Филогенетические деревья

На главную
Задание 1. Укоренение дерева в среднюю точку
Итак, в предыдущем практикуме я построила филогенетическое дерево белка EFTS (фактора трансляции TS) семи ранее выбранных бактерий:

Рис.1. Филогенетическое дерево белка EFTS


И теперь возникла необходимость укоренить его в среднюю точку. Для этого я воспользовалась программой retree пакета PHYLIP. Получив переукоренённое дерево, я открыла его с помощью MEGA:

Рис.2. Переукоренённое филогенетическое дерево белка EFTS


Как видно из Рис.2, новое дерево укоренилось в ветвь, отделяющую организмы RHIEC и BRADU от остальных организмов.
Мне кажется, такое дерево может считаться правильным, т.к. оно ничем, кроме точки укоренения, не отличается от дерева, построенного ранее.