Описание CRISPR-ассоциированного белка Csn1 и его геномного окружения

Аминокислотная последовательность

Ниже приведена аминокислотная последовательность CRISPR-ассоциированного белка Csn1 из генома бактерии Mycoplasma gallisepticum S6.

Вставка 1. Аминокислотная последовательность белка [1]

>gi|564750085|gb|AHB99924.1| CRISPR-associated protein Csn1 [Mycoplasma gallisepticum S6] MNNSIKSKPEVTIGLDLGVGSVGWAIVDNETNIIHHLGSRLFSQAKTAEDRRSFRGVRRLIRRRKYKLKRFVNLIWKYNSYFGFKNKEDILNNYQEQQKLHNTVLNLKSEALNAKIDPKALSWILHDYLKNRGHFYEDNR DFNVYPTKELAKYFDKYGYYKGIIDSKEDNDNKLEEELTKYKFSNKHWLEEVKKVLSNQTGLPEKFKEEYESLFSYVRNYSEGPGSINSVSPYGIYHLDEKEGKVVQKYNNIWDKTIGKCNIFPDEYRAPKNSPIAMIFN EINELSTIRSYSIYLTGWFINQEFKKAYLNKLLDLLIKTNGEKPIDARQFKKLREETIAESIGKETLKDVENEEKLEKEDHKWKLKGLKLNTNGKIQYNDLSSLAKFVHKLKQHLKLDFLLEDQYATLDKINFLQSLFVY LGKHLRYNNRVDSANLKEFSDSNRLFERVLQEQKDGLFKLFEQTDKDDEKILAQTHSLSTKAMLLAITRMTNLDNDEDNQKNNDKGWNFEAIKNFDQKFIDITKTNNNLSLKQDKRYLDDRFINDAILSPGVKRILREAT KVFNAILKQFSQEYDVTKVVIELARELSEEKELENNKNYKKLIKKNSDKISEGLKALDIAEDKIEDILKSPTKSYKVLLWLQQDHIDPYSQKEIAFEDILTKTEKTEIDHIIPYSISFDDSSSNKLLVLAESNQAKSNQT PYEFITSGNAGIKWEDYEAYCRKFKDGDTSLLDSTQRSKKFAKMMKTDTSSKYDIGFLARNLNDTRYATIVFRDALKDYANNHLVEDKPMFKVVCINGGVTSFLRKNFDKSWYAKKDRDKNIHHAVDASIISIFSNKTKT LFDQLTQFADYKLFKNTDGSWKKIDPKTGVVTEVTDENWKQIRVRNQVSKIAEEIDKCIQDSNIERKARYSRKIENKTNISLFNDTVYSAKKVGYDDQIKRKNLKTLDIDESVEENKNSKVKKQFVYRKLVNVSLLNNDK LADLFAEKEDILMYRANPWVINLAEQIFNEYTENRKIKSQNVFGKYMLDLTKEFPEKFSEAFVKSMLRNKTAIIYNVEKKVVHRIKRLKILSSELKENKLSNVIIRSKNESGTKLSYQDTINSVALMIMRSIDPTAKKQY IRVPLNTLNLHLGDHDFDLHNIDAYLKKPKFVKYLKANEIGDEYKPWRVLISGSLLIHKRDKKLMYISSFQNLNDLIEIKNLIETEYKENVDSDPKKKKKASQILRSLSTILNDYILLDAKDNFDILGLSKNRIDEILNS KLDLDKIAK

Некоторые характеристики белка

В таблице 1 приведены некоторые важные показатели, характеризующие данный белок.

Таблица 1. Описание CRISPR-ассоциированного белка Csn1 из генома бактерии Mycoplasma gallisepticum S6 [2]

ПараметрЗначение
Идентификатор белкаAHB99924.1
Идентификатор геномаCP006916
Координаты гена в геноме897217..901026
Длина гена (п.н.)3810
Цепьпрямая
Длина белка (а.к.)1269

Геномное окружение CRISPR-ассоциированного белка Csn1

Вставка 2. Геномное окружение [3]


Источники:
[1] CRISPR-associated protein Csn1 [Mycoplasma gallisepticum S6] - Protein - NCBI, www.ncbi.nlm.nih.gov
[2] Mycoplasma gallisepticum S6, complete genome - Nucleotide - NCBI, www.ncbi.nlm.nih.gov
[3] CP006916.3: Mycoplasma gallisepticum S6, complete genome, www.ncbi.nlm.nih.gov
НАЗАД ➜
© <Рюмина Екатерина>, 2016