На главную страницу второго семестра
Выравнивание вручную произведено в редакторе Far'а, первая строка содержит последовательность первых 60 аминокислотных остатков белка FCTA_ECOLI с расставленными на глаз гэпами, вторая строка - искусственную последовательность, третья строка сформирована по следующему принципу: в столбцах, в которых аминокислотные остатки совпадают, стоит звездочка (*), в столбцах, в которых не совпадают, стоит точка (.), в столбцах, содержащих гэп, стоит прочерк (-). Вычислен вес выравнивания, как число совпадений остатков минус число несовпадений минус число гэпов. С выравниванием можно ознакомиться здесь. Выравнивание в программе GeneDoc. Выровнены последовательности белков FCTA_ECOLI из Escherichia coli и FCTA_SHIFL из Shigella flexneri. Они изначально абсолютно идентичны, это не артефакт! С выравниванием можно ознакомиться здесь.