Филогенетическое дерево
Поиск диагностических позиций в выравнивании
Диагностическая позиция - такая позиция (в выравнивании), которая является общей только для группы организмов, объединенных в одну таксономическую группу, при этом эти организмы должны являться листьями нетривиальной ветви. Именно такие позиции нужно было и найти в выравнивании.
В таблице ниже представлены результаты поиска:
Таблица 1. Диагностические позиции в выравнивании | ||
---|---|---|
Таксон | Номер позиции | Картинка из Jalview |
Clostridium | 1-4 | |
Clostridium | 14 | |
Bacillales | 24 | |
Bacillales | 38 | |
Bacillaceae/Streptococcus | 256 |
*1) На последней картинке видно, что диагностические позиции распространяются сразу на два таксона - Bacillaceae и Streptococcus.
2) Для Clostridium и Bacillales приведены по две картинки, на самом деле позиций больше, но так как их слишком много, представлены только некоторые.
3) Для Stretococcaceae никаких позиций найдено не было.
⌘
© Emir Radkevich, 2016