Для работы был выбран фермент:
Di-Zinc Metallo-beta-lactamase VIM-4 from Pseudomonas aeruginosa
PDB ID: 2whg; Разрешение структуры 1.9, Полнота 98.7.
Рисунок 1. Электронная плотность и остов полипептидной цепи
На рисунках 2-4 значение электронной плотности в сигмах, по которому строится поверхность (уровень) = 1.5, отображаемая область плюс к минимальному параллелепипеду область пространства 0.5 А.
Рисунок 2. GLU 38
Рисунок 3. HIS 114
Рисунок 4. ILE 57
Заключение: структура в целом достаточно хорошего качества, хотя отдельные отклонения наблюдаются. Это соответствует хорошему разрешению (в пределах условных границ 1.5 – 2.5 Å) в сочетании с высоким значением полноты.