| Идентификатор записи EMBL | Тип молекулы |
Класс данных
|
Раздел EMBL
|
Дата создания документа |
Описание
|
Длина последовательности
|
| AP009048 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli W3110 DNA, complete genome. | 4646332 |
| U00096 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli K12 MG1655, complete genome. | 4639675 |
| D90745 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Replaced by AP009048 on 20-JAN-2006. | 1 |
| M84991 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabG) and acyl carrier protein (acpP) genes, complete cds, and malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase (fabD) gene, 5' end. | 1378 |
| M87040 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli malonyl coenzyme A-acyl carrier protein (fabD) gene, complete cds. | 1608 |
| I | II | |
| ID записи | M84991 | M87040 |
| Начало гена в записи | 79 | 1474 |
| Конец гена в записи | 813 | 1608 |
| Направление гена | Прямое | Прямое |
| Примечания* | В этой записи преведен не полный мой белок, а только его часть.(Кодирующую последовательность обрезали на середине.) |
В моем случае удобнее сделать локальное выравнивание(water), т.к в M87040 содержится только часть белка.
Последовательности совпали на 98.5%
| Позиция от начала кодирующей последовательности | 89 | 128 |
| Нуклеотид в первом варианте(M84991) | G | A |
| Нуклеотид во втором варианте(M87040) | C | G |
| Позиция в кодоне | 2 | 2 |
Открыл EMBL файл с ID ВА0000255 нашл там кодируемые участки гена 1C7. Увидел, что содержится 4 экзона. Между 4 экзонами должно лежать 3 интрона.
Ген на прямой цепи
--[351304..351346]--...--[354794..354831]--->
С помощью Excel посчитал:
Длина самого длинного экзона - 344
Длина самого длинного интрона - 2553
|
На главную страницу семестра |