Отчет по работе с базой данных InterPro

На главную страницу второго семестра

По AC P69902 в базе данных InterPro обнаружила только один документ с идентификатором IPR003673. Полное название его - L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F. Это типичные белки обширного семейства белков, содержащих формил-КоА-трансферазный домен. Их функция, однако, этим доменом не определяется, т.к. они содержат и другие домены, но FCTA_ECOLI содержит только 1 домен, поэтому обладает только указанной ацилтрансферазной активностью. К этому семейству относится 921 белок. Функции этих белков достаточно разнообразны, в частности, к ним относятся КоА-рацемазы жирных кислот, например арилпропионил-КоА-эпимераза, ключевой фермент в инверсионном метаболизме ибупрофена, карнитиндегидратаза и белок F желчнокислого оперона (bile acid-inducible operon protein F).

Здесь показаны подписи в молекуле FCTA_ECOLI

Можно отметить, что подписью базы данных Pfam является последовательность домена CoA_transf_3, а подписью базы данных PANTHER является вся последовательность белка, причем называется подпись CAIB_BAIF. Возможно, это связано с тем, что такая последовательность в более-менее неизменном виде входит в многие белки этого семейства.