На этой странице представлена информация про записи в разных базах данных о щелочной фосфатазе из археи M. concilii GP6.
1. Идентификаторы в разных базах данных
База данных
Идентификатор
Uniprot
ID: F4BY60_METCG || AC: F4BY60
RefSeq
YP_004384630.1
Uniref50
UniRef50_G7WKQ6
PDB
-
2. Изменения в записи Uniprot
Сравниваются версия 1 (28.06.11) и версия 21 (04.03.15).
Как видно на Рис1., изменился идентификатор записи в базе Uniprot,
помимо этого добавились новые штаммы археи. Также указан еще один вариант названия вида (Melanotrix concilii).
На Рис2. показано, что в запись добавлены идентификаторы белка в других базах данных (17 новых ссылок).
Как видно из этого файла, существование на уровне белка доказано только в одном случае, а все остальные белки - предсказанные, то есть их существование было доказано лишь in silico.
Можно увидеть различие в их длине, остальное же остается под покровом тайны. У фермента из Vibrio sp. описание подробнее, чем у остальных белков:
есть ссылка на PDB, описано связывание с ионами металлов.
4. Feature table
В строках FT указаны специфические особенности белка. Например, в записи о
цистеин-десульфуразе из Yersinia pestis bv. Antiqua указано присоединение пиридоксальфосфата
(активная форма витамина B6) к лизину в 226 позиции.
