Метаболические пути. KEGG.

Поиск графических формул и идентификаторов заданных низкомолекулярных веществ в KEGG.

Метионин
Name: L-Methionine; L-2-Amino-4methylthiobutyric acid
Цистеин
Name: L-Cysteine; L-2-Amino-3-mercaptopropionic acid

Поиск метаболического пути. Выделение цветом пути превращения заданных веществ.

Биосинтез метионина из цистеина
Название выбранной карты: map00271 Methionine metabolism(метаболизм метионина)
текстовой файл(для запроса)

Исследование выбранного метаболического пути

Выбранный мной путь содержит три этапа. Цепочка получается.
Третью реакцию могут катализироватьт 4 фермента, в зависимости от вещества реагирующего с гомоцистиином.

Возможный путь превращения цистиина в метионин
Этап
Ферментативная реакция
Фермент
1 L-cysteine + NH3 + 2-oxobutanoate <=> L-cystathionine + H2O EC 4.4.1.1 
2 L-cystathionine + H2O <=> L-homocysteine + NH3 + pyruvate EC 4.4.1.8
3 trimethylammonioacetate + L-homocysteine <=> dimethylglycine + L-methionine EC 2.1.1.5

  • Определите, возможна ли ВЫБРАННАЯ цепочка реакций у конкретных организмов, заполните следующую таблицу:

    Организм
    Возможно ли превращение цистиина в метионин по данным KEGG ?
    Краткое обоснование
    Homo sapiens НЕТ Выбранная мной цепочка превращений у человека невозможна, но есть альтернативный путь.
    Escherichia coli НЕТ Невозможен первый этап (превращение цистиина в цистатионин)
    Pseudomonas aeruginosa PAO1 НЕТ Выбранная мной цепочка превращений невозможна, но есть альтернативный путь.
    Methanococcus janaschii НЕТ У этого организма по данным KEGG вобще определенон мало генов ферментов.

    KO (KEGG Orthology) "Reference pathway (KO)" purple boxes are hyperlinked to the corresponding KO entry. White boxes are proteins or genes without KO entries.
    На главную страницу семестра

    ©Goryanin Ignat 2005