Гипотетическая бактериальная ацилтрансфераза YFDW (hypothetical E. coli protein YFDW)

На главную страницу первого семестра

Гипотетическая бактериальная ацилтрансфераза YFDW (Hypothetical protein YFDW from E. coli)

1. Название белка - YFDW_ECOLI.

2. Название организма - Esherichia coli K-12

3. Название гена - frc

4. Номер локуса в бактериальной хромосоме - b2374

5. Последовательность в формате FASTA 

>FCTA description                                         
MSTPLQGIKVLDFTGVQSGPSCTQMLAWFGADVIKIERPGVGDVTRHQLRDIPDIDAL
YFTMLNSNKRSIELNTKTAEGKEVMEKLIREADILVENFHPGAIDHMGFTWEHIQEIN
PRLIFGSIKGFDECSPYVNVKAYENVAQAAGGAASTTGFWDGPPLVSAAALGDSNTGM
HLLIGLLAALLHREKTGRGQRVTMSMQDAVLNLCRVKLRDQQRLDKLGYLEEYPQYPN  
GTFGDAVPRGGNAGGGGQPGWILKCKGWETDPNAYIYFTIQEQNWENTCKAIGKPEWI
TDPAYSTAHARQPHIFDIFAEIEKYTVTIDKHEAVAYLTQFDIPCAPVLSMKEISLDP
SLRQSGSVVEVEQPLRGKYLTVGCPMKFSAFTPDIKAAPLLGEHTAAVLQELGYSDDE
IAAMKQNHAI

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав

A(аланин) 0,08894
C(цистеин) 0,01683
D(аспарагиновая кислота) 0,05769
E(глутаминовая кислота) 0,06490
F(фенилаланин) 0,03606
G(глицин) 0,08894
H(гистидин) 0,02644
I(изолейцин) 0,06731
K(лизин) 0,05288
L(лейцин) 0,08413
M(метионин) 0,02644
N(аспарагин) 0,03606
P(пролин) 0,05769
Q(глутамин) 0,04808
R(аргинин) 0,03846
S(серин) 0,04567
T(треонин) 0,06010
V(валин) 0,05529
W(триптофан) 0,01683
Y(тирозин) 0,03125

Длина последовательности — 416 а. о.

Молярная масса — 45833 г/моль

Средний заряд молекулы:

+61,96e при pH=1

+1,23e при pH=7

–2,33e при pH=8

Отношение содержания гидрофобных остатков (A, F, C, I, L, M, V) к содержанию гидрофильных остатков (D, E, H, K, R, Q, N, S, G, P, T, W, Y) — 1,013, что позволяет думать, что этот белок не является мембранным.

©Петрова Ирина