Построение филогенетического дерева

Отобранные бактерии

Название бактерии Clavibacter michiganensis Corynebacterium diphtheriae Leifsonia xyli Mycobacterium leprae Mycobacterium tuberculosis Rubrobacter xylanophilus Streptomyces avermitilis
Мнемоника CLAMS CORDI LEIXX MYCLE MYCTU RUBXD STRAW
Таксономия Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Clavibacter Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Rubrobacteria; Rubrobacterales; Rubrobacteraceae; Rubrobacter Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces

Скобочная формула дерева

((((LEIXX, CLAMS), STRAW), ((MYCLE, MYCTU), CORDI)), RUBXD);

Изображение дерева

sorry :c
Филогенетическое дерево на основании представленного в задании. Расшифровки мнемоник в таблице выше

Нетривиальные ветви дерева

Мы называем ветвь нетривиальной, если она разбивает множество листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента.

  1. {MYCTU, MYCLE} vs {CORDI, LEIXX, CLAMS, STRAW, RUBXD}
  2. {MYCTU, MYCLE, CORDI} vs {LEIXX, CLAMS, STRAW, RUBXD}
  3. {LEIXX, CLAMS} vs {MYCTU, MYCLE, STRAW, RUBXD, CORDI}
  4. {LEIXX, CLAMS, STRAW} vs {MYCTU, MYCLE, CORDI, RUBXD}

Нетривиальные ветви, совпадающие с разделением по таксонам

Помимо нижеперечисленных, на дереве прослеживается разделение между Actinomycetes и Rubrobacteria, но оно соответствует тривиальной ветви, где в одну из групп выделяется Rubrobacter xylanophilus.

Ветвь Таксон
{MYCTU, MYCLE} Mycobacterium (род)
{MYCTU, MYCLE, CORDI} Mycobacteriales (порядок)
{LEIXX, CLAMS} Micrococcales (порядок)

I don't know how to make footer properly. You may as well pretend you haven't seen this phrase!

↩ К странице семестров