Чтобы отобразить точнее реальный ход эволюции, используют разные способы оценки эволюционных растояний.
В программе msbar требуется ввести количество мутаций в пересчете на полную длину гена fabG.
Для этого данное число мутаций на 100 н.п. надо *7.35.
Cкрипт. Тип мутации - замена: -point 4
Для опреления попарных эволюционных расстояний используется программа distmat.
distmat -sequence mut6.fasta -outfile d.txt -nucmethod 0
0 - метод, считающий число несовпадений(D).
distmat -sequence mut6.fasta -outfile jc.txt -nucmethod 1
1 - метод, работающий по модели Джукса-Кантора(JC).
Реультаты измерений и расчеты
![]() |
На главную страницу семестра |