Практикум 1.

Поиск в PDB и основы визуализации.

Найденная мной запись - о репрессоре, отвечающем на ниацин* (NiaR). Это транскрипционный репрессор генов, отвечающих за биосинтез НАД. NiaR сработывает в ответ на повышение уровня ниацина. НАД - жизненно важная молекула, задействованная в множествах ОВР как донор или акцептор электронов. Соглаcно записи, семья репрессов, отвечающих на ниацин (NiaR), широко представлена как в группах Bacillus/Clostridium, так и в Fusobacteria и Thermotogales. Структура NiAr содержитв в себе 2 домена: ДНК-связывающий домен N-конца и регуляторный домен С-конца, содержащий в себе сайт связывания с металлом. Так же имеется ион цинка в соответсвтвующей субъединице. Он окружен консервативной последовательностью в С-концевом домене. Ниацин расположен в гидрофобном кармане рядом с ионом цинка в С-концевом домене.

*ниацин - никотиновая кислота

Ccылка на скачивание