Банк EMBL

На главную страницу третьего семестра

Идентификатор записи EMBL	Тип молекулы	Класс данных	Раздел EMBL	Дата создания	Описание	Длина последовательности
U00096	circular genomic DNA	STD	PRO	23-FEB-2006	Escherichia coli K12 MG1655, complete genome.	4639675
AP009048	circular genomic DNA	STD	PRO	22-JAN-2006	Escherichia coli W3110 DNA, complete genome.	4646332

Итак, мы имеем две записи, содержащие последовательности генома кишечной палочки разных штаммов. Можно отметить большую длину второй последовательности, принципиальных же различий не наблюдается. Если отыскать в этих документах участки, кодирующие белок FCTA_ECOLI, то можно отметить, как видно из таблицы, их одинаковую длину при разных координатах (записи геномов имеют разную длину, как мы уже выяснили).

	I	II
ID записи	AP009048	U00096
Начало гена в записи	2497450	2490026
Конец гена в записи	2498700	2491276
Направление гена	Обратное	Обратное

Последовательности исследуемого гена (frc), извлеченные из этих геномов, совпадают на 100%.

Знакомство с записью гена из эукариотического генома

Исследован ген LTA. Схематично его запись можно изобразить следующим образом.

Комплементарная цепь

<--[369705..370745]--[370993..371098]--[371185..371292]--[371580..371710]---

Всего в гене имеется 4 экзона, самый длинный из них имеет длину 1040 нп, самый короткий - 105 нп. Самый длинный интрон имеет длину 288 нп, самый короткий - 87 нп.