Практикум №4

Задания выполнены для белка с id = 2XPD (тиоредоксин пероксидаза палочки псевдотуберкулеза)

Структура в целом

1. Представлен белками
2. В полученной структуре присутствует шесть полимерных одинаковых цепей (Unique protein chains: 1)
3. В одну биологическую единицу входит две цепи

Вторичная структура

Нельзя сказать, что больше преобладают тяжи или спирали.

Отдельные цепи

1. Цепи относятся к палочке псевдотуберкулёза (yersinia Pseudotuberculosis)
2. id: A0A0H3B2F9
название: A0A0H3B2F9_YERPY
функция:пероксидаза, катализирующая восстановление перекиси водорода и органических гидроперекисей до воды и спиртов соответственно. Играет роль в защите клеток от окислительного стресса путем детоксикации перекисей.
3. Относительно референса из Uniprot нет мутаций в последовательности
4. В составе цепи нет модифицированных аминокислотных остатков

Малые молекулы

1. Присутствует один тип малых молекул. Краткое название: DTU Полное название: (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL
2. Документ, содержащий строки из PDB файла с информацией о малых молекулах