Uniprot и Refseq Protein.

Мне был дан белок эндонуклеазы рестрикции с Refseq ID WP_011854641. По этому ID был проведен поиск в Uniprot. Основная информация, полученная при этом, представлена в таблице 1.

Таблица 1. Основная информация о белке с идентификатором WP_011854641

Uniprot ID	Uniprot AC	Refseq ID	PDB ID	Длина	Молекулярная масса	Submitted name
A0A0J9X157_MYCSJ	A0A0J9X157	WP_011854641	4F0P, 4F0Q, 4R28	273 а.о.	49,722 Да	Restriction endonuclease

Дополнительная информация о белке:

• структура известна для всего белка;
• в нем четыре цепи: А, В, C, D
• функции: катализ реакции гидролиза нуклеиновых кислот
• организм: бактерия Mycobacterium sp. (strain JLS);
• идентификатор нуклеотидной последовательности RefSeq: NC_009077.1. ;

Для белка были найдены включающие его кластеры Uniref50, Uniref90 и Uniref100. Результаты описаны в таблице 2.

Таблица 2. Описание кластеров Uniref для белка

Кластер	Uniref50	Uniref90	Uniref100
Cluster ID	UniRef50_A0A0J9X157	UniRef90_A0A0J9X157	UniRef100_A0A0J9X157
Число белков в кластере	31	1	1
Идентичность последовательностей	50%	90%	100%
Длина	456	456	456

Также были проведены несколько сеансов поиска в Uniprot. история изменения запросов поиска и результаты приведены в таблице ниже.

Текст запроса	Количество найденных белков	Количество аннотированных SwissProt белков
name:Restriction endonuclease	27 942	389
name:Restriction name:endonuclease taxonomy:Mycobacteriaceae	241	0
name:restriction name:endonuclease taxonomy:actinobacteria	2231	7
name:histone	87071	2048
name:histone taxonomy:phaeophyceae	36 (из них 35 принадлежат Ectocarpus siliculosus )	0
name:histone taxonomy:vertebrata	11477	702
name:trypsin	11134	301
name:trypsin NOT name:inhibitor	8343	98