Идентификатор документа PROSITE (AC) |
Название мотива |
Краткое описание мотива |
Тип подписи (паттерн, профиль) |
Паттерн (регулярное выражение) |
Специфична ли подпись? |
Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00008 |
MYRISTYL |
Сайт N-миристоилирования |
паттерн |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
неспецифична |
12 |
PS00005 |
PKC_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорилирования протеинкиназы |
паттерн |
[ST] - x - [RK] |
неспецифична |
6 |
PS00007 |
TYR_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорилирования тирозина |
паттерн |
[RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y |
неспецифична |
1 |
PS00001 |
ASN_GLYCOSYLATION |
Сайт N-гликозилирования |
паттерн |
N - {P} - [ST] - {P} |
неспецифична |
1 |
PS00006 |
CK2_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорилирования
казеинкиназы II
|
паттерн |
[ST] - x(2) - [DE] |
неспецифична |
7 |
PS00003 |
SULFATION |
Сайт сульфирования тирозина |
паттерн |
Паттерн как таковой неизвестен. Но известны некоторые признаки этого сайта:
Наличие кислотных остатков на расстоянии 2 аминокислот от тирозина
Наличие хотя бы 3 кислотных остатков в позициях от -5 до +5
Не более 1 основного остатка и 3 гидрофобных остатка в позициях от -5 до +5
Наличие остатков, индуцирующих образование петли: хотя бы 1 глицин или пролин в позициях от -7 до -2 и от +1 до +7 или хотя бы 2 аспарагина, серина или аспарагиновой кислоты в позициях от -7 до +7.
Отсутствие N-связанных гликанов рядом с тирозином. |
неспецифична |
2 |
В последовательности FCTA_ECOLI найдены мотивы, описанные в базе данных PROSITE, причем ни одного специфичного мотива не обнаружено.