На главную

Краткое описание генома вируса Ilheus virus

Вирус Зика (Ilheus virus) - возбудитель лихорадки Зика, переносчиком которой являются комары. В природе вирус циркулирует между комарами и птицами, но им может заразиться и человек [1]. Симптомами Лихорадки Зика являются умеренное повышение температуры, сыпь, головные боли, боль в суставах, боль в мышцах. На четыре случая заражения приходится один, когда симптомы не проявляться. Возможны также более тяжелые проявления, в том числе развитие энцефалита [2]. В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вид Ilheus virus [3].

Таблица 1.Некоторые основные данные о геноме Ilheus virus
Параметр Значение
Латинское название вируса Ilheus virus
Русское название вируса Вирус Зика
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 10755
Количество кодируемых в геноме белков 1

 
>gi|126010841|ref|YP_001040006.1| polyprotein [Ilheus virus]
MSKKPGKSAAKRTVNMLKRLASVSPSRGRRTIRRMLDVRGAPRLILALMAFFRFAAIKPTLGLKKRWRSV
NKTVAVKHLTNFKKELTTMLDSVNKRKEKKKSFSTALLWITMITAVAGLKISSHRDRPLLMVNKTDVSDA
IPVPSVKGTNMCTIRALDVGYTCAYDTTYECPHLEVTMDPEDIDCWCTLESVYVNYGLCKQNHHVRRGRR
AINIPHHGESHLENRATPWMDTTKTTKYLTKVENWVIRNPGYALVALATAWMLGSNTPQRVVFMIMMMLI
APAYSLNCLGISNRDFVEGLSGGTWVDIVLEGGSCVTVMAKDKPTLDIKLIRMEAKDLATVRSYCYQATV
TDSSTEARCPTMGEAHNSKSLDASYVCKSSYVDRGWGNGCGLFGKGSIQTCVKFSCPGKATGKSIQRENL
NYDVAVYVHGPISAAAHGNYTAQLTGKYAAKFSITPSAPTYTANLGEYGEATMECEPRAALDIDNYYVMS
LNNKHWLVNRDWFHDLDLPWTGPATESWKNRESLIEFEEPHATRQTVVALGNQEGALHTALAGAIPVEVS
STTLTLNSGHLKCRLKLDKLKIKGTTYAMCKGTFAFAQTPVDTGHGTIVAELTYTGTDGPCKIPISMTAD
LRDMTPIGRLVTVNPIIPSSAKSQKILVELEPPFGSSFILVGQENNQIKYQWHKTGSTIGNALKTTWKGA
QRFAVLGDTAWDFGSVGGIFNSIGKTIHGVFGTAFRSLFGGMSWVTQALMGALLLWLGISARERTVSLIM
LSVGGILLFLAVNVHADTGCAIDMARRELKCGSGIFIHNDVETWRNNYKYHPLTPRGFAKVIQMSKDKGV
CGIRSVGRLEHEMWEAIAPELNAIFEDNGVDLSVVVKGQTGIYKRAPKRLTETKDEMSFGWKNWGKSFIF
STETANSTFIVDGPESKECPTSDRAWNSLELEDFGFGIISTKIFLKVNEQRGNSCDSAVIGTAVKGNEAV
HSDLGFWIQSTKNESWQLERAVLGEVKSCTWPESHTLWGDGVEESDLIIPITLAGPKSHHNMRPGYKTQT
KGPWHEETPLVIEFAECPGTTVTQEESCGGRGPSIRTTTASGRTIRNWCCKNCTLPPLRFMAGENCWYGV
EVRPKRENEETLIKSKVSAGNGQTIEPFQLGILMAFVFTQEVLRRRWTANLALPTSALLMACFIFGGFTY
LDLFRYFILVGAAFAEANSGGDVVHLAMIAAFNIQPVALVTTFFRKNWTNRENMILIIAAACTQMACMEL
KIELFHVMNSLSLAWMILKALTTGTTSTLAMPFLAALSPPMNWLGLDVVRCLLIMAGVAALISERRESLA
KKKGALLISAALALTGAFSPLVLQGALMFTQSLGKRGWPASEVLTAVGMTFALAGSVARLDGGTMAIPLA
TMAILAVAYVLSGKSTDMWLERCADISWINEAEITGTSPRLDVELDSNGDFKMINDPGVPMWMWTCRMGL
MAMAAYNPVLIPVSMAGYWMTVKIHKRGGVMWDVPAPKQFGKTELKPGVYRVMTMGILGRYQSGVGVMWD
GVFHTMWHVTQGAALRNGEGRLNPTWGSVRDDLISYGGKWKLSATWNGSEEVQMIAVEPGKAAKNYQTKP
GVFKTPAGEIGAITLDFPKGTSGSPIINKAGEITGLYGNGIVLERGAYVSAITQGERQEEETPEAFTPDM
LKKRRLTILDLHPGAGKTRRVIPQIVRECVKARLRTVILVPTRVVAAEMAEALRGLPIRYQTSAVKAEHS
GNEIVDAMRHATLTQRLLTPAKVPNYNVFVMDEAHFTDPASIAARGYISTKVELGEAAAIFMTATPPGTT
DPFPDSNAPIIDQEAEIPDRAWNSGFEWITEYTGKTVWFVPSVRMGNEIAMCLTKAGKKVIQLNRKSYDS
EYQKCKGNDWDFVITTDISEMGANFGAHRVIDSRKCVKPVILDGDDRVLMNGPAPITPASAAQRRGRIGR
DPTQSGDEYFYGGPTTTDDTGHAHWIEAKILLDNIQLQNGLVAQLYGPERDKVFTTDGEYRLRSEQKKNF
VEFLRTGDLPVWLSYKVAEAGYAYTDRRWCFDGPANNTILEVRGDPEVWTRQGEKRILRPRWSDARVYCD
NQALRSFKEFAAGKRSAGSVMEVMGRMPDYFWTKTLNAADNLYVLATANKGGRAHQAALEELPDTVETIL
LMTMMCVASLGMFTLMVHRRGLGKTGLGTLVLATVTVLLWISDVPAPKIAGVLLIAFLLMIVLIPEPEKQ
RSQTDNHLAIFLVCVLLLIGAVSANEMGWLETTKKDIGKLFRSSGDTQEQSTWQSWAPEVRAATAWAGYA
GLTVFLTPLFRHLITTQYVSFSLTAITAQASALFGLSAGYPFVGIDLAVGFLLLGCYGQYNLPTAVATGL
LLLAHYGYMIPGWQAEAMRAAQKRTAAGVMKNAVVDGIVATDIPEVDTATPITEKKLGQILLILLCGASL
LVKFDTMVLVEAGVLTTSAMATLIEGNANTVWNSTVAVGVCHLMRGAWLAGPSIGWTIVRNLENPKLKRG
GGSAPTLGEIWKAQLNQLTREEFMAYRRDGILEVDRTQARRARQSGITTGGHPVSRGTAKLRWMVERGFV
RPIGKVVDLGCGRGGWSYYCATLRHVQEVRGYTKGGPGHEEPVMMQSYGWNIVTMKSGVDVFYKPTESCD
TLLCDIGESSSSVGVEEARTLRVLDMVEPWLRAANSFCIKVLCPYTPKVIERLERLQRAYGGGLVRVPLS
RNSTHEMYWVSGASSNIINAVTVTSQILVQRMNKGCRHGPRYEEDVCLGSGTRAVATQASPSDHTKIKHR
LERLRKEFSATWHIDLEHPYRTWHYHGSYEVQPTGSANSMVNGVVRLLSKPWDAITSVVTMAMTDTTPFG
QQRVFKEKVDTRAPDPAVGVAQALDITTGWLWTFLARSKKPRMCTREEFIAKVNSNAALGAVFDEQNQWS
TAREAVEDPAFWNLVDEERKAHLAGRCETCIYNMMGKREKKLGEFGKAKGSRAIWYMWLGARFLEFEALG
FLNEDHWMSRENSLGGVEGQGLQKLGYILRDISHLEGGNMFADDTAGWDTRITRADLENEAKVMNMMDGE
HKQLAKAIIELTYRHKVVKVMRPARGGKTVMDIISREDQRGSGQVVTYALNTFTNLAAQLVRCMEGEELL
TESDVHGLSPKKKQAVRNWLIQNGRERLSRMAVSGDDCVVKPIDDRFASALHFLNGMAKIRKDTQEWKPS
VGWSNWQEVPFGSHHFNELLMKDGRTIVVPCRSQDELVGRARVSPGSGWSLRETACLSKAYAQMWLLMYF
HRRDLRLMANAICSAVPVDWVPTGRTTWSIHGKGEWMTTEDMLQVWNRVWIEDNEHMEDKTPITSWTDIP
YIGKREDQWCGSLIGTRQRATWAENIYTPIMQIRNLIGDEKYVDCMVSQHRFETPSPVLFTGAI 

    Источники:
  1. Barbara W. Johnson, Cristopher Cruz, Vidal Felices, William R. Espinoza, Stephen Robert Manock, Carolina Guevara, James G. Olson and Tadeusz J. Kochel "Ilheus Virus Isolate from a Human, Ecuador"
  2. "Инфекция, вызванная вирусом Зика – Бразилия и Колумбия" Новости о вспышках болезней, ВОЗ.
  3. NCBI

© Екатерина Посицельская, 2015