В геноме данного вируса, представленном одноцепочечной ДНК, есть шесть генов.
Их расположение можно увидеть на
Рис1.
Вот их кратчайшее описание:
- V1 - длина 774 bp, читается в прямом направлении, кодирует белок YP_699990.1 (coat protein) длиной 257 аминокислот
- V2 - длина 351 bp, читается в прямом направлении, кодирует белок YP_699989.1 (precoat protein) длиной 116 аминокислот
- C1 - длина 1089 bp, читается в обратном направлении, кодирует белок YP_699993.1 (replication-associated protein) длиной 362 аминокислот
- C2 - длина 408 bp, читается в обратном направлении, кодирует белок YP_699992.1 (C2-protein) длиной 135 аминокислот
- C3 - длина 405 bp, читается в обратном направлении, кодирует белок YP_699991.1 (C3-protein) длиной 134 аминокислот
- C4 - длина 198 bp, читается в обратном направлении, кодирует белок YP_699994.1 (C4-protein) длиной 65 аминокислот
Можно заметить, что многие гены у этого вируса перекрываются, это происходит в целях экономии места
(капсид не безграничен). Пример мы можем увидеть на
Рис2.
Рис1. Полный геном