Для поиска гидрофобных кластеров был использован сервис CluD: http://mouse.belozersky.msu.ru/npidb/cgi-bin/hftri.pl
Выбранные параметры: порог расстояния - 4.8 А; порог размера кластера - 50 атомов.
Рисунок 1. Гидрофобные кластеры, найденные для каждой цепи в димере
Рисунок 2. Ядро (81 атом в мономере), заключенное между бета-листом и двумя альфа-спиралями.
Рисунок 3. Ядро (67 и 65 атомов), заключенное между бета-листом и концами двух альфа-спиралей.
Рисунок 4. Ядро (66 атомов в мономере), образованное петлями и окруженное концами четырех альфа-спиралей.
Рисунок 5. Все найденные для димера гидрофобные кластеры.
Мономеры удерживаются вместе гидрофобным взаимодействием
Рисунок 6. Гидрофодный кластер (282 атома), прилегающий к бета-листу, сложенному из листов двух мономеров.
Рисунок 7. Гидрофодный кластер (58 атома), прилегающий к бета-листу в месте взаимодействия мономеров.