Филогенетические деревья |
На главную |
Задание 1. Укоренение дерева в среднюю точку |
Итак, в предыдущем практикуме я построила филогенетическое дерево белка EFTS
(фактора трансляции TS) семи ранее выбранных бактерий:
![]() И теперь возникла необходимость укоренить его в среднюю точку. Для этого я воспользовалась программой retree пакета PHYLIP. Получив переукоренённое дерево, я открыла его с помощью MEGA: ![]() Как видно из Рис.2, новое дерево укоренилось в ветвь, отделяющую организмы RHIEC и BRADU от остальных организмов. Мне кажется, такое дерево может считаться правильным, т.к. оно ничем, кроме точки укоренения, не отличается от дерева, построенного ранее. |
© Елена Очередько,2016. |