Информация о Methanosaeta concilii GP6

• Род – Methanosaeta, вид - Methanosaeta concilii, штамм - GP6
• Домен - Archaea
• Идентификатор RefSeq - NC_015416.1 (Хромосомная ДНК, 3008626 bp (пар оснований)), NC_015430.1 (Плазмида, 18019 bp).
• Длина последовательности полного генома - 3026645 bp
• ДНК - кольцевая, хромосома + плазмида
• Число генов, кодирующих белки - 2850

Клетки данного представителя рода Methanosaeta, включающего в себя три вида, сферические и средние по размеру (0.2-5 мкм). Является типовым штаммом вида M. concilii. Данный вид имеет важную роль во влажных местообитаниях, где он представляет собой эффективнейшего метаногена, тем самым внося свою лепту в развитие парникового эффекта (стоит заметить, что метан обладает более сильными экранирующими тепло свойствами, чем углекислый газ).

Больше о генах-соседях фосфатазы

Их расположение можно увидеть на Рис1.

Описание данных генов:

• MCON_2338 - длина 1299 bp, направление -1, рамка считывания относительно гена фосфатазы -2,
  кодирует белок erythromycin esterase family protein длиной 432 аминокислот, расстояние до гена фосфатазы - 182 bp
• MCON_2340 - длина 2169 bp, направление +1, рамка считывания относительно гена фосфатазы +1,
  кодирует белок TPR-repeat-containing protein длиной 722 аминокислот, расстояние до гена фосфатазы - 320 bp

Рис1. Соседние гены

Данные гены не могут быть частью одного оперона, т.к. они считываются с разных цепей (некоторые гены будут антисмысловые).
Продукт гена MCON_2338 нужен для устойчивости к антибиотику эритромицину.
Продукт гена MCON_2340, судя по всему, участвует в белок-белковых взаимодействиях и передаче внутриклеточных сигналов.
Ближайший ген на комплементарной цепи находится на расстоянии:
в 5'-направлении - 0 генов;
в 3'-направлении - 3х генов.

Назад к странице первого семестра

---

© Aleksei Efremov, 2014