Для задания выбрана глюкогидродлаза Bacillus amyloliquefaciensс c идентификатором A0A1T3TZD4.
Был произведён поиск в BLAST с параметрами: порог E-value - 20, максимальное количество выдаваемых белков - 250, WordSize = 6. Информация о выбранных находках представлена в таблице 1.
Таблица 1.
| Идентификатор белка | Название белка | Coverage, % | Identity, % | E-value | Гомологичность |
| O05242.2 | Oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | 100 | 75 | 0.0 | Да |
| Q45101.1 | Oligo-1,6-glucosidase | 99 | 48 | 0.0 | Да |
| P39795.2 | Trehalose-6-phosphate hydrolase | 99 | 44 | 3e-163 | Да |
| Q59905.1 | Glucan 1,6-alpha-glucosidase | 99 | 45 | 2e-162 | Да |
| P28904.3 | Trehalose-6-phosphate hydrolase | 98 | 40 | 1e-139 | Да |
| Q08295.1 | Oligo-1,6-glucosidase IMA2 | 99 | 40 | 7e-119 | Да |
| P38158.1 | Alpha-glucosidase MAL32 | 99 | 39 | 3e-114 | Да |
| P30270.1 | Alpha-amylase | 53 | 24 | 0.003 | Нет |
| P19571.1 | Glucan 1,4-alpha-maltohexaosidase | 31 | 22 | 4.0 | Нет |
Выравнивание представлено на изображении:
Для задания выбраны белки семейства ZZ. В таблице 2 представлена информация о них.
Таблица 2.
| Идентификатор белка | Архитектура белка | Организм |
| W1PZJ0 | PB1, ZZ, N_BRCA1_IG | Amborella trichopoda |
| A0A024UF97 | ZZ x 3, N_BRCA1_IG | Aphanomyces invadans |
Был выполнен поиск в BLAST с параметрами E-value = 1.0E-5, WordSize=2. Построенная карта локального сходства:
На карте горизонтальная ось - последовательность A0A024UF97, верикальная - W1PZJ0.
Последовательность A0A024UF97: AAB'CB''AB'DB''EFNGZLJ.
Последовательность W1PZJ0: AB'B''FSGKZJ.
Дважды дуплицированный домен ZZ в последовательности A0A024UF97. Вставки доменов С и D разбивают домен B'B'' единый в другой последовательности на два. Домен E присутствует только в A0A024UF97, из чего можно заключить, что данный домен либо вставился в эту последовательность, либо произошла его делеция в другой последовательности. Участки N и S негомологичны. Домены G, Z, J разбивает вставка в W1PZJ0 домена K (или его делеция из другой последовательности) и вставка домена L в A0A024UF97(или его делеция из другой последовательности).