Название белка: Probable bifunctional tRNA threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein
ID: A0A0W1R6K8_9EURY
Database: swissprot
Параметры по умолчанию:
Word size: 5
Expected threshold: 0.05
Matrix: BLOSUM62
Gap Costs: Existence: 11 Extension: 1
Compositional adjustments: Conditional compositional score matrix adjustmen
Выбранные белки (Accessions): Q18KI0.1, Q3IMN2.1, P36174.2, Q9HNL6.2, Q2FS43.1
Их выравнивание программой Jalview с помощью Muscle with Defaults
Все выбранные белки гомологичны, так как все они имеют много высококонсервативных участков.
Назвение вируса: African swine fever virus (strain Badajoz 1971 Vero-adapted) (Ba71V) (ASFV) (Taxonomy ID: 10498)
Название полипротеина: Polyprotein pp62
ID: PP62_ASFB7
AC: Q65179
Название выбранного белка: p15
Координаты белка в полипротеине: 2-158
Файл с последовательностью белка p15 в формате fasta
BLAST выдал 4 белка, похожих на выбранный: P0CA08.1, P0CA07.1, P0CA06.1, P0CA05.1
Выдача BLAST
Их выравнивание в Jalview
Выдача BLAST, ограниченная поиском по вирусам (Organisms: Viruses)
При поиске, ограниченном по вирусам, список находок не изменился.
E-value для белка P0CA08.1 при первом запросе был равен 3е-111, а при втором = 1е-112. То есть, доля вирусных белков в Swiss-Prot = 1е-112/3е-111 = 0.033 = 3,33%