Оригинальная хромотограмма прямой последовательности, обратной.
Обратное прочтение было подвергнуто Reverse+Complement, что позволило использовать его для корректировки прямого прочтения.
Также были отрезаны нечитабельные участки хромотограммы на 3' и 5' концах прямого прочтения (большой уровень шума, неправильная форма пиков, неравномерный сигнал).
В таблице 1 представлены основные характеристики хромотограммы:
| Характеристика | Значение для прямого прочтения | Значение для обратного прочтения (после reverse+complement) |
| Длина начального нечитаемого участка | 56 (7,8 % хромотограммы) | 11 (1,5% всей хромотограммы) |
| Длина конечного нечитаемого участка | 38 (5,3 % хромотограммы) | 51 (7,0% всей хромотограммы) |
| Оценка соотношения сигнала и шума >/td> | 10-25% | 10-25% |
| Неравномерность силы сигнала и шума вдоль последовательности | есть области с неравномерной величиной сигнала, области с более высоким шумом | есть области с неравномерной величиной сигнала, области с более высоким шумом |
На позиции 81 N было заменено на G, основываясь на данных обратного чтения. Сложно уверенно заявить, что там находится имеено остаток гуанина, так как у аппарата в обратном прочтении также возникли затруднения на этом месте.
На позици 116 N был заменён на G, основываясь на данных обрaтного чтения.
На позициях 425 и 452 можно было бы предположить полиморфизм, но общий уровень шума и обратное прочтение подсказывают однозначные замены N на G и A.
Исправленная прямая последовательность.
Проект выравнивания исправленной прямой и перевёрнутой обратной цепочек .
Выравнивание представлено на изображении 1:
Перекрывающиеся пики, их неправильная форма, неравномерность интенсивности сигнала - слишком много шума для того, чтобы можно было прочитать эту последовательность.