Практикум 7. Сигналы и мотивы

Требовалось на основе выравнивания поеследовательностей из генома D. rerio высчитать информационное содержание для букв в каждой позиции, для каждой позиции и для всего выравнивания. Расчеты производились в Excel (они представлены в файле ниже на странице Лист1). Базовые частоты оснований взяты из статьи Grzegorski et al., PLoS ONE 9(9): e108475, 2014. Результат представлен в файле ниже.

homework

Также для выравнивания было построено изображение LOGO, полученное с помощью сервиса WebLOGO.

НАЗАД