Седьмой семестр

Кристалл из белков

Взаимодействие с белками из соседних ячеек в кристалле

Кристаллографические характеристики:
CRYST1 141.390 46.220 105.990 90.00 105.24 90.00 C 1 2 1 8

Длины векторов (angstrem): a = 141.390; b = 46.220; c = 105.990.
Углы между векторами (grad): alfa = 90.00; beta = 105.24; gamma = 90.00.
Кристаллографическая группа: С1.
Число молекул в ячейке: 8.


Рисунки 1-2. Кристалл 2WHG

Взаимодействие белков в ячейке

На рисунках 3-9 изображены основанные на водородных связях контакты белка, расположенного по центру кристаллической ячейки с остальными семью, частично попадающими в ячейку.

Рисунок 3. Три связи через молекулы воды

Рисунок 4. Одна связь через две молекулы воды

Рисунок 5. Две связи через молекулы воды

Рисунок 6. Одна связь через две молекулы воды

Рисунок 7. Четыре связи через молекулы воды

Рисунок 8. Четыре связи через молекулы воды

Рисунок 9. Четыре связи через молекулы воды


Рисунки 10-11. Взаимодействие соседних белков в кристалле: общий вид

ДНК-белковый комплекс 1MNM

Рисунок 12. Взаимодействие с соседними в кристалле молекулами, расположенными вдоль одной цепи ДНК.

Рисунок 13. Взаимодействие с соседними в кристалле молекулами, расположенными на соседних цепях.

Хвостик дополняет бета-лист соседней в кристалле молекулы.

Асимметрические и биологические единицы на примере структуры 6DGN

Рисунок 14. Асимметрическая единица - наименьшая часть кристалла, повторением и движением которой в соответствии с симметриями кристалла можно получить элементарную ячейку.

Рисунок 15. Биологическая единица - четвертичная структура, которая считается функциональной формой макромолекулы.