Учебный сайт Дюгая Ильи

Главная

Первый семестр

Второй семестр

Ссылки

Об авторе

Описание белка superoxide reductase из генома бактерии Pyrococcus furiosus штамм COM1

Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_018092.1 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 1. На рис. 1 изображена окрестность в геноме гена описываемого белка.

Таблица 1. Информация о белке superoxide reductase из генома Pyrococcus furiosus штамм COM1

Вид информации	Квалификатор в записи генома	Значение
Локус гена в геноме	/locus_tag	PFC_05620
Имя гена	/gene	отсутствует
Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene	/db_xref=”GeneID:…”	13301880
Начало гена в геноме	-	1008047
Конец гена в геноме	-	1008421
На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная)	-	Обратная
Длина гена (в парах нуклеотидов)	-	375
Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein	/protein_id	YP_006492357.1
Длина белка (в аминокислотных остатках)	-	124

Рис. 1. Окрестность гена супероксид редуктазы из генома бактерии Pyrococcus furiosus COM1. Расположение гена отмечено цветом. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI

Можно заметить что гены, располагающиеся справа от superoxide reductase могут входить в один оперон с ним.