1. Филогенетические деревья
Выбранные организмы.
| Название |
Мнемоника |
| Salmonella typhimurium |
SALTY |
| Enterobacter sp. 638 |
ENT38 |
| Rhodobacter sphaeroides |
RHOS4 |
| Agrobacterium tumifaciens |
AGRRK |
| Ralstonia pickettii |
RALPJ |
| Vibrio fischeri |
VIBFM |
| Pasteurella multocida |
PASMU |
| Proteus mirabilis |
PROMH |
Рис1. Выбранные организмы.
a). Скобочная формула: ((AGRRK, RHOS4), (RALPJ, (VIBFM, (PASMU, (PROMU, (SALTY, ENT38))))))
b).
Рис2. Дерево выбранных организмов.
c). Список нетривиальных ветвей:
{AGRRK, RHOS4} vs {RALPJ, VIBFM, PASMU, PROMU, SALTY, ENT38}
{AGRRK, RHOS4, RALPJ} vs {VIBFM, PASMU, PROMU, SALTY, ENT38}
{AGRRK, RHOS4, RALPJ, VIBFM} vs {PASMU, PROMU, SALTY, ENT38}
{AGRRK, RHOS4, RALPJ, VIBFM, PASMU} vs {PROMU, SALTY, ENT38}
{AGRRK, RHOS4, RALPJ, VIBFM, PASMU, PROMU} vs {SALTY, ENT38}
2. Реконструкция филогении
Рис3. Таксономия выбранных организмов.
Ветвь {AGRRK, RHOS4} содержит представителей Alphaproteobacteria, {VIBFM, PASMU, PROMU, SALTY, ENT38}
- Gammaproteobacteria, а ветвь {PROMU, SALTY, ENT38} - представителей Enterobacteriales.
Назад к странице четвертого семестра.
© Aleksei Efremov, 2016