) 0
Бактерии "((([swissprot-Description:exchange*] & [swissprot-Description:transporter*]) | [swissprot-Description:exchange transporter*]) & [swissprot-Taxonomy:Bacteria*]) 11
Эукариоты "((([swissprot-Description:exchange*] & [swissprot-Description:transporter*]) | [swissprot-Description:exchange transporter*]) & [swissprot-Taxonomy:Eukaryota*]) 0

На главную...

© Трушкин Никита,2005