Краткое описание генома вируса Lettuce ring necrosis virus

Вирус вызывает кольцевой некроз латука, поражающий Латук посевной (Lactuca sativa), внешне проявляющийся в появлении на листьях салата в теплицах зимою зачастую сливающихся некротических колец и кругообразных узоров. Поражённые листья могут разлагаться. Заболевание передаётся через почву зооспорами Olpidium brassicae. Инкубационный период - 7 недель [1].
В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вирус.

Таблица 1.
Параметр Значение
Английское (или латинское) название вируса Lettuce ring necrosis virus
Русское название вируса Кольцевой некроз латука
Количество фрагментов в полном геноме 4
Общая длина генома (п.н.) 12425
Количество кодируемых в геноме полипептидов 5
Количество "зрелых" вирусных белков 5

Последовательность самого короткого белка: 
>YP_053240.1 37 kDa protein
msffgqwiqyidpiitralsilphlreiinialkpfnginllddhdrthlanrirfiesk
lsligeekanieildkntrkmiivfyseklkqlerkmirefmlpvfthltnpgmslfdik
qnnfynfyseeleesmmlpekefsipplkrsilrtlengldylmrnhprrsattlnridy
lksvgkrgekqeihgvehisnyqavdsvgfctylwneigavkniflnqflhlgvdssyvi
lfphgcfsilekhsmnsmileeifdkviielclsikilqstdtynntlieffypsrpiss
kiqkirdlekqtknkyhsvnf

Источники:
SpringerLink: Lettuce ring necrosis, caused by a chytrid-borne agent distinct from lettuce big-vein ‘virus’

© Сурикова Елена 2016