Мотивы в белке FCTA_ECOLI, описанные в банке данных PROSITE

  На главную страницу второго семестра
  В последовательности FCTA_ECOLI найдены мотивы, описанные в базе данных PROSITE, причем ни одного специфичного мотива не обнаружено.
Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 12
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования протеинкиназы паттерн [ST] - x - [RK] неспецифична 6
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования тирозина паттерн [RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y неспецифична 1
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION Сайт N-гликозилирования паттерн N - {P} - [ST] - {P} неспецифична 1
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST] - x(2) - [DE] неспецифична 7
PS00003 SULFATION Сайт сульфирования тирозина паттерн Паттерн как таковой неизвестен. Но известны некоторые признаки этого сайта:
    Наличие кислотных остатков на расстоянии 2 аминокислот от тирозина
    Наличие хотя бы 3 кислотных остатков в позициях от -5 до +5
    Не более 1 основного остатка и 3 гидрофобных остатка в позициях от -5 до +5
    Наличие остатков, индуцирующих образование петли: хотя бы 1 глицин или пролин в позициях от -7 до -2 и от +1 до +7 или хотя бы 2 аспарагина, серина или аспарагиновой кислоты в позициях от -7 до +7.
    Отсутствие цистина
    Отсутствие N-связанных гликанов рядом с тирозином.
неспецифична 2

©Петрова Ирина