Описание структуры белка (PDB_ID: 1DAM)
Рис.1 Общий вид структуры белка
Структура в целом
Тип макромолекул: LIGASE
Количество полимерных цепей: 1(А)
Состав биологической единицы: Одна полипиптидная цепь
Отдельные цепи
Организм: Escherichia coli
uniprot_id: P13000
Название: PROTEIN (DETHIOBIOTIN SYNTHETASE)
Функция: не найдено
Мутации относительно референса из Uniprot: 0
Модифицированные аминокислотные остатки: Нет
Рис.2 Белок с окрашенными α- и β-сприралями (в красный и жёлтый цвета соответственно)
Малые молекулы
| Короткое название |
Полное название |
| ADP |
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE |
| DTB |
6-(5-METHYL-2-OXO-IMIDAZOLIDIN-4-YL)-HEXANOIC ACID |
| PO4 |
PHOSPHATE ION |
| MG |
MAGNESIUM ION |
Рис.3 Лиганд ADP
Взаимодействия аминокислотных остатков
Рис.4 Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка (основной цепи)
Рис.5 Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот
Рис.6 Солевой мостик
Рис.7 Все цистеины белка на одной картинке (нет дисульфидной связи)
Рис.8 Стекинг