Учебный сайт Птицыной Елены

Cтудентки первого курса факультета биоинженерии и биоинформатики Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова

Семестр 3, практикум 9

Назад на учебную страницу Птицыной Елены

EMBOSS

В этом практикуме мы изучали EMBOSS - пакет программ для анализа последовательностей.

Задание 1, задача 4. Скрипт

По данному аннотированному файлу в формате gb (из GenBank или RefSeq) или embl (из ENA) создать файл с кодирующими последовательностями в формате fasta, добавив в описание каждой последовательности функцию белка (из поля product).

Скрипт

Запуск: $ ./pr9-1-4.sh seq.gb seq-out.fasta

Входной файл

Выходной файл