Hа Главную
Молекулярное моделирование биополимеров
Kodomo Home

Abinitio вычисления для нафталина и азулена

1. Оптимизация структуры нафталена и азулена с помощью MOPAC
   
   

   Оптимизированная структура азулена	Оптимизированная структура нафталина


Молекула нафталина плоская изначально, однако только в UFF поле молекула азулена плоская, поэтому оптимизации будем проводить именно в нем.


2. Оптимизация геометрии молекул при помоши GAMESS
   Использованный базис - N31
   INP файлы с замененными заголовками млжно скачать: Azulene, Naphthalene
   
   
3. Расчёт энергии методом Хатри-Фока и методом теории функционала плотности
   Для расчёта по Хартри-Фоку были изменены заголовки INP файлов: Azulene, Naphthalene
   В методе теории функционала плотности заголовки файлов так же были изменены: Azulene, Naphthalene
   Полученные данными методами файлы: Azulene HF, Naphthalene HF, Azulene TDF, Naphthalene TDF
   


4. Сравнение энергий, полученных методом Хатри-Фока и методом теории функционала плотности
   
   По TOTAL ENERGY из log файлов составлена таблица:

   Вещество	Хартри-Фок	TDF
   Нафталин	-383.35	-385.64
   Азулен	-383.28	-385.58
   Δ Hartree	0,0721	0,0542
   Δ kCal/mol	45,30	34,04

   
   Энергия изомеризации нафталина в азулен составляет 35.3±2.2 kCal/mol, как вывод, метод DFT лучше.