Учебный сайт Дюгая Ильи

Главная

Первый семестр

Второй семестр

Ссылки

Об авторе

Взаимодействия боковых цепей

Солевые мостики

Солевые мостики возникают между разноименно заряженными группами, входящими в состав боковых цепей аминокислот Все солевые мостики в белке superoxide reductase показаны на рис.1. Изображение получено с помощью скрипта atom-types.spt и команды
select within(GROUP,within(3.5,hdprot) and haprot,
within(3.5,haprot) and hdprot)
wireframe 60
cpk 70
color cpk
select within(3.5,hdprot) and haprot
connect 3.5 (within(3.5,haprot) and hdprot) hbonds

Рис.1 Солевые мостики в белке superoxide reductase

Отдельный солевой мостик между лизином и глутаминовой кислотой показан на рис.2.
Рис.2 Солевой мостик между лизином и глутаминовой кислотой

Водородные связи, не являющиеся солевыми мостиками.

Такая связь, найденая в между аспарагином 43 и глутаминовой кислотой 90, представлена на рис.3.
Рис.3 Водородная связь, не являющаяся солевым мостиком.

Дисульфидные связи.

В белке superoxide reductase дисульфидные связи найдены не были, поэтому для демонстрации я взял белок инсулин (3INS). Она показана на рис.4. На рисунке указано значение двугранного угла.
Рис.4 Дисульфидный мостик между субъединицами инсулина. Приведено значение двугранного угла.