Асимметрическая единица - это минимальная часть структуры, из которой можно восстановить весь кристалл, используя кристаллографические симметрии.
Биологическая единица - минимальная биологически функциональная часть белка.
Для того, чтобы привести пример записи в PDB, где асимметрическая единица меньше биологической я воспользовалась advanced search с условиями Number of Chains (Asymmetric Unit) = 1, Number of Chains (Biological Assembly) между 2 и 4.
Ниже представлены биологическая и асиммиметрическая единицы структуры 6L67.
Изображение 1.1 6L67. Биологическая единица, гомодимер. | Изображение 1.2 6L67. Асимметрическая единица, мономер. |
Для того, чтобы привести пример записи в PDB, где асимметрическая единица меньше биологической я воспользовалась advanced search с условиями Number of Chains (Asymmetric Unit) между 2 и 4, Number of Chains (Biological Assembly) = 1.
Ниже представлены биологическая и асиммиметрическая единицы структуры 6NTE. В асимметрической единице две молекулы белка, вероятно, это артефакт условий кристаллизации, так как согласно авторам статьи методом эксклюзионной хроматографии установлено, что белок - мономер.
|
|
Изображение 2.1 6NTE. Биологическая единица, мономер. | Изображение 2.1 6NTE. Асимметрическая единица, "димер". |