Задание 5b: рибосомальные белки бактерий
На страницу 2 семестра
В этом задании анализируются рибосомальные белки двух бактерий: Leptospirillum ferriphilum и Leptospirillum ferrooxidans. В базу данных UniProtKB были введены следующие запросы:
1)name:"ribosomal protein" (proteome:up000006177 OR proteome:up000007382). Было получено 90 результатов, 2 из которых оказались метилтиотрансферазами рибосомального белка S12. Поэтому следующий запрос был составлен несколько иначе:
2)(name:"ribosomal protein" NOT name:methylthiotransferase) (proteome:up000006177 OR proteome:up000007382). Было получено 88 результатов, представленных в Таблице 1.

Рибомосы имеются у всех бактерий. Это важная немембранная РНК-белковая органелла, состоящая (у бактерий) из 2 субъединиц: 30S (малая субъединица) и 50S (большая субъединица). В рибосомах бактерий Leptospirillum ferriphilum и Leptospirillum ferrooxidans были обнаружены следующие белки (см. Таблицу 1):

  • 30S - рибосомальные белки: S1 - S27;
  • 50S - рибосомальные белки: L1 - L32.

В PDB были обнаружены следующие рибосомальные белки (рибосома Echerichia coli, NDB ID: 4V4Q):

  • 30S - рибосомальные белки: S2 - S21;
  • 50S - рибосомальные белки: L1 - L36 (см. Таблицу 2).

Ниже в Таблице 3 приведены статьи в PubMed, относящиеся к данной теме (запрос ((bacteria[Title]) AND ribosomal protein[Title]) NOT RNA[Title] , 11 результатов, сортированы по степени популярности).

© Елена Очередько,2014.