После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

Text of the script for 1st task
Text of the script for 2nd task

Jmol output:


Водородные связи между белком и ДНК

Данный белок - эндонуклеаза, то есть фермент, гидролизующий фосфодиэфирные связи в ДНК. Водородные связи нужны для того, чтобы удерживать ДНК в нужном относительно активного центра положении.

Подвижость белка

Как показали расчеты, самыми подвижными являются атомы радикалов, наиболее удаленные от остова. Атомы остова аминокислотных остатков, входящих в петли, подвижнее, чем атомы участков альфа-спиралей и бета-тяжей.