<!DOCTYRE html>
<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Структура белка</TITLE>
<META CRARSET="utf-8">
<H1 align="center">Визуализация белка трегалозо-6-фосфата гидролазы <i>Bacillus licheniformis</i></H1>
<Br> <Br><Br>
<script type="text/javascript"
src="http://vsb.fbb.msu.ru/share/jmol/jsmol/JSmol.min.js">
</script>


<script type="text/javascript">
var Info = {
    serverURL: "http://vsb.fbb.msu.ru/share/jmol/jsmol/php/jsmol.php",
    j2sPath: "http://vsb.fbb.msu.ru/share/jmol/jsmol/j2s/",
    use: "HTML5",

    width: 600,
    height: 600,
    color: "#eeffff",
    script: "load =5BRQ"
    };


$(document).ready(function(){
  $("#jmol").html(Jmol.getAppletHtml("JSMol", Info));
  $("#jmolStart").html(Jmol.jmolButton(JSMol, 'script http://kodomo.fbb.msu.ru/~esurikova/script_pr1.spt', 'Start script'));
  $("#jmolResume").html(Jmol.jmolButton(JSMol, 'resume', 'Resume'));
  });
</script>
</HEAD>

<BODY bgcolor="#7bccb5" text="#0e4737" link="#006A80" vlink="#327B67" alink="#8D635E" leftmargin="40" topmargin="60" rightmargin="40">

<table align="center"> <tr> <td id='jmol'> </td> </tr> </table>
<table border = 0pt align="center"> <tr> <td id='jmolStart'> </td> </tr> </table>
<table border = 0pt align="center"> <tr> <td id='jmolResume'> </td> </tr> </table>
<p>

Скрипт: 
<a href="script_pr1.spt">скачать</a> <p>

Таблица 1. Параметры водородных связей между остовными атомами в альфа-спирали<BR>
<TABLE border="1" bordercolor="white" cellpadding="5" >
 <th>#</th>
 <th>Имена атомов</th>
 <th>Длина связи (Å)</th>
 <th>Угол N-O-C (°)</th>
<TR> <TD> 1 </TD> <TD> [GLU}309:A.N#2525 <Br> [LYS]305:A.O#2497 </TD> <TD> 3,01 </TD> <TD> 156,4 </TD> </TR>
<TR> <TD> 2 </TD> <TD> [LYS]305:A.N#2494 <Br> [LEU]301:A.O#2463 </TD> <TD> 2,98 </TD> <TD> 150,6 </TD> </TR>
<TR> <TD> 3 </TD> <TD> [GLY]317:A.N#2598 <Br> [GLU]313:A.O#2567 </TD> <TD> 2,84 </TD> <TD> 153,4 </TD> </TR>
</TABLE> <p>
Таблица 2. Параметры водородных связей между остовными атомами в бета-тяжах<BR>
<TABLE border="1" bordercolor="white" cellpadding="5" >
 <th>#</th>
 <th>Имена атомов</th>
 <th>Длина связи (Å)</th>
 <th>Угол N-O-C (°)</th>
<TR> <TD> 1 </TD> <TD> [ARG]496:A.N#4057 <Br> [LEU]503:A.O#4114 </TD> <TD> 2,95 </TD> <TD> 141,2 </TD> </TR>
<TR> <TD> 2 </TD> <TD> [TYR]492:A.N#4020 <Br> [ASN]507:A.O#4145 </TD> <TD> 2,84 </TD> <TD> 161,0 </TD> </TR>
<TR> <TD> 3 </TD> <TD> [TYR]494:A.N#4037 <Br> [VAL]505:A.O#4130 </TD> <TD> 3,00 </TD> <TD> 157,8 </TD> </TR>
</TABLE> <p>
В данной выборке длина водородных связей варьируется от 2,84 до 3,01 Å для альфа-спирали и от 2,84 до 3 Å для бета-тяжей. Угол меняется  впределах от 150,6° до 156,4° для альфа-спирали и от 141,2 до 161 для бета-тяжей. <Br>
Согласно статистическим данным длина водородной связи состовляет несколько меньше 3 Å, а угол N-O-C стремится к 180°, так как такие характеристики обеспечивают наибольную силу связи. 
Различия с реальными параметрами объясняется влиянием других взаимодействий внутри белка.  
<p>
<HR color="#0e4737">
&#169 Сурикова Елена 2016
</BODY> 
</HTML>