Hа Главную
Молекулярное моделирование биополимеров
Kodomo Home
Работа с PyMOL
- Дана структура 1LMP
- Molecular sculpting
Это похоже на real-time оптимизатор геометрии, но это алгоритм, который старается сохранить значения длины связей, углов, торсионных углов при изменении координат.
- Зона контакта лиганда с белком
- До мутации не было помех для связывания субстрата с 1LMP
- После мутации VAL190 на PHE190 возможность связывания субстрата упала в связи с перекрыванием активного сайта
- Присоединение флуорисцирующей метки
Для введения метки была выбрана позиция SER81
- Построение полиаланиновой альфа-спирали
Скрипт для построения данной спирали можно посмотреть здесь
© Кузнецов Виктор Петрович