Учебный сайт Гусевой Екатерины

О ФББ Главная страница Oбо мне Семестры
Третий семестр

Химическое строение нуклеиновых кислот

Задание 1


В этом задании с помощью программы Marvin Sketch я изобразила 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин, псевдоуридин (представлены на рисунке 1).В процессе работы я использовала готовые шаблоны. Красным цветом выделина гликозидная связь и атомы, образующие ее. Также атомы молекул пронумерованы. Использована стандартная нумерация.

Рис 1. Химические формулы 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина, псевдоуридина.

Ссылка на файл

Задание 2



В этом задании с помощью программы Marvin Sketch я изобразила участок двучепочечной ДНК (рисунок 2). Красном выделен сахаро-фосфатный остов. Каждое основание подписано. Стрелками обозначено направление хода цепи.Водородные связи в канонических парах обозначены пунктирной линией.
Рис 2. Участок двуцепочечной ДНК.

Ссылка на файл

Задание 3



В данном разделе будут расмотрены неканонические пары, образованные цитозином. На рисунке 3 представлены 4 пары, в которых 2 и более водородных связей.
  1. Каноническая пара G-C. Это классическая Уотсон-Криковская пара. В ней наблюдается оптимальное расположение центров с повышенной и пониженной электронной плотностью. Поэтому такое взаимодействие наиболее энергитически выгодно. Оно стабилзированы преимущественно электростатическими взаимодействиями.
  2. Неканоническая пара C-C. Так как для ее образования требуется поворот оснований относительно их стандартного положения и происходит отталкивание N, связь имеет большую энергию и менее устойчива.
  3. Неканоническая пара С-U. Данная пара является не очень устойчивой, так как дестабилизирующие действие оказывают аминная и кетонная группы.
  4. Неканоническая пара C-T. Также будет неустойчивой, так как будет испытывать влияние отталкавающихся О.

Рис 3. Возможные пары, образованные цитозином.

Ссылка на файл

© Гусева Екатерина, 2016 год