HutP_Bacsu
HutP регулирует экспрессию гистидиновых структурных генов сенной палочки с помощью антитерминационного механизма при участии ионов магния и L-гистидина. Механизм основан на узнавании HutP троек триплетов UAG, разделенных четырьмя нуклеотидами в зоне терминации. HutP формирует гомогексамер, связывает магний и L-гистидин, а затем РНК-последовательности, после чего дестабилизирует структуру терминатора.
Изображение белка
Основная информация о белке
Число аминокислотных остатков | 148 | Молекулярная масса | 48845.91 | Полимерные цепи | A B C |
Наглядное представление полипептидных цепей
Последовательность в fasta-формате
>sp|P10943|HUTP_BACSU Hut operon positive regulatory protein OS=Bacillus subtilis GN=hutP PE=1 SV=4 MTLHKERRIGRLSVLLLLNEAEESTQVEELERDGWKVCLGKVGSMDAHKVVAAIETASKK SGVIQSEGYRESHALYHATMEALHGVTRGEMLLGSLLRTVGLRFAVLRGNPYESEAEGDW IAVSLYGTIGAPIKGLEHETFGVGINHI
Другие составляющие комплекса
Лиганды | Гистидин × 3 | Металлы | Магний × 3 | Молекулы воды | × 578 |
Формирование комплекса
В представленной модели GC богатый регион выделяется красным, РНК-связывающие элементы - розовым и зеленым.
Step A: формирование гексамера, обладающего гидрофобными характеристиками.
Step B: присоединение трех молекул L-гистидина.
Step C: присоединение трех ионов магния; полное изменение конформации гексамера в присутствии L-гистидина и ионов магния.
Step D: распознавание специфической РНК-последовательности в зоне терминации и формирование антитерминационного комплекса; конформационные изменения молекулы РНК.
Название белка
Сокращенное: HutP_BACSU
Полное английское: hut operon positive regulatory protein of Bacillus subtilis
Полное русское: белок-позитивный регулятор гистидинового оперона сенной палочки
Идентификаторы
Uniprot ID: HUTP_BACSU
Uniprot AC: P10943
PDB ID: 1WPV
English Version
Просмотр английской версии статьи.
Смотреть в 3D
Просмотр структуры белка 1WPV в 3D-версии.
Источники
© Eugenia Prokhorova 2011